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CRISPRs details
NZ_CP012172_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP012172_3                                                                                                                 
top
Strain :
Metallosphaera sedula ARS50-1 GCF_001266655
RefSeq :
NZ_CP012172 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP012172_3
DR consensus (24 bp) :
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
56
Begin Position :
1097329
End Position :
1100891
1097329
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAGGCGAAATGCAGAAGATGTAGTAGCAAAGACAGCTGTGA
1097393
1097394
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CAACTCTCATGATTATAATCCCTCCATTTTAAAATGTATT
1097457
1097458
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAGTTTACTTCAGTTAATGAGCAAGTCAGCGCAGTGCTAA
1097521
1097522
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTATATTTACGGGTAAGACGGCGTTAACGAAGCGTTAGG
1097584
1097585
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AGTTTAAACGTTACAACTCTCGTTTCCAAACACCTCGTTTGT
1097650
1097651
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAAACGAGACCTTTGGCTAAATAAACCGCACCATAGATAT
1097714
1097715
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTATGAAATTGTCGCATTCGTATGCAAAATATTTCTGGATCT
1097780
1097781
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TACATATCCTTCAATTGTGATCTAGCGTATGCTGGTAGT
1097843
1097844
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATTTGGATTTTGATAATTTTCTTTTCTTTGTCATAATAAT
1097907
1097908
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TATAGTTAAGTCATTTTTTCTTCTTGTGGTGGTATTACCTAT
1097973
1097974
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TACCAATTTCTGCTAATAACGTGAACGTACTCTCGCTGAG
1098037
1098038
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAACTTATCCCCTACATGATTGCGAAAAAACAACAAT
1098098
1098099
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TGTTTTTAAGGACCTGGAGGCAGTCCGCCATTTACCCCAC
1098162
1098163
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TGAGAACAGCTGTCTTCACTGCTGACCATCGAGCGACCT
1098225
1098226
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTTTCTTTCTCATACATTACTCTTATTAGTTTACTAACAA
1098289
1098290
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTTCTTGTTCTTCTCTCTGCTTTACGCCTTCTTGTTCTTCC
1098354
1098355
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTGTACGTGGGTCAATAAATGTCACAATCGCGTACTTCTT
1098419
1098420
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATAATAATCAACGAGGCAAACTCCATGTTCTACAAACCA
1098482
1098483
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACTAGGCAAACGATACTGAGACACAGCGGGACTGCAG
1098543
1098544
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTGGAAACACTCCGTATCAATCCTTTAGACTGCAACTCCTCA
1098609
1098610
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AACATTAGTGTAAAGCCTGCAGCGTTTGCTGGAAGCACGG
1098673
1098674
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTCGTCCTTAAATTTCAAAACTTCCATGTAGCTCGCCCCCTCT
1098741
1098742
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTTATGTACACACCACCTGAGCTAAGGAGTGTCTTAATCT
1098805
1098806
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAATGGGACGATGAGGGTGTTCAACAGATACAACACCACAG
1098870
1098871
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATTATATATAATATATGAATAATAGCCCCCGTGCTTCGCGCCTT
1098938
1098939
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTTTTGCACTATCCATTCCGACCACATCTCTCGGCTTCGATAC
1099006
1099007
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTGACGACGTGCTTACTCTTCTTTCCAGTTCTTGTTACTT
1099070
1099071
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTATCGATAAAATCGTAAACGATTTGTTGCCTTATTACGTGAA
1099137
1099138
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACACCTCTACTAACTTTACCAAAGCCTATCATAGTCCCAACG
1099203
1099204
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CCTTTATTCTTGCTATTAGATCGAATAAATCGCTCGCG
1099265
1099266
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAAGTGGACACTATTGATCACCTCAGGGCTAGATATATGCCT
1099331
1099332
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCATTGAAATACTCAGCAACTGTATCCCTTAACTCTTCCTTATTA
1099400
1099401
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AGTATACCTGGGAGTGCTGATGTAGATGCGTCACCGACCACGTT
1099468
1099469
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACTACGGGTCTCAAGGTAGTCGGTGTTCTTCTAGTAGCTG
1099532
1099533
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATCGTACTTTGCGCTGTACCTTATGAACAGTGGAATGTCCC
1099597
1099598
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
GTAAAGGGGTTGTGTTTTACGTTTTGAGTGGTGTTTACGAC
1099662
1099663
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTAAACATATATGAGTTCATTTTTTCCGACTTTCCTAGA
1099725
1099726
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAAAGTGATAGAATAAAAGCTATTATTCCAACTATTTCT
1099788
1099789
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
CCTTGGCAACTCGGACCCCCTCAAGCGTACGGAAGAGATT
1099852
1099853
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AAACTCTCGATCAAGACATTTATTGTCTCTTCATCTATCT
1099916
1099917
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TCTAAGGAGGATAAAGAGGAAGATTGGGCATTTTGTTCTGT
1099981
1099982
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TTAGTGTTTACGTATGCTCTTTGTTGAGCTAGTTGTTGAT
1100045
1100046
CTTAATCTCCTATGGAGTTTTCAC
GAGGATGATTATAAGCTCAGGGAGAAGATTGT
1100101
1100102
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
ACGTAACCTGTAGATGTGTAACCAGGCTCAGACGAGAA
1100163
1100164
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GAACATCCGCCTTATCGTTATCTTTCTTCTTGAACAGGAAC
1100228
1100229
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TCAATTTATCATACCTACCTAGTCTTACTAAAGTACAGT
1100291
1100292
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GTTGGACTACCTGAAGTAATCGAGCTCAGTGGAGGCA
1100352
1100353
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GTTTTCACGTGATACTTTATGATGTCGTTGCATCTATCGA
1100416
1100417
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGGACATAAGGCCTTGGCCATGGTCTCAATATCCCATTCTT
1100481
1100482
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GCACTGACGTTTACTATCTGCAGCCCACTTGGTGACTG
1100543
1100544
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAT
ACACTGCCTTGATGAGCGGGATGCTTCCAATTCTCCCTCT
1100607
1100608
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGGATTCTTCTAAATGCTGTGACAAATGTTAGAATTAGATA
1100672
1100673
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
CAACGAAGAAAGAGTCGAGAAACTAAGCAGAGTCGAGCACT
1100737
1100738
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TATTCGTCGTACGATTCCACTTCAACAGAGTTCACAATAA
1100801
1100802
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGTTGCTCTAGCAGGAGAAGATCCTGCTCTTCGATTTTGAAT
1100867
1100868
GTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
1100891
Left flanking sequence : Till position 1097329 (length
bp)
GATTTCATGACTTGGGATAAAAATTGATGATCGTAAGAAGAGAAAAGTATATAAGTTGGGGAGAAAATGG
TAGATGTGTTGAAGAACACAAAAAGTTTCA
Right flanking sequence : From position 1100891 (length
bp)
ATTACACTAAATACTACGTAATATGAATAGGTACTGTGAGACGAGAGTGGACTTTTACCTTTGCGGACGG
TGTTAAATTTCAGAATCAGTATCCTCTACT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp