Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP011304_22                                                                                                                 top


Strain : Microcystis aeruginosa NIES-2549 GCF_000981785 RefSeq :NZ_CP011304 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP011304_22
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACNumber of repetitions :10
Begin Position : 3608265 End Position : 3608953

3608265GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTTGCCCACTGACGCACAAAAGCAATTAAACAA3608335
3608336GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTTCGCTTGATTGGTACTCCAGACAAGGAAAAT3608405
3608406GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTTGGTGTTGCAAGAGTGTCCAGATTTGGTACGCCG3608478
3608479GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTGGTATGTGAGCATTACCCATGATCAGGATTC3608548
3608549GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGAACAAAATATTGTCTATTCTATTACGAGAATAG3608620
3608621GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGTGCGATTGTGGTGGTCGGTGTTGCTGCAGTGTGGA3608695
3608696GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAATGTCAATATCTCTGGAAGTTGGCAAAATAAG3608766
3608767GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTTTTTCGCCATTGTCACGTCTTACACAGTCGAT3608837
3608838GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTATCAGTAATTAACCCATTTAGGAGTACCAAAAAATGACT3608916
3608917GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC3608953
Left flanking sequence : Till position 3608265 (length bp)
GGTCATATATGGTAAATATGACTTATCTTTTTTTGGAGTCTGTGTCTGTATTTTATGCTACATAAGCTTT
TCAGCTTGCTTGTCCCCCTGTCAGATCCAT
Right flanking sequence : From position 3608953 (length bp)
ATCTATTGTCCCTTAGCTAATTAGGGTTTGCTGAATAATGGTAAAAACCTTACAGGAAAGGGCTTTTAGC
TTGATTGAGAGCTTCCCAAATGCACTTAAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp