Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP012369_3                                                                                                                 top


Strain : Moorella thermoacetica GCF_001267405 RefSeq :NZ_CP012369 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP012369_3
DR consensus (29 bp) : GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACNumber of repetitions :41
Begin Position : 1667560 End Position : 1670187

1667560GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGATCACTCTGCCAGGTGGCCGTGGATAGTTTTGATCAACTGCC1667625
1667626GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGTAGTTGGACTTTTATGCGCAGCAAGGCCCCCGGTA1667691
1667692GTTCAAATTCCTCTATGGTCAATGGTCACCCAGTTTTTGCCGATGAGGACCTGGGATTGCTTCAG1667756
1667757GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAAATGGCCGTAAAACTGAAAGAGGCGGGATTAAAA1667820
1667821GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTAATATTCCAGTGCTTTTTAACCTATTATATCTAA1667885
1667886GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGTGCAGTTACCCAAATACCGCATTACGGTGAGCCAG1667950
1667951GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAGTTTAATTCCTCTACAGGGAAGGTTACTGTTATGA1668015
1668016GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTCACCCAGGGAACGTGATGCCTGGGTGGCTCAATGTA1668081
1668082GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGGTACCCCGGTGGCGTATGGAGCGGCTTGGGACG1668145
1668146GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACACTCAACGGGTTTGAAAAGTACCTCTACATGAGCG1668209
1668210GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGAGATTTGCCGGCAGAAATATTTTATTCCCTGCCCGAA1668276
1668277GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGAAGACGCCTGCCGCCTGGACCACCTGGACGAAAAG1668342
1668343GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAATAAAGACCTTCTCCGAATTCAAGCGATCTGGTAG1668407
1668408GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGGTGGGAATGTTGAGAGAAGAGCTCCGAGAGCTTG1668472
1668473GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTTTATGAATTTCGGCTCTCCGCCTACGCCCCGTAA1668537
1668538GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGGTTGTCGCCCCGACTGGAAACCTCGGTGAGTAA1668601
1668602GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTCTTCATATTGCCTTCAGGGTCATCAGTAAAAGGA1668665
1668666GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCCTGTCACGGAAGAAACCACCTGGCTCCGAGCCGGA1668731
1668732GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTAAAATGCTTGATGCGGATTTAATTGATGTTTATA1668795
1668796GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGCAAAAAGAAAACCGGCTTATTTGTCGCCGGTTTCTT1668861
1668862GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTCTTCGTAAATCGACTTCTTTTGCTTGATATGCCGCA1668927
1668928GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTGCCGTACTCTTCTTCACCATGCCAGACGATCCATT1668992
1668993GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTTCGGCCCACGGCACGGAAACTTATGCTTATAAACC1669058
1669059GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCGGAAGGGGACAAACACTTTGTGCCCCTTAACA1669121
1669122GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTGGCACACTCGCGGCACTCATTCCGCGTTATCGGG1669185
1669186GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGCTTCGACGGTTTACGGGGCTATTCCGTCATCGCTA1669250
1669251GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTGCTACGTCCAGCTTCAATATCCGCTATAAAAGAA1669314
1669315GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTTGAACACGGTCGATGCAATCCATCCATTGAAAAGCT1669380
1669381GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAAACAGGATCGGCCAGCAGCCGTTCTTCCTGGGGAT1669445
1669446GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCGGAGCAGGCTAACGGACCGGTAAAGACGACCC1669508
1669509GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTCTTTTGCCCCATTTACAAATACAGCAATCTCCGA1669573
1669574GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTGCCGTGGGGATGGTCAGGGTTTCGGGAGAGCGGG1669638
1669639GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGCTACTGGCGTAGAGAATTGACTTCAGGCGGTCGA1669703
1669704GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCTGATACCACCGCGGCCAATGACCTTCGGGTAAGTA1669769
1669770GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGTCGCCATTGCCTGCGGGGCTGTTGATAAGCTTAAA1669835
1669836GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTTCGACGGGCAGAAAACTCAAGGGCGCAAGGGCAAA1669900
1669901GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGGTGCTAGACCCGCAGGAGGGGACGGTGGAGTTT1669964
1669965GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACACGTAGAGCATAACGTCGAGACTTTGAAAATCTCCC1670029
1670030GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGCTGGCCGAAAAGGAAGGAATAATTGTAGATTAT1670093
1670094GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAATCTGCTGTTGATTATAGTACTACTTTTACCGCAG1670158
1670159GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC1670187
Left flanking sequence : Till position 1667560 (length bp)
TATACGTCGCACCATTTCTTGCTGAAAAACTTGCAACCGGGTACCCAGCCCGATTACTACTCCACCTTTG
ACGTTATCACCAGATTTTTATCTCCACCCT
Right flanking sequence : From position 1670187 (length bp)
CGCAGATGAAAGGCTTGTCCCGACAGGGATTTTAGCAATTTTTTAAAAGCCCCTGCGTCAAACCGCCAGT
TTGCACTTACACTACAGGAAATTATCTGTA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp