CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_015428_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_015428_2                                                                                                                 
top
Strain :
Lactobacillus buchneri NRRL B-30929
RefSeq :
NC_015428 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015428_2
DR consensus (36 bp) :
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
Number of repetitions :
26
Begin Position :
1943645
End Position :
1945330
1943645
ATCTCTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
AATTACGTGGCATGACATTCGTTTAGAAAC
1943710
1943711
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CGTCCACTTGAGAATCATCCAGCCCGCCGA
1943776
1943777
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
ATGACGGCTGGCAACCTAAGCCACCTTATG
1943842
1943843
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
GCTGAACCAGCAACATCTGCAACAACGAAT
1943908
1943909
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
TGTGATCTCACGTGTTTCGATCTTGTAATA
1943974
1943975
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
TCGTAATCTTGCCGACAGCTGTGCCAATTT
1944040
1944041
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CATGTGGATGCAAGATGTGTGGTACATTTT
1944106
1944107
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
AAAGTAAAGGGTTAATCAAATACTCAAGTG
1944172
1944173
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CCAACGTTGATGAGAACCCGGGCGAATACC
1944238
1944239
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CTAAGCAACTAGAGAAAATTGATGGCAGGG
1944304
1944305
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
ACGGCCCCAACTTGCTTAACGCCAGAAAGA
1944370
1944371
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
ACCTCGCAGAGGATTATGGCAACGGGTAAA
1944436
1944437
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
TTGGCTTTAGTTTAGGTGTCTTTTGATGAA
1944502
1944503
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
GGAGTACCCCACGAATTAATGGTATTAATA
1944568
1944569
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
TACTAAACCGGTTAAAGCTTCGTATATTTT
1944634
1944635
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
GGCGTGTTATACGATTAGACAAGTATGTTA
1944700
1944701
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CCTTGCACAAAGCGGCCGCCACCTTTTTCC
1944766
1944767
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
ATTACTTTCGTAATAAGTCCCCACGGTATT
1944832
1944833
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
AGAACACGGTGCTCAAAAGTTTAGCGAACT
1944898
1944899
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CACCACCCTCAATTCAACATCAACCTTATC
1944964
1944965
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CGTCTTCATCGTCGGTAATATCAATTGGTG
1945030
1945031
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
GAATATCATGTTTGCTTGCACCGCTGGCAA
1945096
1945097
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
GTAGCTACTTTTAAGATCACGAAACTCGGT
1945162
1945163
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
TATCGAAACCGTTATTAACGGCCATCATGT
1945228
1945229
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
CTCCTTTATTTAGTAGATTCATTTAAGTGA
1945294
1945295
GGGTTTAACCTTATTGATTTAACATCCTTCTAAAAC
1945330
Left flanking sequence : Till position 1943645 (length
bp)
ATAAATAAACACAATAAGTTCCCTGCTTAGCAAATACTAGGCGGAGAACTTATTTTTTGTGGTGGAAGAT
GATCCAGAATGAATGATCTGTTGAGAAACC
Right flanking sequence : From position 1945330 (length
bp)
CGATTTTTTATAACCGAATTTTAATGCATTATAAATGCCAATCAACAAAGTCCTCGTCGATGTAGTAAAA
GTCGCAATTGGTATAAAGCTCCTGTGACTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp