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CRISPRs details
NZ_LN831027_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_LN831027_2                                                                                                                 
top
Strain :
Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum GCF_001457555
RefSeq :
NZ_LN831027 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_LN831027_2
DR consensus (30 bp) :
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
Number of repetitions :
30
Begin Position :
1026216
End Position :
1028166
1026216
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
AAGGCTTGAACACAGATTAACTAAGAAAATTATAAAAA
1026283
1026284
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
GGAGAGATAGTATTGACACATTAGGAGTTGAGGTA
1026348
1026349
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
AAATGGTATTTGTAAAGTTGATTTCTTTATACTCTTA
1026415
1026416
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
CAACTTTAAAAATTATTGGATGTAAGGAGTTGTATTC
1026482
1026483
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
TCTAATGCTAAACTGTTCTTTTTTAATGGATTTATTC
1026549
1026550
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
GATAAAGCTTTAATTTTAACAGCAGGAGTAGACATC
1026615
1026616
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
ATAGCTGATTGTTGAGCAAGTAACTCTTTTTCTTTTC
1026682
1026683
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
ACTTTCTTGGACTCAGTTACAACAAACTCTATTTTAA
1026749
1026750
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
TTCTTAAAAAATAATTCAGTCAAAAAATTTCTTTTTAC
1026817
1026818
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
TTTTATATCTTTTTTGCTTACTTGGATTCTTTTCTTT
1026884
1026885
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
CTGGTGATGGAATAACTAAAATTGTAGCTTTTAAG
1026949
1026950
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
TAAATAAAAATAAGCAACAAGAAAATTAAATCTTT
1027014
1027015
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
ACAATTAAAAAAATGTTTAGACTACTGCAAAGAGAAAG
1027082
1027083
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
ATTGCAGCTGAGGTAGTGGATAAGTCTATATTTAA
1027147
1027148
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
GCTCTTATTTTTTCTTCTTTTGTCATTTCTCTCA
1027211
1027212
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
TTGCTATTAAATATTTCTAAGCCCTTGCTTTTTCC
1027276
1027277
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
AAATATACGCCTAAACTCTCCATTTTTCCACCTTTT
1027342
1027343
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
GGTTTATATAATGTTTCTTCGACTCTTATATTTTCA
1027408
1027409
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
AGCTTAGAAAGCGAACTTCATATTCAACTGATTGG
1027473
1027474
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
CTTAATTGATTTACTCTCTCTTTTTCATTGATTTTTA
1027540
1027541
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
ATAAATATATGAATTGGGTGTATCAAGATATAGCAA
1027606
1027607
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
GTAATAATGTGTTTTGTAATATCATCAAATGTAGAA
1027672
1027673
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
CCCTTATAAGTAGCAAATTCTTTTGTAAAACTTTCT
1027738
1027739
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
AAGATAGATAAAATGTTGGAATTAGTAACTCAAAGA
1027804
1027805
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
AATGGAACAATATCAGGAAGGAGAGTAAGTAAGGA
1027869
1027870
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
AGTTCTGTTGCAGCTTTTATCTTTGCATAATCACTTA
1027936
1027937
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
GGAACTGCTGCTTTAGGTGTTAAACTTCCTTCATAA
1028002
1028003
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAT
GTTTTATATAGTGAGTTTGAGAGAGAGTTGACTGAA
1028068
1028069
ATTTATGTATTTCTATATTAGAATTTAAAG
TGAATTTCTTTAAAATTTAATGTATAATTCAAGTATCA
1028136
1028137
ATTTATGTATTTCTATATTAGAAAAAAATA
1028166
Left flanking sequence : Till position 1026216 (length
bp)
AAATTTAAGAAATTAAATTTTTTTATTTTTTACTAAAAAACTTATATTGACAAAAAGATATTAAAAAAGT
ATTATATGGGAGTAGTTTTTTTAGGTAGCT
Right flanking sequence : From position 1028166 (length
bp)
CAGAAGAAAGGGATTGAAAAATAAAGACTTAATGCTGTTATATAACAAAAGAATAAATAAAAAATTAAAA
GGATTAACTCTAGTTTTTTATATAAGTTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp