Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_015311_8                                                                                                                 top


Strain : Prevotella denticola F0289 RefSeq :NC_015311 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015311_8
DR consensus (37 bp) : CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACNumber of repetitions :43
Begin Position : 2808033 End Position : 2811108

2808033CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTAACGACGGTTTCGCCGTCGTTGTTAAGCTCTGCA 2808104
2808105CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACGTTTTTGGATCTTCGACCCGAACTTTTTTTTATT 2808175
2808176CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACATCCTGATTCTCAACCTTATTAGGTTTTTTGGATC 2808247
2808248CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTCGAGGGCTTAAAGGGTTATATTAATTTCGG 2808315
2808316CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCCTTGTTTTACTCTCATAATTAACTTTGTAAAAGTA 2808388
2808389CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTCATAATTAACTTTGTAAAAGTAAGCGTACCGCC 2808459
2808460CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTGGAAATGCCCACACCAAAATAATGTCGTGACAAATAA 2808534
2808535CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTGCAGCGAATAACTCGTCCATGCTATCATAGTTCTGG 2808608
2808609CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACGCTGTTTTTGCCTAACATATCGGGAAAGGCTTAAATA 2808682
2808683CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCGCGCGTGTCTCCTTGTTGTCGCAAAAAGCCAAA 2808753
2808754CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCACCCCGACACTCATCAACGAGTGGATGTCGGA 2808823
2808824CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACAAATATATATTGTTGCAATAAGTCAAAGATGGA 2808893
2808894CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACAAGATTTCCCATATAATTGCAATTTTTGGTTACCGAA 2808967
2808968CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACAAGAGAATTTATTCTGCTCTGTAATTGGTAAAAT 2809038
2809039CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACAATGCTTGCTTTTTTTGTCCCTAAAGCAGTTTGTAA 2809111
2809112CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACGAGCCTCTAATCAAACTTCCCATATAATTGCAATCT 2809184
2809185CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTTGCAAAACTCCCCGCTGTGTCGCTTACATAATAGTG 2809258
2809259CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACAGTTTATTTCCGTTGTTATCAACTCCCTTAACTTTC 2809331
2809332CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACGACGAGACACCACGCTTCATTTATTCTAAACGAAAG 2809404
2809405CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTCTATGTCATGCGTGTACTTTTCGCAAGTAGTGTA 2809476
2809477CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTATGTTTTTTTTAAGTCTTGTAGATTCATGACTTTA 2809549
2809550CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACATCACTACACTCTTTATATGTTTTTTTTAAGTCTT 2809621
2809622CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACACCTTCCTGGCCTCGCTTGATGAAGACTTCCTT 2809691
2809692CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACGGCTTGCTTAAAGGTCATGTAGACAGGGGTGTTGTATC 2809766
2809767CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCCGCACATTGTTTACTTGCTGTAAGTTCTGTTAAGT 2809839
2809840CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACGATTTGTTGAGTTCGTTTGCCGTGCAGATTGTTAC 2809911
2809912CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCACGCTTTAAGCAAGCAGCGAAACTTTCGCCTGTA 2809983
2809984CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTTTCTTAAAGATTTTTTTTCTTTGTCAGTGCAGTCC 2810056
2810057CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCTTATTTGCCACAACCAAAGCAGACTCCTTTGGCT 2810128
2810129CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTTCAGAGCCTCCTTGAATTCCTTAGAGTTTTGATCC 2810201
2810202CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACAAAGGGCATACGCTCTCTTAGACATTCTTATCGCCAC 2810275
2810276CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTCTAAGTAAATATTTCATAATTATAGTTATTATAGTT 2810349
2810350CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACACAATTCCTTTTACTTCTACCCCAGGTAAAAGTACT 2810422
2810423CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACAATCTCTTCAAATTCTTTCTCATCACCCTTGAAGAA 2810495
2810496CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTTGTTTTTCTCTGCGAAGTCAACTGCCTCTTGGAA 2810567
2810568CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCGAAGGCATCACAGCATTACGCACAAGCTGTCTAA 2810639
2810640CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTCCGTATTTAAGAGCGATAAGAATATCGTTTTTCT 2810711
2810712CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCATCGGAGAAAAACGTTTTCTCATTCACGCGCTCCACT 2810786
2810787CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTCAGAGTAATAAGAGTAATAAATGAAACCGCCAA 2810857
2810858CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTCAGAGTAATAAGAGTAATAAATGAAACCGCCAA 2810928
2810929CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACCTCTGATATGTAGTCATTGGGAATTTCATTGTAG 2810999
2811000CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGACTTTTTCATGCTAAGTCTGACCCTTATTCTAAGATT 2811071
2811072CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC2811108
Left flanking sequence : Till position 2808033 (length bp)
GCACTCGCTTGGAATATGGTTAATTTCTCTTAATTCCTCAAGCATTTTTAGGTCTTACACGCATGGGGCT
GCGGCATATAAAGGAATACAAGTCTTTACT
Right flanking sequence : From position 2811108 (length bp)
TTTGCAAGAATTCGCTTTGCGTCCTCAACCTTCACTCAATATTAGAACAAGGATTCGGAAGAAGAGCCTT
TTGGGGCAAAAGAATTATGATTTATAAATT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp