Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP017237_2                                                                                                                 top


Strain : Moorella thermoacetica GCF_001874605 RefSeq :NZ_CP017237 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP017237_2
DR consensus (29 bp) : GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACNumber of repetitions :52
Begin Position : 1726151 End Position : 1729496

1726151GCTTACATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGCCGGGTGTGCTTAGCTGAGTTTACCCGGCATAGGAC1726216
1726217GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGTTTTTGGGGTGCGCGCGACATTGCGACATTTAATT1726281
1726282GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAATGTGTATTTTCCAGGTTGCTCATAAAATTCCTGA1726346
1726347GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCAACAAAGTCACCTCCAAAATTTTAACCCACAGTCC1726411
1726412GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGTTTTCACCATCATGGGTCATACTCTTTAACTCTTTAACAGAGTT1726485
1726486GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTAATTTGCAGTCCACTTCACCTACTTCACCGCTTTA1726550
1726551GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTTATTGTTTGCCGGGTGAACCCAGCAAAAAACTCAA1726615
1726616GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTAGTCTCCATTACTTTAGAGGCCTGGTAGTACCA1726678
1726679GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGTGCAGGAGATTGGCCCGTGTGGGCTAATCTTTTT1726743
1726744GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAGTAAAATCTTGGGATGCTTTTGACGCAATGTGTA1726807
1726808GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTATTTCCTCCCCGTTTTCGCCTTCAAGGGTAACATCA1726873
1726874GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGCGTCTGCCAACCTACCAACCCGGACCCGAAACTATC1726939
1726940GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCAGCTTACACCCGACAACCGGCTCCGGGACCATCACG1727005
1727006GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTGTGGCTAAGGCTATTAGGTATGCCTTTATATCTT1727069
1727070GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTCGCCGCCGCAAGGGAGGGTTTATAAGTGCAAGAA1727133
1727134GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCAAAAGATGAGCGCAAACTATCAAGTCATCACCT1727196
1727197GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTTCTGCCGCCCAAGCCAGCCAGCGAGGTTGTTCTT1727260
1727261GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCTTCATAGCGTCCACGATCTGCGCCCGGAACCCC1727324
1727325GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGATGACGACATTAGAAAGATTAGAGAACTGCTTTCGAC1727391
1727392GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGGCCGGCGCCGACACAAAAGCTATCCAAAAAATCA1727456
1727457GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGAGAGTTTCCGCGAATTTATAAAATCCGAGGACC1727520
1727521GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCGTCTCGCCGGTCTTCAGGTCAGCCAGGGCCTCCA1727585
1727586GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTTCATTCAGGGCTTTGAATCGATGCTTTCCCGTCTG1727650
1727651GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACATGCTATGAATAAGATTACTGATGCTTTTGTCAAG1727714
1727715GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACACTTAGTCATATTTTGAAAAACACTTTCCAGCCCGT1727779
1727780GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCACTATATTTCGACACCTGTTCGGTCATATTCATG1727843
1727844GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACATTTTCGCTAAGATTACTGGCCGCCTCCGGCTGTT1727907
1727908GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCATATTCATCAGGGCATTCTCGCTGATACATCTTCA1727972
1727973GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCATCTGCTAAATTCATTTTGACCTTCCTCCTTTTT1728036
1728037GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACGGACGAGCCAAAAGCAGTTGAGCTTGAGATACCGGCCC1728103
1728104GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACCGAATTTGCTAATCCGCTTCTGGGTGGTAAACTCCC1728168
1728169GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTAGCCCCACCCTTACCTTCAGGCGACGGCAGGCCCT1728233
1728234GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACATTCGACTTTTACTTCCTCCATAATGCCCTGACATTT1728299
1728300GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACCCCCCTTAAATAATGTTTTCCATTCTTGATGCCCC1728363
1728364GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTGTTATTTAACTGGTCATATACCTCTACCCAGATTGA1728429
1728430GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTCTGCAGGCGATTGCCCCCGAGCTTGAGGCTCGGTT1728494
1728495GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACGCCGAAACTGGTGTAACAGTACCCGACCTGTTCAAA1728559
1728560GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACCCGGGACATTGGCGGCTCGAGCGGCTAGCATTGCT1728623
1728624GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACCGAGGCAAAAACGACCAGCGAATGGCGCCGAAAGGAA1728689
1728690GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTTGCCACCGACCGCAAATGCGACCCCCCAAAATAAA1728754
1728755GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACGTGTAATCAGTTTGCTGCAATACTCTGGGGAAAGTCA1728820
1728821GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTACCTTCAGAGGGTCTATGCCCGGGGCGAGGTTGAT1728885
1728886GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACGCTATTGCGTCTCGTCATTGTTCATCACCTCCTTC1728949
1728950GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTCAACGTTAACGCCAATGCTTTTCAGGTAGGCTTTC1729014
1729015GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTACGTTAAGGGGCAGTCAATCAACGAAGGTGCCGTC1729079
1729080GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACGCCTGTTAAAAATCCTCTACTTAAATTCTACCACTG1729144
1729145GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTACTAGTTGCAACCCGCGATATGGCCCGGGAAGAA1729208
1729209GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACCATACACAATCCGCGCCTGGTCCCTTTTTGTAGCCG1729273
1729274GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACGGTCGTCGATGCCGTCTGTGAAGGTAAAATTATTTG1729338
1729339GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTACTTCCGGCCTAACGGGTTTGAGCTCTGTAAATGC1729403
1729404GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCACTTGCAGCATATACTCAGCAAAGGAGGTGGTTATTG1729467
1729468GTTCAAATTCCTCTAAGGTCGATGGTCAC1729496
Left flanking sequence : Till position 1726151 (length bp)
ACTCCTGCCGTGGTCTGCTTCTTTGCCTCCTCTTTGCCGGATGAATAATTAATATGGTTTATACCCCTGC
CTTAAAAGTGCTAGGTGGGAGTTATTTTAC
Right flanking sequence : From position 1729496 (length bp)
CGCAGATGAAAGGCTTGTCCCGGCAGGGATTTTAGCAATTTTTTAAAAGCCCCTGCGTCAAACCGCCAGT
TTGCAATTACACTACAGGAAATTATCTGTA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp