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CRISPRs details
NC_009515_2
Flanking alignement tool
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NC_009515_2                                                                                                                 
top
Strain :
Methanobrevibacter smithii ATCC 35061
RefSeq :
NC_009515 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009515_2
DR consensus (31 bp) :
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
Number of repetitions :
44
Begin Position :
152502
End Position :
155389
152502
ATTTAAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
AGTTGACCTAAGTTTATATAATTGTGCAAATCCAGC
152568
152569
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
AGATGATGTTTTATTGGAGAATGGATATGCAGTACA
152635
152636
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
CAGGTTATCATTTTCCATGATTACTTTATCATGTGTA
152703
152704
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ATTATATGATGCTGTAGACTTAAGATGACTTTCTTG
152770
152771
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ACTCACAAAAGAAACAGTGATCCTTATATTGCTCA
152836
152837
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TTGAATTAGAAATCACAGTTAAAGAAATACCTAC
152901
152902
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TCCTATTTTGGACAATTTTGTTTTAATACCATC
152965
152966
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ATCACCATCATACCATTTTCATTTATATGAATATT
153031
153032
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
CTACAAAAAACCATTCAAGCAATAAACCTGACTA
153096
153097
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TATCTAAATCATTCCTTTTATAAATCACTTCACTGAT
153164
153165
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
CTGTGTCGTTTAATAATAAATCATTTACGTAACTAA
153231
153232
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
CTAATACATCTGACATCATAAAAACACCTTTCATA
153297
153298
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
GACAGTTAAAACATTTGCCATTACAAATTATATATT
153364
153365
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
CCATACATTATCATACCAGTAAACCAATTTGG
153427
153428
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TTCCACACTATCAAATTTGTTGATTTTTTCCATTCT
153494
153495
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
AAAAGTATACAAATAATCTGAAAACCATGGGTTCTAT
153562
153563
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ATCTTCCTTTTTGATAACAAGATTTGTTTCCTCGT
153628
153629
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ACTGGTTTAAATGGTGCTGGAATATCTAATAATCCA
153695
153696
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
AATATATTTATATAGTAGACGGTATAAAGTAATATA
153762
153763
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TTTGATGTAGTTCTTCTTCAGTTATGTTGAATGTGT
153829
153830
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ACATTCACCAACCTCAATTTCCATTTCAATAGTTTT
153896
153897
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TGCTCCTGCAATCAAAATTAAAATCTTGTAAACTTC
153963
153964
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
CATCACGTCTTAACATTCTAATGTCATCTTCACTCCA
154031
154032
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TTACTAATATGGCCAATGGTGTTAAAAGTTTACAAG
154098
154099
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TTGTACATGCATTGTCCTGCATGTACTTTTAATGTT
154165
154166
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TTTAGTTTATGATACTATGACCAGTGAATCCGACAGA
154233
154234
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TAGTTGCAAAAGCTGTGGACACTGCAAGGTTAATTCT
154301
154302
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ACCTCCTTTGTAACCTACAGGGTCACGACTGCCAG
154367
154368
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TACTGAAAGGCATATCAGAATTAGTATCCAGTACAT
154434
154435
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
CAATACAGTTGCCTTCTACAATCCCGTTTTTAGTTG
154501
154502
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TAGGAAAAGCAATGGGAGCATTGTCTGATGTTAAT
154567
154568
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TGTATATGTGAATAATGCTTGTCCATTATTATTCG
154633
154634
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ATTCTAATTGCATTGCGTTAGGATAATCGCTAACCTGT
154702
154703
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TATTAATAAATCTTGTACTATTACTCATTGTCATAA
154769
154770
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TCTAAAATCAGTGTATCCTGGTTCTTCATAGTA
154833
154834
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
CAAAGGTATCTGTGATGGATTTACTAATCATTTCC
154899
154900
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
AGTTGCAGTAGTATAAGTAGAAGTTCCTTTATACGA
154966
154967
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TTGGTTACAAACAAGGTAAAGTTTTTCTACCTTT
155031
155032
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
TTTAGTAGTAGAAATAAGAAAAACTGAAAAAGTAAA
155098
155099
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ATTTAGATATTATGATGTTAATGCGGAAGTATGGTA
155165
155166
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ATTCCTGCATATAGTACAATTACTGGAGTTAA
155228
155229
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
ATCGCAGTGCTTGTAGCAATTATTGGTTTCGTAT
155293
155294
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
AAGTAGTGTTGAATTTACATGGTACAAGTAATAC
155358
155359
ATTTCAATCCTATTATAGTCTTATTTTTAAC
155389
Left flanking sequence : Till position 152502 (length
bp)
GTTTAAAAAAATAATGATAGTACAAAGTAAACATTTGATTATTTCAATTCATAGTGCATTATTTTAACTG
ATTACATCCAAGTTTTTAAAAGATATTAAG
Right flanking sequence : From position 155389 (length
bp)
AGGCCACATTTTTTCTCAAAACGGGCAAAACCAATTTATAATTTATTTATTCATGCACTTAAATTTGTTG
ATTATAAAAAATGTTTTTTATTTATATGTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp