CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_015385_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_015385_1                                                                                                                 
top
Strain :
Treponema succinifaciens DSM 2489
RefSeq :
NC_015385 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015385_1
DR consensus (34 bp) :
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
Number of repetitions :
26
Begin Position :
2333605
End Position :
2335521
2333605
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TGGGCTCTTCCAGAGCTAAAGGTTGTCGTTCTTAACGACGA
2333679
2333680
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TGCATTCCCAACATACAATATCAGTCTCTCAAGAGAC
2333750
2333751
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TTGACAAGGCTTTGAAATTTCAAGGTCATGTATCAGACCGGCTG
2333828
2333829
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TATATTCATAATATAAAGATTTTCGGAGGTAAGAAGATG
2333901
2333902
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TTTTCAACTTAGAAAGGGGAAAGGTTCCCTTTAGGGTATTATT
2333978
2333979
GGTCTTAATCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
CAAGACCAGTATTGCCTTGGGACTCTTACTCCAGTTCGTGA
2334053
2334054
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
AAAGAACCGAACCGCAGATTTTTAACTATCTCTGTCTTCAT
2334128
2334129
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
AGAAAGCAAGAGGCGCAAACTCGACAAGAGATATAAAAAT
2334202
2334203
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TTGACAAGGCTTTGAAATTTCAAGGTCATGTATCAGACCGGCTG
2334280
2334281
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TATATTCATAATATAAAGATTTTCGGAGGTAAGAAGATG
2334353
2334354
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TTTTCAACTTAGAAAGGGGAAAGGTTCCCTTTAGGGTATTATTG
2334431
2334432
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
CAAGACCAGTATTGCCTTGGGACTCTTACTCCAGTTCGTGA
2334506
2334507
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
AAAGAACCGAACCGCAGATTTTTAACTATCTCTGTCTTCAT
2334581
2334582
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
AGAAAGCAAGAGGCGCAAACTCGACAAGAGATATAAAAAT
2334655
2334656
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
ACAGGAAAATCAACTTTGATTGCTATGCCGCATAAAAGCGG
2334730
2334731
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TTTTAGTCGCTCACCGTATAAGTGATTGGGAAAATTTGAT
2334804
2334805
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TAAAACGACAGGGACATCAAAGGATGAGCTGACAAAAGTAA
2334879
2334880
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
AAGGTAAAGCGCGCTTTGACCTTGTTGAGCCGGAGTTTGA
2334953
2334954
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TCATATCTCTTAATAGAGAGACAAAGCCTGTTGCGGAAAGCAA
2335030
2335031
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
GCGGGACAAGCCTCATGAATAAGAAGGAGCACGACGCCTACT
2335106
2335107
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TTATGGGAGGCAAGGAGTATAATATGAATGAAAAGTTGAAT
2335181
2335182
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TTTGATGAATAAGAAGGAGCATGACGCTTATTTGCAGT
2335253
2335254
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
TGATTATGGCATTCCCAGTATATCAGATTTCTCTTTCAAGAG
2335329
2335330
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
CTTGTCGTGTTGAATGATAGCAAGAATATACATTTTGTAGATTCG
2335408
2335409
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAT
CGCCCAGTTCGCGGAGGAAGATGATGGCACTGAATGTGTCTTTCG
2335487
2335488
GTCTTAATCCCTTAAATCAGGTCTATGTTTTTAA
2335521
Left flanking sequence : Till position 2333605 (length
bp)
TTTACCATTTTGTGCATTTTTTAAATAGTAGTTTAGAGATTTAAAACAAAAAATTTTTACATGCGTTTGC
CCTGCAATACCAAATGACTACAGATTTTGT
Right flanking sequence : From position 2335521 (length
bp)
CTACCGCTCACAATATCTTTTATTGCAAGGAATTGCAACAGGTGTTTCGCAGAGGCCATTTATGTTTGCT
GCAATTCCGTGCATTTTTATTGCAAAAAGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp