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CRISPRs details
NC_015557_9
Flanking alignement tool
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NC_015557_9                                                                                                                 
top
Strain :
Hydrogenobaculum sp. 3684 GCF_000213785
RefSeq :
NC_015557 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015557_9
DR consensus (29 bp) :
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
51
Begin Position :
1088763
End Position :
1092095
1088763
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACTTATGCAAAAGTATCTATTACATTAGAACTATCAAAC
1088830
1088831
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CCTGACAAAAATGAGAGCATAACACTTCCTACTTTTGCAA
1088899
1088900
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTATCACACGTGCAAGTGTTTTGTGTTTTGATATGA
1088964
1088965
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGTCTCGTAACATTAAAATTCGTTGGAGTTGTAT
1089028
1089029
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCTTCAAAGCATACGTCAATAGTCTGCCAGCTTTGAGA
1089095
1089096
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTAAATTTTGAAAGTGTGGAGGATATGAAATCTTTTT
1089161
1089162
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTTCTTGAGATAATTTGATGATAGAAATATTTTTCT
1089227
1089228
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GTTAAAGAATCGTTTGAAAAACAGCAAATAGCAGAA
1089292
1089293
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATCTCCTACAGCACTCCATTGATAATATGTTATTT
1089356
1089357
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTGCAGTTAGCTTCTTCAATAGATTGATGTTTATA
1089421
1089422
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTACAAGTTTGTAAAACATCTCTTAAAAGCTTGTTT
1089486
1089487
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCGCACAGCTAAACAGCAACAGACTACTTGCTAAAATA
1089553
1089554
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AACTCAACATCATGCAAATCTGGGACTGCTTCTTTTTGC
1089621
1089622
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CCAAAATATACTTGATAAAAACGATAAACAAGCACATTCG
1089690
1089691
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTATCTCATCTTTTTGTAGGTATCTCAATACTCCTTG
1089756
1089757
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTTTAGCATCACTTTTTAACGATGCATTAGGTTTAA
1089823
1089824
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGTTGGATAAGTGATTTTTACTTTGTACTTCATGG
1089888
1089889
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAAGCTGTCAATCTAAACACTACTTTGTAATTATTTG
1089954
1089955
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTGCATCAAGCGTATCAGGAACCAAAACTTTCGC
1090019
1090020
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCACTTGCAAGTGCCACTTTGCGAGCCAATGCGAATAGA
1090087
1090088
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT
1090152
1090153
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC
1090218
1090219
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTCCTTGGCGCTCTTTCTACTCTTGATATCACAGAA
1090283
1090284
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAGAAGAGCTTCAAGATTAAGTTGCTTTTCCATCT
1090349
1090350
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AAATAGCAGCCCAGCTCCAACCCCACTGTCTTTCAG
1090414
1090415
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATGTCAACATGTATTGGTCAAAAGCTGAAGGAAGGC
1090479
1090480
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TGAGCCATATTCTCAGAGATTGGCTGGTGTAATAGCA
1090545
1090546
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACGGTGTGCGTGGTCTTACGGGGGATGTCATTTTA
1090610
1090611
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACAAAGACTTGATTGAAGATTTGCACTCAGTCAAAAA
1090677
1090678
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CGTTGAGTTGTGAGTATCACTTTGATATTTTGCATGA
1090743
1090744
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TATTCTATTTGCAATCTCTTCAGGCTTGAGGGCTCT
1090808
1090809
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTTAATCACTTCAAGCCGCAGATGTGTATCTCCTTG
1090873
1090874
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAGAGCATTTGCACTCATAGATGCTCCAGTAGGACT
1090938
1090939
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAAGTTTTTGCTTAAAACTTCTTCTAAAGAAGCTGCA
1091004
1091005
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AACACAGACGCAAACCTTTTAAACGCAAACGGTGTA
1091069
1091070
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACGTTTTTCACACGACCTAACGCATCTATGTGTTTCATCTGA
1091140
1091141
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACAATTGCTGAAAAAGTGGACGATGACAAGAAGAAGA
1091206
1091207
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAAGTAAACAAAGCTCTGTTGCTTCTGGCGGCTTCT
1091271
1091272
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTACCAATCGCATCTACGCCTATCACCTTCCAACCA
1091336
1091337
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGATTACAAACATTATCAACGCACTTGTAAAACAAA
1091402
1091403
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAGTAAGCGTTTTTTTAACAGAATGGAGGTCTTCTAT
1091468
1091469
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAGAGCATTTGCATTAATAGATGCTCCTGTGGGACTT
1091534
1091535
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCGTTTGAAAATAGTATTTCTTTTGTGTAAAAATAGG
1091600
1091601
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT
1091665
1091666
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC
1091731
1091732
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATATGATACTTTTAGCACTTGCCCGAGCCAGTAGCTAATGG
1091801
1091802
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTACTGAAAAATTGCAACAATTATTAAACTACATG
1091866
1091867
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTTCTAAGGTTTGATGTAGTCTTTCAATCATTTGAGGCA
1091934
1091935
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AGCATCGGGGCGTTTATAAATACCGATGCAAAAACT
1091999
1092000
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACAACAAGCGTTTGATAAACGTTAGCGGGAGTTGTTGA
1092066
1092067
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
1092095
Left flanking sequence : Till position 1088763 (length
bp)
CAGAATCTGGCATTTTCGGGAAATTACCTTCATTTGCGATGGGTACCCCCTTGACAAAACCATTGATACA
CTATATAATTTTAAATATAGTGATTTCTGG
Right flanking sequence : From position 1092095 (length
bp)
TTTCATTCTACTTTGTAATAAAGGGTTATCTCTTTGTTGTCCCTTATGATTTTTACGCTGAAGCTTTGGC
TGTTTCTTAATGTACCTAATATTCTAAAAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp