CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_011026_8
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_011026_8                                                                                                                 
top
Strain :
Chloroherpeton thalassium ATCC 35110
RefSeq :
NC_011026 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_011026_8
DR consensus (30 bp) :
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
Number of repetitions :
98
Begin Position :
2813147
End Position :
2819595
2813147
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGTTTTTTCCCAATAATTAAAACCTGATATATCCCA
2813212
2813213
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGTTTTTTCCCAATAATTAAAACCTGATATATCCCA
2813278
2813279
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AGCCATAGCACCTTGCAAAGTTGTAAAACCTCTAAC
2813344
2813345
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTCTCGGCCTGCTTGGCCTTGCCGGATACCGGACTT
2813410
2813411
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTTGGAAAAAGAAAGTTACTGAATACAGCTTGTTGGAT
2813478
2813479
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AAGCGCAGGGACGGAAAGATTAAATTCATGTTTTTTC
2813545
2813546
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CCTCCGATTCTTAATGAATACGAAGAATCTGTTAATC
2813612
2813613
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTTGTTTAATCGGCCAGCCTTCTTCCAATTCCTGATC
2813679
2813680
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TCATTCATCTTCTCAGTCAACTTCTCAATCTTCTAA
2813745
2813746
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CACTTGTGGTTAATGACTCTATCACGTCTGTGAA
2813809
2813810
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GGAATTTGGATTTAAAAACAGTTGCCATGTCATTATC
2813876
2813877
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AGTTGAAATACCTGTAATTTCAGGTAACAGTATTCG
2813942
2813943
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GAGCGAAATATGTACGAAATCTGGTATAAAGACAGA
2814008
2814009
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGGATAGTAAATATCTCGCACAAGGGAGTAAGT
2814071
2814072
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GGCTGTAAATAAAGCATTAATTGTATCAGGTGCGAG
2814137
2814138
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTAAAACTTTCATGTTGCTGCTAAAAAATAAGTTA
2814202
2814203
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TCTAAACACATTCTTACCATTTCCACCGCCGCCTTG
2814268
2814269
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGTTATTTGAAAGCGATTCAGTAGTGGTATCCAAAT
2814334
2814335
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CAAGTTATCAGATGCCGAAATCTGGGCTTATTTGA
2814399
2814400
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGTGCAATCTAAATCGTAATTTTTTTCTGCAAAAAC
2814465
2814466
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CGATTCCGGCGTATCCGAAAACGACTATTCGTTCATCA
2814533
2814534
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AAGCTCAATAAAAACAGCAGTTTCGGCTGCTGTAAAAAA
2814602
2814603
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
ACCAAGTTCGATCATGTATTTCTTAACCCATTCTT
2814667
2814668
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CTTTTCAACCTGTTATATGAAATCAAAGACGGCTTC
2814733
2814734
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CAAGCTAAATTAAGCAATTTGTTGTGCGAGTGTTTTT
2814800
2814801
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CCTTGAAGGTGTGCGCCTTGAAGGTCTGCCTCGCGA
2814866
2814867
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CTTTGCCCACTCGTGCCGGAGTCGACAGAAAACTTTG
2814933
2814934
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AAAATGACTTTATGAAAGAAAAGAGAATTTTCGTTT
2814999
2815000
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AATCAAAAACATTCGCCATTCGATTCGAGATTCGAG
2815065
2815066
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
ACTTGGGTCAATAGAACCGGCTCTTACCACCGCTT
2815130
2815131
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GTTCTTTGTTGTTGTTGTAGACAGCGCGAAAAATGT
2815196
2815197
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTTTCCGAGACAAACCAGAGCCGAAACCAGAGCCA
2815261
2815262
GGTTTCATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AAAGAGAAGAGAATTTTCGTTTTGGAATAAAAATTA
2815327
2815328
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TCAAATATTACTGACGTCTGGCAACACGGGCATCGCA
2815394
2815395
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GAGCGATAATTTGCGCGGGATTTGCCAAGTTTGGCG
2815460
2815461
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AAATTCAACTCTTTGTATCCTGACGTGCTTTCAAAAG
2815527
2815528
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AGTAACTTACACGATGTGAGCCTAAAACAACTTTAAA
2815594
2815595
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TAGAGCCTTTGAACAACCGGCCTCCGTGGAAAAGA
2815659
2815660
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTCCTCGTTCGTAGTCCCGAAAAAAACGCAGCTTCG
2815725
2815726
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TAGATCGCACGGTGTGCCCTGACGAGTACGAGGCTAT
2815792
2815793
GTTTTAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTCTCCGCGTCGGGCTTCTCCGCTGGCTTCTCCGCGT
2815859
2815860
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGTTTTGAATTTCATCCATATCAACAAAACAACTCG
2815925
2815926
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CGCTGTTATCGTCCGTGCTTCGCTAAGCCTGCCACTT
2815992
2815993
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTCGCCACATTCCAAAACAAAAACTCCCGAAGTAA
2816057
2816058
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CGCTGTTATCGTCCGTGCTTCGCTAAGCCTGCCACTT
2816124
2816125
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTTCCGTGCGAAGTTTTTACGCCGCCGCTGAACCGC
2816190
2816191
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CCTTGTTTTTCCAAGTGCTCCCGTTTATTTTTGTTTT
2816257
2816258
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CCAGTTTCGGAAGGTTGGGTGTTTCAGAAATCGAG
2816322
2816323
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGAAAGACATTTTTTGCTTGATAAAGTCTGTCGCAG
2816388
2816389
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CGACTTATCCACACTCACAATAGTAACTCGATTTT
2816453
2816454
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGACATAGAGATATTCCTTAAAGAACTCCCAAAAGG
2816519
2816520
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GCGTATTTCCTTTTTCGCGCTATCATATCCAGCGCTG
2816586
2816587
GTTTCAATTCCACATTGGTGTAATTAGATG
TTAATATCTATGAATGCAAAAGAAACAAAGCATTCAT
2816653
2816654
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CCGCGAGACCGTATCAGGAATTAAAAAAGCTGATGA
2816719
2816720
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AAAATGAGCAATCGGATGAAAATAATGAGCAGTCAT
2816785
2816786
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CTTGCTTCATAGAACTCATTGAGTATTCTATAAATAT
2816852
2816853
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TCTGAAGGGTTTTTGATTTCAGATAGTAGCGGAGAC
2816918
2816919
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AGCCATAGCACCTTGCAAAGTTGTAAAACCTCTAAC
2816984
2816985
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGGGAATATATCATCTTCAATCCTTGTGAGTTTTCC
2817050
2817051
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
ACTATTAGCGTAATCAAAAAAAAATAAAAAAACCCGC
2817117
2817118
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTAAACAGCTTGAAAAAAATGTGTTTTTAATTGAAGA
2817184
2817185
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TAAGTGGTGTAGAAGCAATGATAATTTTTTTATCAAA
2817251
2817252
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CCATCAATGTAAAATACTCGGTAGATACCGGAACGGT
2817318
2817319
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AGATTAGCCAACCCAACCATTATACCGGTTATGTTG
2817384
2817385
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AATGGAGAGATGATGTTTGCCGTACTTCCGACACC
2817449
2817450
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GGTGACGCTTTCACGCCTTAATGGAGTGAAGTCCAT
2817515
2817516
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CGGGAACCGGCCATTTTAAAAGATAGATTTCATA
2817579
2817580
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GTCTTTTTCGCAAGTGGAATTACCGCTTTCTGTAAA
2817645
2817646
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GTTCTTTGTTGTTGTTGTAGACAGCGCGAAAAATGT
2817711
2817712
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TCTCGCGGAACAGCGGAATGATTAGCGCTGCTGCTTC
2817778
2817779
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TCCGCTGTTCCGCGAGAAGCCCGCAGAGCCACCAG
2817843
2817844
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TCGAGCACAAATACATCTCTATGAAAATTCGCAAAA
2817909
2817910
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GAAGCCAAAAACGGGCTAACAAAGCGTGCAGCCGAC
2817975
2817976
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
ACGGACTACTACGCCCCCGAACTAAACGAAATCGG
2818040
2818041
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TAATTTCGCCACATTCCAAAACAAAAACGCCACGCG
2818106
2818107
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TGAAGCTTTTCGTCGACTTGATTGGGATGAATTGCCGA
2818174
2818175
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GTAGTCAATAACGACTACACCAACAAACAAAACAAA
2818240
2818241
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CGGGCATGAAGTGATGAGACGCGACAGCCCGGCCTTT
2818307
2818308
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTGGATG
GCAAAGATGACATTGGCGACGCCTGTAACAGCAGCTAT
2818375
2818376
GTTTCAATTCCACATTGGTGCGGTTAGATG
AATCGGAAAAGACGGTTATGTATATTATAGCGCAA
2818440
2818441
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GTATAGAGTTAGAAACGGTGGAACATTCAATCAGTC
2818506
2818507
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CGCTGGCGTGGATTATGCGCCGACGGCTGAGTATC
2818571
2818572
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GTTAAATATGCTTTTGACAAGATACTAAGCTATTTGG
2818638
2818639
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AAAGTCTTAATATGACTGATGCTGATGTATTAGAAAT
2818705
2818706
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
ACTCTGTTATTATACATACTCAAAGATATTTATAGA
2818771
2818772
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
ATGAAACCGAAGTTGAAACCATCCCGAACGCAAAAA
2818837
2818838
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
ATATCAAAAGAAAGAAAAGAAACCGAAATGGCAAAC
2818903
2818904
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CGTTGGCAGGTTCAGACTGACGAAGAAGTGAAAGAA
2818969
2818970
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TTCGCACAAGCTATTCTGCTGCTACCACTCCCCACG
2819035
2819036
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CACTCCTATTTTCTACCATTTCCCATTCACTTTAC
2819100
2819101
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
TCAAAATTATTTGTGACTACTTTCATATTTACTTTT
2819166
2819167
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CTGAATTTGCTAAAAAGGTACTGCGCTCCAATGCCAC
2819233
2819234
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
AAACGTGCGCGTGACGCGCAGAAGGGAAAATTAAAA
2819299
2819300
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CTGTTATCATCGCTGTTGCTTCAAAGCCTGCCACCTTT
2819367
2819368
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
GCACTTATCAACACACTTATCCACCGTTACTTCGT
2819432
2819433
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CTCTTATCATCGCTGTTGCTTCAAAGCCTGCCACCTTT
2819500
2819501
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
CAAGTTTTCAACACACTTATCCACCGTTACTTTGT
2819565
2819566
GTTTCAATTCCACATTGGTGCAATTAGATG
2819595
Left flanking sequence : Till position 2813147 (length
bp)
AAAAGCCGATAAAGCCTAAGCTTCGCTCAGGGACTACCCTAAGGCCTGATTCAGGAACGTTTTTTTGGAC
AGTTCAAAATCCAATAGAATTTCTATTAGA
Right flanking sequence : From position 2819595 (length
bp)
CCGTTACAAAAACGGCGATTTAGCTTCAAAAATGCGACTTTTTCACTGAAAAACAAACAAAAAAATCGTC
GCCCCTCGATAGCCGAAAACTTACAGAGGG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp