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CRISPRs details
NZ_LN614756_9
Flanking alignement tool
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NZ_LN614756_9                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile GCF_000953275
RefSeq :
NZ_LN614756 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_LN614756_9
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
16
Begin Position :
1940781
End Position :
1941794
1940781
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAG
1940847
1940848
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGG
1940913
1940914
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAAT
1940979
1940980
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATT
1941044
1941045
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
ATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAG
1941110
1941111
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCT
1941175
1941176
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA
1941240
1941241
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC
1941307
1941308
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT
1941372
1941373
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA
1941438
1941439
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC
1941502
1941503
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG
1941568
1941569
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT
1941633
1941634
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA
1941699
1941700
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT
1941765
1941766
GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
1941794
Left flanking sequence : Till position 1940781 (length
bp)
GGTGTGTGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1941794 (length
bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTATCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTAGCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp