CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_010723_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_010723_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43
RefSeq :
NC_010723 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010723_2
DR consensus (30 bp) :
GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT
Number of repetitions :
5
Begin Position :
1666820
End Position :
1667108
1666820
GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT
TCATCACATACGTTAAATATATTTTTAACTACCT
1666883
1666884
GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT
ACTTTAGTTCTAAATGTTTCGCTTGTTTTGTAGAA
1666948
1666949
GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT
GCTAATGAGATTCCAAGAGTTAACGATACATCTAA
1667013
1667014
GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT
ACTTATTTGTATGCCTTTATTTGGGATTGTAGATT
1667078
1667079
GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT
1667108
Left flanking sequence : Till position 1666820 (length
bp)
TATTGAAATTTCACAAACGGTTGGTAAAGTTTCCTTGAAACCTTGAAGTTTCAATGCCTTAGTGGTATTA
TTGATTTAAGAGAATGGCTATTTTACTGTG
Right flanking sequence : From position 1667108 (length
bp)
AGAGCATTAGATAGTATTTTTATTGCCTTTGGAGAAGGCTTAACATTAAAACATCCTTATAGCTATAACT
TAGTTTTGTAGCTATAAGGATGTTTTTTTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp