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CRISPRs details
NZ_CP017029_1
Flanking alignement tool
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NZ_CP017029_1                                                                                                                 
top
Strain :
Campylobacter jejuni subsp. jejuni 14980A GCF_001717625
RefSeq :
NZ_CP017029 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP017029_1
DR consensus (36 bp) :
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
Number of repetitions :
15
Begin Position :
1512756
End Position :
1513714
1512756
ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
TTTAAAGGAATTATACAAGGATACGCTGAT
1512821
1512822
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
GAAAGTAATTTATTTATAGATTTACCACGC
1512887
1512888
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
TGGTGTATCATCTCCAAACCAGTTCATAGG
1512953
1512954
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
AAGTTAGGATATAGTGAATTAGCTTTAATG
1513019
1513020
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
TTAATTAAAGGTTAAGTTTGATATGAAAAG
1513085
1513086
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
ATTGCAGATTTTATGGCTAGAAAAATGGCA
1513151
1513152
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
TAGTGGACGCTTTTGGTATAAATTTTGCA
1513216
1513217
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
GGATATATATGCACTGGGTCGGTTCCACAA
1513282
1513283
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
ATAGGTATGCCAGCTGGTATTCTTTCGCAA
1513348
1513349
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
ACAAAGACCTGTACTTCCATCATATTTAAA
1513414
1513415
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
ATATCCATCTTTCATATCTTTGATTTTAAT
1513480
1513481
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
AATTAAACGCTGAACTTATAATACTTTTTA
1513546
1513547
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
ATCGCTCCATTTTATAACGCAATCGGTTTT
1513612
1513613
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
TTGAAAACGATAATCTTGTGGAACTTTCAC
1513678
1513679
GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
1513714
Left flanking sequence : Till position 1512756 (length
bp)
TTTCGATTTTAATCAACCCTAAATTTCAATAAGTTTCAAATTCGCAACCTCCTTTTAGTGGAGTAATTAG
CCCTAGCGGAGTTTCAATCCACTAGGGTTT
Right flanking sequence : From position 1513714 (length
bp)
AGATATTTACCAGATAATGAAAATTTCGGGGTTTTTTCATGAAAAATAGCAAAAATTATGCTATAATCTC
ATAAGAAATTTAAAAAGGGACTAAAATAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp