Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP012375_20                                                                                                                 top


Strain : Microcystis aeruginosa NIES-2481 GCF_001704955 RefSeq :NZ_CP012375 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP012375_20
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACNumber of repetitions :79
Begin Position : 3602218 End Position : 3607858

3602218GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAATTCAGGGTATTTTGGCTTAAATCCCCAAAATT3602289
3602290GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAGGGTGTAAAGAGTCGATACATAGCACATATCCC3602361
3602362GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACGGTTCAACCGACCTAAAACAACTATTAGCAGGGG3602434
3602435GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTTTTCGGCTATTTTTAGCCCAATTCTGTAGGA3602505
3602506GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGTGGAATTAATGCTTAAAAATACTGCTGAATTG3602577
3602578GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGGTAACTGACTAGGGACGGTATCAGGCGAATTA3602648
3602649GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGGAACACTCAAGGATGCCCTAATCTCGTTGTTT3602720
3602721GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTATTTCTAGAGATTTTAGGGTAATTTCTAGGATCG3602792
3602793GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACCCCGCAGCACTCGGATCGATTTACGATTACCT3602863
3602864GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTGTATCGTGCCGTCGATTTCATCCCCATAGAT3602933
3602934GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCCGTTGCCAGTCAGGTCTGTCGCGCCTGAAACT3603004
3603005GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAATCAGCAAAGTGTTAAGGCTAGAATGGCGCGAT3603075
3603076GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTTGTTTTATTTGGTATCCACTCGATAATATCGTT3603147
3603148GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTTCTTTTTCTTTCGATTGGGGCCGGGAGTGTCTAG3603220
3603221GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCGGGACGGACGGTTATCTACTCAAGCTATCTAT3603291
3603292GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGATCGCCGCGTCGATCTTTTCCTCGAAGTTGGGC3603364
3603365GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGGATCCGAGTCGGTACGACTGCCAGAAAACTT3603435
3603436GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGTGAGGGTCATCCCTACTACGCGCCCGTTAAGGA3603507
3603508GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTGGGAAAATACCATTATGTTTGGTGATGAAGTCGATGG3603583
3603584GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTTGATACTGCAATTATACCTATTTGTGATTAT3603654
3603655GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTATAGACGTTCCGCGAATACTACTTTAGCCCGTG3603726
3603727GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAAGTCCATCAACACATATATGTGTTGATTTTCG3603797
3603798GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAAAGGCCAGGATTTTACCCTATCTGTACTCGAT3603868
3603869GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACTTTATACAAGATACTTATACATACTTTATACAA3603940
3603941GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGAGGGTCGCTGGTAATATAAAATAAATCCGT3604010
3604011GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATAATTTAGAAGACTCGATCGATATCCAATCGCT3604081
3604082GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATCTAACTGTGACACTTTGAGAATTGGCACTCGAT3604153
3604154GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGAATGATGATGCTTCTTTTCTGTTTTTAGCCTT3604225
3604226GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCAGGTCTAATAATTCAAGCCCTGTCTCGTTAAG3604295
3604296GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGAAAAAGGGGTGAACCCGAAGGTAACTCGTGGGATTTT3604370
3604371GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAACCTACTCTTTCCATATTTCTTCTCAAGCTGGT3604442
3604443GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGAATTTTTTCGAGATTGGGAGAAATAGGAAGT3604513
3604514GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTTCCTCTGATGAGGAAGCGGTGGTTTTTTATGA3604585
3604586GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCAGGATCAAAAGAATTGGGATTAAGATGTAAAA3604656
3604657GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATCAATCAAGAAACTCAAGAAAGCAATCAAGAAA3604727
3604728GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAGGTGAGATGCTGAAAAATAAACCCGTCTCTATCT3604800
3604801GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATTGTTCCCGTTGCCGGTCAAGTCTTTTGCCCCG3604871
3604872GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTGCTAATTTAGCGACTCCTTTAAATGGTATCGT3604942
3604943GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCGGTAGCAATTAGAACTTTACTAGAATCCTCTTTA3605014
3605015GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCAGTACACCGGCGATTATATCATTTACAGAATTGTC3605087
3605088GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGTACAAATAAAAGATTATGTAACTTTTATTAGT3605158
3605159GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCGTTTTTAACGGTTTTGGGTTTCGTATCCTGATCGA3605231
3605232GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAAAAAACCATTATTTAGAAGCAAGAAAAAATGCCT3605304
3605305GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTTTACCAGACCGGCATAATTCAAGGAATTGGC3605375
3605376GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATTGGGTGCGATACCCGTATCCTTGATAAATCGGTA3605448
3605449GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTACCCTGGAATCATCGGGATTTGAAATCAAAGGCGG3605521
3605522GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGGTTCAACCGACCTAAAACAACTATTAGCAGGGG3605592
3605593GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTGGATAGTTTACATCGCTTTTATCTATCAGAAA3605662
3605663GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATGGTGTTTTTTGTAGTCCATATTTTGATATTTCT3605734
3605735GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGAAAAAGAATTTGAGAGAAATAAGAGAAGATTTG3605805
3605806GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTATCAGAAAAACTGTTTTATCTGTTGCCACTAA3605876
3605877GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTGTATAGTGTCAAGAGTTTTATTCTAAGTAGTG3605947
3605948GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATTAATACTATCTTCTCTATTTCTTTTTGAATTTTGT3606021
3606022GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTGTTTTTTGCTTGCCAGACCTTAATGCAACTGT3606092
3606093GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTCATGGCACGTCAAACTATTTATTAAGCAATGA3606163
3606164GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTTATTAGATTTTTTTTGTGCTATCATAGTAGAAT3606235
3606236GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTCGCTGGTTTCCTTTAGTTTTTTGATGTTTTCC3606307
3606308GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCCCCCTTCCCCCTCCGGCCCGACCGGCGATCGA3606378
3606379GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGCATTAAAGGGGGATAAGGTTATCCCCCCAGCGA3606450
3606451GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATGGCGCGGCCGATGATGCTTTTTCCTTCCCCT3606520
3606521GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAACATAAAATTCCCATCGGTTCCATCTTCTACT3606591
3606592GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTATTCCCGTCGCTATGTGATTAAGAACAGTCCCTT3606663
3606664GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAATCAGGAAACTGTAGAGACTGACTCAATAGATG3606734
3606735GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCGAAAAAGAATTTGAGAGAAATAAAAGAAGATTTG3606807
3606808GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGCATTGACTCGATTTGTTCATACTTAAAATCG3606878
3606879GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTTTGATATTGAAAATAAGGATAATAATTGTTATCT3606952
3606953GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTCTGAAAGTCTTGCTAGAAGCAAGTTTCAAAAA3607023
3607024GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACGCTACCTACTGCATAACCCAGATACCCTAAA3607093
3607094GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCTCTTTATGAAGGGGAATCGGGCATCTTAATCAA3607165
3607166GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTTCCGTCCTCTACTGACTGTTTAAAAGTGTCACT3607237
3607238GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTGGAACGACCGATTACCTCTCTCTCATGAAACCTTACGGA3607315
3607316GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCCACTGATAACGATAGAATTAATATCATCTAAT3607386
3607387GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGCAATGGCTTTAATATGTGGGCATTCAAGCCG3607456
3607457GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGCGATCGCATGGCTGATCGTCTAAATCGGACTATT3607528
3607529GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTGCCCATCAAACATTGTTTGCTGGCGGTTTTATT3607599
3607600GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTCTCAGAATAATGTGGCGGGTGCGGTCAATCTTCTTCAAC3607676
3607677GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTGATAGTCTGATCCTGGTACAATATCATTAGTCAC3607749
3607750GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGTGACTAACGTGATTGCGTTAGGCAATGTCCCTT3607820
3607821GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC3607857
Left flanking sequence : Till position 3602218 (length bp)
TATTGTTTTATTGGTCAGCAATAATTGTCTGTTTTTTTTTAATTTTACATGACAAGTTCGGAAGAGCCAA
CATCTATTGATACTCCCGTCTCGATTACAG
Right flanking sequence : From position 3607858 (length bp)
GTAAAGCTGGTACAACCTTTTTTCGCTCGATCCATGTTCTGGGAGGGGGACAAGCCAGCTAGAAGGTAGA
TAGAGCAAGCGATATAGCTCTTTGTCCCTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp