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CRISPRs details
NZ_CP012173_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP012173_3                                                                                                                 
top
Strain :
Metallosphaera sedula ARS50-2 GCF_001266675
RefSeq :
NZ_CP012173 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP012173_3
DR consensus (24 bp) :
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
56
Begin Position :
1097325
End Position :
1100887
1097325
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAGGCGAAATGCAGAAGATGTAGTAGCAAAGACAGCTGTGA
1097389
1097390
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CAACTCTCATGATTATAATCCCTCCATTTTAAAATGTATT
1097453
1097454
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAGTTTACTTCAGTTAATGAGCAAGTCAGCGCAGTGCTAA
1097517
1097518
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTATATTTACGGGTAAGACGGCGTTAACGAAGCGTTAGG
1097580
1097581
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AGTTTAAACGTTACAACTCTCGTTTCCAAACACCTCGTTTGT
1097646
1097647
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAAACGAGACCTTTGGCTAAATAAACCGCACCATAGATAT
1097710
1097711
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTATGAAATTGTCGCATTCGTATGCAAAATATTTCTGGATCT
1097776
1097777
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TACATATCCTTCAATTGTGATCTAGCGTATGCTGGTAGT
1097839
1097840
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATTTGGATTTTGATAATTTTCTTTTCTTTGTCATAATAAT
1097903
1097904
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TATAGTTAAGTCATTTTTTCTTCTTGTGGTGGTATTACCTAT
1097969
1097970
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TACCAATTTCTGCTAATAACGTGAACGTACTCTCGCTGAG
1098033
1098034
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAACTTATCCCCTACATGATTGCGAAAAAACAACAAT
1098094
1098095
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TGTTTTTAAGGACCTGGAGGCAGTCCGCCATTTACCCCAC
1098158
1098159
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TGAGAACAGCTGTCTTCACTGCTGACCATCGAGCGACCT
1098221
1098222
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTTTCTTTCTCATACATTACTCTTATTAGTTTACTAACAA
1098285
1098286
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTTCTTGTTCTTCTCTCTGCTTTACGCCTTCTTGTTCTTCC
1098350
1098351
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTGTACGTGGGTCAATAAATGTCACAATCGCGTACTTCTT
1098415
1098416
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATAATAATCAACGAGGCAAACTCCATGTTCTACAAACCA
1098478
1098479
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACTAGGCAAACGATACTGAGACACAGCGGGACTGCAG
1098539
1098540
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTGGAAACACTCCGTATCAATCCTTTAGACTGCAACTCCTCA
1098605
1098606
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AACATTAGTGTAAAGCCTGCAGCGTTTGCTGGAAGCACGG
1098669
1098670
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTCGTCCTTAAATTTCAAAACTTCCATGTAGCTCGCCCCCTCT
1098737
1098738
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTTATGTACACACCACCTGAGCTAAGGAGTGTCTTAATCT
1098801
1098802
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAATGGGACGATGAGGGTGTTCAACAGATACAACACCACAG
1098866
1098867
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATTATATATAATATATGAATAATAGCCCCCGTGCTTCGCGCCTT
1098934
1098935
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTTTTGCACTATCCATTCCGACCACATCTCTCGGCTTCGATAC
1099002
1099003
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTGACGACGTGCTTACTCTTCTTTCCAGTTCTTGTTACTT
1099066
1099067
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTATCGATAAAATCGTAAACGATTTGTTGCCTTATTACGTGAA
1099133
1099134
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACACCTCTACTAACTTTACCAAAGCCTATCATAGTCCCAACG
1099199
1099200
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CCTTTATTCTTGCTATTAGATCGAATAAATCGCTCGCG
1099261
1099262
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAAGTGGACACTATTGATCACCTCAGGGCTAGATATATGCCT
1099327
1099328
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCATTGAAATACTCAGCAACTGTATCCCTTAACTCTTCCTTATTA
1099396
1099397
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AGTATACCTGGGAGTGCTGATGTAGATGCGTCACCGACCACGTT
1099464
1099465
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACTACGGGTCTCAAGGTAGTCGGTGTTCTTCTAGTAGCTG
1099528
1099529
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATCGTACTTTGCGCTGTACCTTATGAACAGTGGAATGTCCC
1099593
1099594
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
GTAAAGGGGTTGTGTTTTACGTTTTGAGTGGTGTTTACGAC
1099658
1099659
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTAAACATATATGAGTTCATTTTTTCCGACTTTCCTAGA
1099721
1099722
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAAAGTGATAGAATAAAAGCTATTATTCCAACTATTTCT
1099784
1099785
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
CCTTGGCAACTCGGACCCCCTCAAGCGTACGGAAGAGATT
1099848
1099849
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AAACTCTCGATCAAGACATTTATTGTCTCTTCATCTATCT
1099912
1099913
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TCTAAGGAGGATAAAGAGGAAGATTGGGCATTTTGTTCTGT
1099977
1099978
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TTAGTGTTTACGTATGCTCTTTGTTGAGCTAGTTGTTGAT
1100041
1100042
CTTAATCTCCTATGGAGTTTTCAC
GAGGATGATTATAAGCTCAGGGAGAAGATTGT
1100097
1100098
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
ACGTAACCTGTAGATGTGTAACCAGGCTCAGACGAGAA
1100159
1100160
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GAACATCCGCCTTATCGTTATCTTTCTTCTTGAACAGGAAC
1100224
1100225
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TCAATTTATCATACCTACCTAGTCTTACTAAAGTACAGT
1100287
1100288
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GTTGGACTACCTGAAGTAATCGAGCTCAGTGGAGGCA
1100348
1100349
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GTTTTCACGTGATACTTTATGATGTCGTTGCATCTATCGA
1100412
1100413
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGGACATAAGGCCTTGGCCATGGTCTCAATATCCCATTCTT
1100477
1100478
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GCACTGACGTTTACTATCTGCAGCCCACTTGGTGACTG
1100539
1100540
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAT
ACACTGCCTTGATGAGCGGGATGCTTCCAATTCTCCCTCT
1100603
1100604
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGGATTCTTCTAAATGCTGTGACAAATGTTAGAATTAGATA
1100668
1100669
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
CAACGAAGAAAGAGTCGAGAAACTAAGCAGAGTCGAGCACT
1100733
1100734
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TATTCGTCGTACGATTCCACTTCAACAGAGTTCACAATAA
1100797
1100798
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGTTGCTCTAGCAGGAGAAGATCCTGCTCTTCGATTTTGAAT
1100863
1100864
GTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
1100887
Left flanking sequence : Till position 1097325 (length
bp)
GATTTCATGACTTGGGATAAAAATTGATGATCGTAAGAAGAGAAAAGTATATAAGTTGGGGAGAAAATGG
TAGATGTGTTGAAGAACACAAAAAGTTTCA
Right flanking sequence : From position 1100887 (length
bp)
ATTACACTAAATACTACGTAATATGAATAGGTACTGTGAGACGAGAGTGGACTTTTACCTTTGCGGACGG
TGTTAAATTTCAGAATCAGTATCCTCTACT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp