Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_015172_3                                                                                                                 top


Strain : Syntrophobotulus glycolicus DSM 8271 RefSeq :NC_015172 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015172_3
DR consensus (30 bp) : CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGNumber of repetitions :25
Begin Position : 1392092 End Position : 1393715

1392092CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGAATAGCAAACTTACAGGTATTATTCTCTCGGCCGAC 1392157
1392158CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGTCTTTATGTTCACATTACACTGAAGAGTCCGTCTTG 1392223
1392224CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGTCAGCATAAATAACTAAATTATCCACGTTATCCTC 1392288
1392289CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGGCCTCCACATTGTACGCCTCCCCTACCTCCGAGGCC 1392354
1392355CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGGAGCCAGCATTGGGCCGCTTGTAATGCCGCCCGTGGCC 1392422
1392423CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGATCAACATCCTTGATAGAATCAATGACCAAGAAACTC 1392489
1392490CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGTTGATTGTCAATGTCGATACGGTATATATCCATACAG 1392556
1392557CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGTTGATTGTCAATGTCGATACGGTATATATCCATACAG 1392623
1392624CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGTTGATTGTCAATGTCGATACGGTATATATCCATACAG 1392690
1392691CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGTGGTTTCAAAGTACGAGAATAATATTCATACTCCCAA 1392757
1392758CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGGATTTTGATTTCATTATAGCATCGTTCCGTATAAAA 1392823
1392824CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGGGCCTGTCCCCGGAGATTGAAATTGATGTCGATGACAC 1392891
1392892CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGACTACTACTGAAGAAGCCTTAGCCATCTTTCCGGATT 1392958
1392959CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGTAAATTATGGCCGCGCCGTCAACCTTGAAATAGTATGA 1393026
1393027CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGTTCGCTGTTATCTATTCGCTTGCCGCGAAAAAGT 1393090
1393091CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAAGCCTGCTGAAGCTTATAGGCCATGATATATGACCAG 1393155
1393156CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAATTTTCTAACTCCAACGCCTGCTCATTGCCCTCGGCATC 1393222
1393223CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAATCGATCACATCAAGCACGGACTGACAGGTCTTATACC 1393288
1393289CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAATTAAGTTACTTATTGATAGTCAGTCTGAAATGGCAAG 1393354
1393355CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAATAGGTGATCAGCATCAAGGGTGATCAGGCTGCGGGTA 1393420
1393421CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAACGCAAATGTGAAATACTGTGTCCTTGATATCGACTGG 1393486
1393487CTTGTAATTTAACCAGAATGGAATGTAAACGGACGATACCGCTTAAACGAGATAACCCAGACCCAG 1393552
1393553CTTGTAATTTAGCCAGAATGGAATGTAAACTCCTATGGCTTCCTGTAATTGCCCTTCCAATTCTTT 1393618
1393619CTTGTAATTTAGCCAGAATGGAATGTAAACTTGATCACGTTGTCTTCAGAGATATTTACAAACTGC 1393684
1393685CTTGTAATTTAGCCAGAATGGAATGTAAAC1393714
Left flanking sequence : Till position 1392092 (length bp)
GACTTATCTGGGAAAATAGGTGTTGATTTTGGGTGCCACCGTATAGATCGACAGAAATTGAAGGTGGAGG
CCTTGATATAGGCCGGTTTCAGGAAGGAAG
Right flanking sequence : From position 1393715 (length bp)
CTGCTGGGGGATACCTGATAATGACCGATACCCCGTTTTACAGACACCCTAAACACCAAGTACAATAAAA
ATAAGAGGTGTTTGAAAATGGCCAAAAACT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp