CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_013928_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_013928_2                                                                                                                 
top
Strain :
Streptococcus mutans NN2025
RefSeq :
NC_013928 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013928_2
DR consensus (36 bp) :
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
Number of repetitions :
70
Begin Position :
743991
End Position :
748582
743991
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CAAAAGGGTTTCTAATCCCATTCGAAAGCG
744056
744057
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GATTGTGCCCGCTAGTAAACCGCCTCGCGC
744122
744123
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CCAAGCTATGCAGTCACGCCTGACCCTGTG
744188
744189
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TAGAGTTGAAAAAAACACTACAGGCGAAAA
744254
744255
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TAATACTTCCTCAATTATAAATTCAATTCT
744320
744321
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GATTGTATCAGTAATCGAACTTCTGCTTAT
744386
744387
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GTTGCTTATGCAGATGATAACACAGGCGCA
744452
744453
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TGGTCCAAAGTGCAGAGCCAAAGAAAAACA
744518
744519
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
ATTGTCAATCGCCGTTCTGCGCTTGCGACG
744584
744585
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CTCTAGCGCTTATTTCGAGGACAGCGGAGC
744650
744651
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TCATTGCTCTTGACATCAATAACTTTTTCA
744716
744717
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GAGCAAAATCAACTATCTCAAAGCTTAGTT
744782
744783
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TGGCAATTTACCAGCACAGCAATTGCTGGC
744848
744849
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TTCGCGGTCTACTTTTTTTGATATGCTAAT
744914
744915
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AAAGAATAAGTTCTCTCACAATGTTTGAAA
744980
744981
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CAGGTTTCATCTTAGGAAACGTATTGATGA
745046
745047
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GCTTGAATATAATTGTGTATCCGCCAATGA
745112
745113
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
ACCTTGTGGTCCGTCTTCTCCGCCACTTTC
745178
745179
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CAAACGGCGGTTTGACTGACTCAGGAATTT
745244
745245
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GATTAAAAACATAGATGAAAACGGCTATTT
745310
745311
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
ATCCACAGGCACAGAATTAGTGTTAATCCA
745376
745377
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TTGACCGTGATAAAGTGTTCAACCACACGT
745442
745443
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AAAAAGAAACGCCTTTTGATTTGACCAATC
745508
745509
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CAATGCTAGTTAAGCTCTTGATGCTTTGAG
745574
745575
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CCACTCTTGCTCCTGATTGGTCAAATCAAA
745640
745641
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GTTCCATTGAACGCATTGATGGGAACAACA
745706
745707
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CGTTACTGGTGTTCACGGCGACAGCATGGA
745772
745773
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
ATGAAAAGCCTCGTTTCTAAGGCTTTTGGT
745838
745839
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AGTTATTAATATCTATGACAGTCTCAAAGA
745904
745905
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CGGATATAGCCTAGCATATAATCGCGTGTG
745970
745971
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TTCAATCGGTGATGATATTGTCTGCTATCA
746036
746037
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AATGTATGCACCGCGTTTTTTAACAAAATA
746102
746103
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GTTTGCTTTTGTTTTTGCCTTGTGTGTTTC
746168
746169
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
ATAAAGACGAATATAAAGACCCGAGCACTT
746234
746235
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TAGACACGGTTGCTAAAACAAAGAAGGTTA
746300
746301
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TAATATTATTGAGCAAAAATCCTTTAACTC
746366
746367
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TTCTGGCTGTCTTTCAGAGTGATAAGCGCA
746432
746433
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GTATCAATACAATCTTAGACGCTCGCACTG
746498
746499
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CGCCGGTTACAACCGGTTGAACGCCTGCGT
746564
746565
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TGCAAGTTATCTTGCTATGTGGACGAATTG
746630
746631
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TGACGGAAACAGAGACGGAACGGCAACTGT
746696
746697
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GCACTACAAGACGGCTATTGCTGATGAAGT
746762
746763
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GCAATTTAGTTTTATTCCGTGGGAGCAGCA
746828
746829
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CGATAAAATTTTGCTAACCCGGAAAGCGGTT
746895
746896
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AATTGTTACTCCCAACTTCAGCATTGACCA
746961
746962
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CTCTGCGCTTTGCACGAGCACAGCGATATC
747027
747028
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TGGCCATGACGATGACGGGACTAAGACTGT
747093
747094
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AGAGTATAGCCAGTGTTTTCAAGGCCTTTA
747159
747160
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CGCAACAATGACTATTAATATCAACGGTGG
747225
747226
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
ATCAAATTTCGCTTCTGGAGCAATCTCAAC
747291
747292
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AAGAACTCTTAGAAAATATGGTCCACTCAT
747357
747358
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CAGTATACGCCATATTCCATCAGGATGACT
747423
747424
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CGATAAAGCTACTGTAGCAATTAAAGGCTA
747489
747490
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TTTCTGTTTTAGCTGAGTTAAGTGCCTTCT
747555
747556
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TTAAAAAGCTGACAAAAGACAGCAATGAGA
747621
747622
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AATCGCTTCTTTGCTAACCACAATTTGTGC
747687
747688
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TTAAAAAGCTGACAAAAGACAGCAATGAGA
747753
747754
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TATATGTGATGGCAGTTGAAAACATACGTA
747819
747820
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TTGCAATTGAGGGCAAACGTAGTGAATTGC
747885
747886
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
AAATGCTCTTGAAGAACCTGATAGATGACA
747951
747952
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TCAGATAAAGATTTTTTTGGAAAGTACAAT
748017
748018
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TATTAAATTACTTGTAATTACAAAGCCTAA
748083
748084
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
ATTAGAGAGCAGATGCAATCACCCGTTATG
748149
748150
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TAGAGCTCTTAGTTTTTTACGCGTTGGGCC
748215
748216
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CAAATTTGCCGGCGGGGTCGGTAAAACGGTC
748282
748283
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
TGCAAAAGATGGCCTCGAGCAATTATCGCA
748348
748349
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
GAAAAGGAAAATCTTACTTAGCTCATGAGT
748414
748415
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CTGACCAAGAGAATTAATTCTAAAGATAAA
748480
748481
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
CTGACCAAGAGAATTAATTCTAAAGATAAA
748546
748547
GTTTTAGAGCTGTGTTGTTTCGAATGGTTCCAAAAC
748582
Left flanking sequence : Till position 743991 (length
bp)
AATTAATTAAAATCTTTTAAAAAGGAATTATTTGAAGCTGAATTCTAGCTGAGATGAATGGCGCGATTAC
GAAATGTCGTGACGAAAATTGGTCCACGAG
Right flanking sequence : From position 748582 (length
bp)
GGCACATATAATCCGTAAAGGCGGCACATGTTTTAGAGCCATGTTAGTTACTGATTTACTAAAACACATT
ATGCGAAAGATTTTTAAATAAGCAAAAGAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp