Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP012716_3                                                                                                                 top


Strain : Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ChDC F316 GCF_001296165 RefSeq :NZ_CP012716 (chromosome linear)
CRISPR id : NZ_CP012716_3
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATNumber of repetitions :16
Begin Position : 1974514 End Position : 1975541

1974514TTTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATAAACAGGACGAGATTCTGTTGTTATCTTTGCTGCTTT1974580
1974581ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTCTTTCAGATTTTAATAAATCTATAAAGTCATCTTT1974646
1974647ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATAAGTTAAATGCTTGTTTAATTCTTCTTTTATGCCTTG1974713
1974714ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTTTATAAATCTTTCATAAGTCCAATTATTCACACTCAC1974781
1974782ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTCAAAATATAAAAGAGCAATTATTAGTGAAAAGAGATA1974849
1974850ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTGCTACATTATTTTGAGTATTTTTGTTATTAACACC1974915
1974916ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATAGAAAAATATAGAAAAGGTTCATATAAAAATGATGTA1974982
1974983ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTTGGAACAAGCTACCTAAAATACTTAATTTTTGAA1975047
1975048ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATAAGTTAAATGCTTGTTTAATTCTTCTTTTATGCCTTG1975114
1975115ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTAAAGATTTCAGAAGTTGAAAGAGTTATGTAATCATC1975181
1975182ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTATAAATGTATAGATGAAGATTGTAAATTTACTTTA1975247
1975248ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATAATCAAATTTTAATTTGATTAACAAGTTCCTTTGCTC1975314
1975315ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATAACACAAGCACAATCACGGCTAAATGTGTAACCTTG1975380
1975381ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTCAAATCTGGATTATATAACTTTTTCATCATTTGCT1975446
1975447ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAATTTTTAATTTATATACATCATTTTGAATTTTTTTTA1975511
1975512ATTTAAATTCTAATATAGAAATACATAAAT1975541
Left flanking sequence : Till position 1974514 (length bp)
AGTAACAGAAAAATTAAAAGGATTAACTCCTGCTTCTTACAGAAGTCAATCCTTATTAGTAAGTTAAATT
AAATTTGTCCGACTTTTTGGGGTCAGTACA
Right flanking sequence : From position 1975541 (length bp)
AGCTAGCTAAAAAAACTACTCCTACATAATACTTTTTTTATATCTTTTTGTCAATGTAAGTTTTTTTACT
AAAAAATAAAAAACTTTAATTTCTTACAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp