CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP012375_20
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP012375_20                                                                                                                 
top
Strain :
Microcystis aeruginosa NIES-2481 GCF_001704955
RefSeq :
NZ_CP012375 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP012375_20
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
Number of repetitions :
79
Begin Position :
3602218
End Position :
3607858
3602218
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AAATTCAGGGTATTTTGGCTTAAATCCCCAAAATT
3602289
3602290
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TAGGGTGTAAAGAGTCGATACATAGCACATATCCC
3602361
3602362
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ACGGTTCAACCGACCTAAAACAACTATTAGCAGGGG
3602434
3602435
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GTTTTTCGGCTATTTTTAGCCCAATTCTGTAGGA
3602505
3602506
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AAGTGGAATTAATGCTTAAAAATACTGCTGAATTG
3602577
3602578
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AGGTAACTGACTAGGGACGGTATCAGGCGAATTA
3602648
3602649
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCGGAACACTCAAGGATGCCCTAATCTCGTTGTTT
3602720
3602721
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TATTTCTAGAGATTTTAGGGTAATTTCTAGGATCG
3602792
3602793
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ACCCCGCAGCACTCGGATCGATTTACGATTACCT
3602863
3602864
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CTGTATCGTGCCGTCGATTTCATCCCCATAGAT
3602933
3602934
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CCCGTTGCCAGTCAGGTCTGTCGCGCCTGAAACT
3603004
3603005
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AATCAGCAAAGTGTTAAGGCTAGAATGGCGCGAT
3603075
3603076
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CTTGTTTTATTTGGTATCCACTCGATAATATCGTT
3603147
3603148
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TTTCTTTTTCTTTCGATTGGGGCCGGGAGTGTCTAG
3603220
3603221
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CCGGGACGGACGGTTATCTACTCAAGCTATCTAT
3603291
3603292
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCGATCGCCGCGTCGATCTTTTCCTCGAAGTTGGGC
3603364
3603365
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCGGATCCGAGTCGGTACGACTGCCAGAAAACTT
3603435
3603436
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AGTGAGGGTCATCCCTACTACGCGCCCGTTAAGGA
3603507
3603508
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TTGGGAAAATACCATTATGTTTGGTGATGAAGTCGATGG
3603583
3603584
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GTTTGATACTGCAATTATACCTATTTGTGATTAT
3603654
3603655
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TTATAGACGTTCCGCGAATACTACTTTAGCCCGTG
3603726
3603727
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AAAGTCCATCAACACATATATGTGTTGATTTTCG
3603797
3603798
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AAAAGGCCAGGATTTTACCCTATCTGTACTCGAT
3603868
3603869
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ACTTTATACAAGATACTTATACATACTTTATACAA
3603940
3603941
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCGAGGGTCGCTGGTAATATAAAATAAATCCGT
3604010
3604011
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ATAATTTAGAAGACTCGATCGATATCCAATCGCT
3604081
3604082
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ATCTAACTGTGACACTTTGAGAATTGGCACTCGAT
3604153
3604154
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AAGAATGATGATGCTTCTTTTCTGTTTTTAGCCTT
3604225
3604226
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CAGGTCTAATAATTCAAGCCCTGTCTCGTTAAG
3604295
3604296
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GAAAAAGGGGTGAACCCGAAGGTAACTCGTGGGATTTT
3604370
3604371
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TAACCTACTCTTTCCATATTTCTTCTCAAGCTGGT
3604442
3604443
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AAGAATTTTTTCGAGATTGGGAGAAATAGGAAGT
3604513
3604514
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GTTTCCTCTGATGAGGAAGCGGTGGTTTTTTATGA
3604585
3604586
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCAGGATCAAAAGAATTGGGATTAAGATGTAAAA
3604656
3604657
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ATCAATCAAGAAACTCAAGAAAGCAATCAAGAAA
3604727
3604728
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TAGGTGAGATGCTGAAAAATAAACCCGTCTCTATCT
3604800
3604801
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ATTGTTCCCGTTGCCGGTCAAGTCTTTTGCCCCG
3604871
3604872
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CTGCTAATTTAGCGACTCCTTTAAATGGTATCGT
3604942
3604943
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CGGTAGCAATTAGAACTTTACTAGAATCCTCTTTA
3605014
3605015
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CAGTACACCGGCGATTATATCATTTACAGAATTGTC
3605087
3605088
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AGTACAAATAAAAGATTATGTAACTTTTATTAGT
3605158
3605159
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CGTTTTTAACGGTTTTGGGTTTCGTATCCTGATCGA
3605231
3605232
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TAAAAAACCATTATTTAGAAGCAAGAAAAAATGCCT
3605304
3605305
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CCTTTACCAGACCGGCATAATTCAAGGAATTGGC
3605375
3605376
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ATTGGGTGCGATACCCGTATCCTTGATAAATCGGTA
3605448
3605449
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TACCCTGGAATCATCGGGATTTGAAATCAAAGGCGG
3605521
3605522
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GGTTCAACCGACCTAAAACAACTATTAGCAGGGG
3605592
3605593
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TGGATAGTTTACATCGCTTTTATCTATCAGAAA
3605662
3605663
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ATGGTGTTTTTTGTAGTCCATATTTTGATATTTCT
3605734
3605735
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GAAAAAGAATTTGAGAGAAATAAGAGAAGATTTG
3605805
3605806
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CTATCAGAAAAACTGTTTTATCTGTTGCCACTAA
3605876
3605877
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TTGTATAGTGTCAAGAGTTTTATTCTAAGTAGTG
3605947
3605948
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ATTAATACTATCTTCTCTATTTCTTTTTGAATTTTGT
3606021
3606022
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CTGTTTTTTGCTTGCCAGACCTTAATGCAACTGT
3606092
3606093
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TTCATGGCACGTCAAACTATTTATTAAGCAATGA
3606163
3606164
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TTTATTAGATTTTTTTTGTGCTATCATAGTAGAAT
3606235
3606236
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CCTCGCTGGTTTCCTTTAGTTTTTTGATGTTTTCC
3606307
3606308
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
CCCCCCTTCCCCCTCCGGCCCGACCGGCGATCGA
3606378
3606379
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AGCATTAAAGGGGGATAAGGTTATCCCCCCAGCGA
3606450
3606451
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ATGGCGCGGCCGATGATGCTTTTTCCTTCCCCT
3606520
3606521
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TAACATAAAATTCCCATCGGTTCCATCTTCTACT
3606591
3606592
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TATTCCCGTCGCTATGTGATTAAGAACAGTCCCTT
3606663
3606664
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AATCAGGAAACTGTAGAGACTGACTCAATAGATG
3606734
3606735
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCGAAAAAGAATTTGAGAGAAATAAAAGAAGATTTG
3606807
3606808
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AAGCATTGACTCGATTTGTTCATACTTAAAATCG
3606878
3606879
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GTTTTGATATTGAAAATAAGGATAATAATTGTTATCT
3606952
3606953
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GTCTGAAAGTCTTGCTAGAAGCAAGTTTCAAAAA
3607023
3607024
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
ACGCTACCTACTGCATAACCCAGATACCCTAAA
3607093
3607094
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCTCTTTATGAAGGGGAATCGGGCATCTTAATCAA
3607165
3607166
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GTTCCGTCCTCTACTGACTGTTTAAAAGTGTCACT
3607237
3607238
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TTGGAACGACCGATTACCTCTCTCTCATGAAACCTTACGGA
3607315
3607316
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCCACTGATAACGATAGAATTAATATCATCTAAT
3607386
3607387
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
AGCAATGGCTTTAATATGTGGGCATTCAAGCCG
3607456
3607457
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GCGATCGCATGGCTGATCGTCTAAATCGGACTATT
3607528
3607529
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TGCCCATCAAACATTGTTTGCTGGCGGTTTTATT
3607599
3607600
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TCTCAGAATAATGTGGCGGGTGCGGTCAATCTTCTTCAAC
3607676
3607677
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
TTGATAGTCTGATCCTGGTACAATATCATTAGTCAC
3607749
3607750
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
GTGACTAACGTGATTGCGTTAGGCAATGTCCCTT
3607820
3607821
GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC
3607857
Left flanking sequence : Till position 3602218 (length
bp)
TATTGTTTTATTGGTCAGCAATAATTGTCTGTTTTTTTTTAATTTTACATGACAAGTTCGGAAGAGCCAA
CATCTATTGATACTCCCGTCTCGATTACAG
Right flanking sequence : From position 3607858 (length
bp)
GTAAAGCTGGTACAACCTTTTTTCGCTCGATCCATGTTCTGGGAGGGGGACAAGCCAGCTAGAAGGTAGA
TAGAGCAAGCGATATAGCTCTTTGTCCCTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp