Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_014378_1                                                                                                                 top


Strain : Acetohalobium arabaticum DSM 5501 RefSeq :NC_014378 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014378_1
DR consensus (38 bp) : CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACGNumber of repetitions :8
Begin Position : 892812 End Position : 893359

892812CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACTTTATTTTTTTAAATTAATACCATTTTAGTGTTGACA 892885
892886CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACTGCTTGAACATCATCTTTAGATCATCTCTTTTCTTAA 892959
892960CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACGGAAGATTTTGGAGATGTCACATTCGAGGAACTGGT 893032
893033CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACGCTGCTAATAACTCACTCACATTATTCATCTCCTTC 893105
893106CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACGTACTGCTTTCTGCTGTGCAGCTTGGGCTTGTGC 893176
893177CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACCATCATTTGGAGATTCATGTGAATTAATTGTTAAAG 893249
893250CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAACAGGATAATATGCTTTCACTCGTTGCTTCGGGAGAG 893321
893322CTTTAAAGAACTATAATTTCGTTTAAGGAATTGAAGCT893359
Left flanking sequence : Till position 892812 (length bp)
TTAGTAAATATTGCAGCTTTAGAAGAGATATGCGTAAAATAAAGAGGTGCTCGGAAACTAAAGTTTAAGT
TCTTTGATACTAGGTTTGAGTAGGGACGCA
Right flanking sequence : From position 893359 (length bp)
AATATGATTAATTAAATGATAGAGGTGGTTTGAGATTTTAACTATAAAGTGTGCTAAATGCAAATCCAAG
ACAATGAATTTAGGAGGCTAAAAATGGCCC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp