Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP019041_1                                                                                                                 top


Strain : Acinetobacter junii GCF_001941805 RefSeq :NZ_CP019041 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP019041_1
DR consensus (28 bp) : TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACNumber of repetitions :122
Begin Position : 2665411 End Position : 2672701

2665411TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACACGCTTACTTTTATTGGTCAATATTGCTTTAT2665470
2665471TTTCTAAATGGCGTGTGCCGCCATGAACATTCGCTAATAAAACCCATACCATGAATTGCT2665530
2665531TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTACTATACCCGCAGCACATCCCTGCGCTGTAA2665590
2665591TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATTCAGCTTTATTTTTGCCACCCGTTGAATCA2665650
2665651TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAATGTCGGAGGAAATTACAAAGTCGGGGTGAA2665710
2665711TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTATCGTTTTGCTTACTCACATCACCCCCGAAT2665770
2665771TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCCCACCCGACATGGCTTAACATTAGCCTGTAC2665830
2665831TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCTTTTAATTTGGTTTTGGATTCAGGTCAAACA2665890
2665891TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTAAATCGTTTTACCCACCCAATAACACTAGAT2665950
2665951TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTGAGGGTATTCGATTAAATGCTTATGACGAT2666010
2666011TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAAGATGCTCGTTTAGAAGCAACTCGCTTGCGT2666070
2666071TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTCTTGGTTCGGATGAAGATTGTGTGATTGAT2666130
2666131TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTGTGGCATCGGCGCACAAATTAAAACTTATC2666190
2666191TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATTGTTATGGCGAGAACTGTAAATGAATTGCA2666250
2666251TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACACACAACAAACAGGCTACTTATCTGCTGAGCA2666310
2666311TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACACCACCAAGCAAAAAACAAATTATTTCAAGTA2666370
2666371TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGCAGAATTATTTGTCTTACTCTCGCCCTACT2666430
2666431TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGTAGCTAAAATTTGGCTTCTCGCTCCTTCTT2666490
2666491TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCTCATTACCATGTCATGTGGTGGATTCCTAAA2666550
2666551TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATTAAGTGCTAAATGGCCCTTTCTCAAATATA2666610
2666611TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTTCTCAAAATCAGGCGATTGTACATCGTTAA2666670
2666671TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCGATGAACTTTTTAACTCGTTCTGCAGTGCAA2666730
2666731TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTCACTAGTAATTACTGTTGCTCGCTCTGATTG2666790
2666791TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATTCGCATGGATTCAGAACGCTTCCACACCAT2666850
2666851TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCCAATGTTGATGCAGTGAATCCAATTTCTATT2666910
2666911TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCTAACGTAGTCGATCATATTGTTCCGCATAGA2666970
2666971TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATAGATAGCCTGAATCAGTTTTAATCCTTAAA2667030
2667031TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTCCATTTGGTTCGGATGCTAAAGCCGTACTA2667090
2667091TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAAGTTTCAAAAGTTTTAAAGGCTGGTGCTGCT2667150
2667151TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATGATCTAATCACTTCAAATGATGCTCTCTAT2667210
2667211TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTTCTCAAAATCAGGCGATTGTACATCGTTAA2667270
2667271TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCGATGAACTTTTTAACTCGTTCTGCAGTGCAA2667330
2667331TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTCACTAGTAATTACTGTTGCTCGCTCTGATTG2667390
2667391TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATTCGCATGGATTCAGAACGCTTCCACACCAT2667450
2667451TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCCAATGTTGATGCAGTGAATCCAATTTCTATT2667510
2667511TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTACAGAGGAAATGCTAGGTTCAATTGCTCGAT2667570
2667571TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTTCTCAAAATCAGGCGATTGTACATCGTTAA2667630
2667631TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATCTCAGATGCGCGTAACATTGTATACATCAT2667690
2667691TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTGATCTAATCAATAAGGGTGTAGCTAGCAAA2667750
2667751TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATGAGCAATACTTCTTAAGGCGTCCTTGATAA2667810
2667811TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTCGCCCCCTTTCCAATTAATCGGGGCTTTTAT2667870
2667871TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACACTGAACAAGATCAAGAAAAGAAACTCTCACT2667930
2667931TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAATAAAATGTCGCGCATCCAAGTGGCGGAGGA2667990
2667991TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCTGCTCTCGTGTCCACGCTTGGCCGTTAATGA2668050
2668051TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTTAATATTTCTCGCAACGATGTACAACACAG2668110
2668111TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGATAAACAACAACTTGGTATTTATCTTCGGTA2668170
2668171TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTTAATATTTCTCGCAACGATGTACAACACAG2668230
2668231TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGATAAACAACAACTTGGTATTTATCTTCGGTA2668290
2668291TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTTAAAAATAAACTCGATGCTGTAGATCAATT2668350
2668351TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTAAGAGACCTGGAACCAGGGATAAAAACCCT2668410
2668411TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTAGTAATTTTTTCGGGCTGTGGTTGGCTGTTA2668470
2668471TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAGAATCCCATGATTGTCGACCTAACAACTCAC2668530
2668531TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAGATATTGCGTTCTACTGGAGTTACTTCTACA2668590
2668591TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGCATTGGCATTGCTCATAAGCGCAGCAGATAC2668650
2668651TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATATAGTGCATATATACAAGGGCTTCGAGTGT2668710
2668711TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTATTATTCACAACAAGAAATTAGAGAACTATT2668770
2668771TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATGATGTTTTATAGACAATTTGATTGTTAGCA2668830
2668831TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGTAAATAGTGATGTGTCTGTGTCTGGTCTAT2668890
2668891TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATTTCAAAATCATCACCCTTGTATTCCCTGTCA2668951
2668952TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTGACATTTTTCCATCGTTGTCGCAATACTCA2669011
2669012TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGCGCAAGAACTTTCGAGACAGCACCAACCGTA2669071
2669072TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACACATAGAGAGCCATCAACTGGGGCAGCCTTAA2669131
2669132TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAACAGCACCACGATTGACATATTTTTGTAGAC2669191
2669192TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAAGAAGTCATTGAATACACAAATGAAGTCTCT2669251
2669252TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGAGAAAGATACAGAAGTATCTGTGATGTCGTC2669311
2669312TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGCAGTAGAGCAATTGCTAGGCACTGTTGATTG2669371
2669372TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACACGTCAGCCAAGTAGCAAAAGTTCTAAGAGGT2669431
2669432TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCTACAACAACACTAGGCGGTTGGACTCTCGGT2669491
2669492TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTAAATCGGTTACTTGATTGGTTTCAGTATCA2669551
2669552TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTGGCTTGGCTTTACTGCTGGGATCGCTATTT2669611
2669612TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGTTGTCAATTTCCCCACGACATTAACTAACT2669671
2669672TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTATATACAGAATTACGAGTATATTACCATCG2669731
2669732TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCGCAAATGGTTATGTTGGGGAGTCCCATTATT2669791
2669792TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAAGAACTAGCAGGCGTACAAACTGCTGTTGTT2669851
2669852TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACACGTCATTTCATCGAGCGTGAATTGGGTGCTC2669911
2669912TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTGAGTTTTTTGACCTGAATAGATGGCAGTAA2669971
2669972TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGGAACGTGAAAGCGCCGTTATTGCCGCTGTTT2670031
2670032TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGATACAATGCTGCATGAGTCAGGCTTTGTATC2670091
2670092TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTAATTGGATTAATATTGTTACTCCGCTAATGT2670151
2670152TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAATTACACCGCGAAGAGCAGTTGTCACAGTAT2670211
2670212TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCGTCAGCAAGAATTTGTATTGCGCCTTTATGT2670271
2670272TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTGAACATGGCGCAAACAGCGCAATCTATACA2670331
2670332TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGAGCGGTGCATTCGCATTGCTCAAAGCTACAC2670391
2670392TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTATCCGTGGTGGGATGACAAGAACTACCGCAT2670451
2670452TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGGCTGCTTTCCAGCCCGACCAATGATCTCGAC2670511
2670512TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATCGCATCGTATGGCCGTAGGCTCACCAACAA2670571
2670572TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTATCAACCGTTGCAGCGCCGAGACTTCCGATT2670631
2670632TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTCATTGGCCGTCAGGCTGCGGTCATTGCATAC2670691
2670692TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAAGCAGCTCTATTAAAAATCATGCTGTCGTAA2670751
2670752TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTTAGGCGCTTGTTTCATAAAATTTCCTCGTA2670811
2670812TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGAAGCTCCTGCAGCGCCGTTTTAATTTGTTCA2670871
2670872TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCAAAGAATTCCTTAAACATGCTCACCTCATTC2670931
2670932TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGCATGAAGCGGCTAGAATCGTCTTCGCACTCA2670992
2670993TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCCTAACACGGCGGCAGTTGGAACAACTCCAGA2671052
2671053TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGAGGATGTGCCTGTATACATTGATGGTTATA2671112
2671113TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAAATAATCGTTTAGTCACCGTTCGTTGATTTC2671172
2671173TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAGTAAAACATGTTCGGTCATATCGCCGATGAT2671232
2671233TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGGTGAAAGAAAATGCAACAAGGTGAGTATGT2671292
2671293TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTCGGTACTGAATTAGAGAGCTTTGATGTTAAA2671352
2671353TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACATCATTCATGGCAATATTCTCGATTACCAACC2671412
2671413TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGCACCATTAGGCAATCTGAAAGCACCAACAA2671472
2671473TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAGGTTGCGCTAGTACAGGCTCTAAGAGTGCAT2671532
2671533TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTCCTCAACCTTCTCCACTCTTGAAAGGTTTGT2671592
2671593TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTAACTGATGAACCGCATCAATAATTTCATCTT2671652
2671653TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTCCAGATGGATCAGGTTCAACTGCCTATATC2671712
2671713TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTGTTGTTAGCTATTTAGCTACTCGTTGTTGAG2671772
2671773TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCAACTAATAGCGTATGCCCTGTCACTTTCACA2671832
2671833TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTATTAAAGCAGGTACAGGATGCTCCTGGAAT2671892
2671893TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTTGCAAAGGCTCTCAACAACTCCCCTTTGTC2671952
2671953TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTTTGATTGCTGCGATGGCCGTTTCTTCTGAAA2672012
2672013TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTCAACGAGGTTACAAACCAATGCGATCTGTGG2672073
2672074TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACCTGTGGTTCTACATACCATTCTGGCAATTGTT2672133
2672134TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTACTTCATCATAAATAATAATTGAGCCGTCA2672193
2672194TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAACATGGCAAAGGTCTGTGAAATCGTCAACGA2672253
2672254TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTCTAGCACGCATGCTTGATTGGTCAAAGGCTT2672313
2672314TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACAGCTTATCCAGTTCTAGCACGCATGCTTGATT2672373
2672374TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTAAAAAATACGTAGCTTGTCGGTGAGGTGCGA2672433
2672434TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTATTCGCTATGTACTGTCTTATTCGTGAAAAA2672493
2672494TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTAACACGTTTAAAACAAGGTGCTGTTGTTGC2672553
2672554TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACTAACCGCCCTACTTTCTCCACATTCCCATTGT2672613
2672614TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAACGTGAAACTGCATAAAGGGTTTTTCCTGCACCA2672673
2672674TTTCTAAATGGCGTATGCCGCCATGAAC2672701
Left flanking sequence : Till position 2665411 (length bp)
CTTATTAATTCTTAAAATAAATTCCGTAATGAACACACAGAACAAATGCCAATCAAGACCGTTACATTTC
TAAATGGCTCATATGAATAAATCACATGTA
Right flanking sequence : From position 2672701 (length bp)
TATAAAATTATAGTAAAAATATAAGTTACAACAAGTATTTATGATGGTTTTTTAGCAATTTACCCAATCA
AAAAACGACTTGATGTAACTTATTGATTTT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp