Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_LN614756_9                                                                                                                 top


Strain : Clostridioides difficile GCF_000953275 RefSeq :NZ_LN614756 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_LN614756_9
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :16
Begin Position : 1940781 End Position : 1941794

1940781GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAG1940847
1940848GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGG1940913
1940914GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAAT1940979
1940980GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATT1941044
1941045GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAG1941110
1941111GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCT1941175
1941176GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA1941240
1941241GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC1941307
1941308GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT1941372
1941373GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA1941438
1941439GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC1941502
1941503GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG1941568
1941569GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT1941633
1941634GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA1941699
1941700GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT1941765
1941766GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT1941794
Left flanking sequence : Till position 1940781 (length bp)
GGTGTGTGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1941794 (length bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTATCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTAGCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp