Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015562_16                                                                                                                 top


Strain : Methanotorris igneus Kol 5 RefSeq :NC_015562 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015562_16
DR consensus (37 bp) : GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGATGAGTAATTCAAACNumber of repetitions :7
Begin Position : 1280412 End Position : 1280888

1280412GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGATGAGGTATTCAAACTTGCTGGGTTTGGGATGTTAATTTATTTGGTAAAA 1280483
1280484GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGATGAGTAATTCAAACTTGGCGGAGGACAAGGAACGCTTAAAATCATGGATT 1280556
1280557GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGATGAGTAATTCAAACCCCTTTTTTCCTCGGTATCCAATAACACAGCCATTTTG 1280631
1280632GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGATGAGTAATTCAAACTGTTGAAAATATTAAATCACAAATATCCGTTTTAT 1280703
1280704GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGATGAGTAATTCAAACTAACATAATCAATATATTATATTCACATTATCCCACA 1280777
1280778GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGATGAGTAATTCAAACAAAACATTAGTCAATCTGATATTCAATTTATATATCA 1280851
1280852GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGATGAGTAATTCAAAC1280888
Left flanking sequence : Till position 1280412 (length bp)
AAGATGATGTTTTATTCTCTTAACTCCAATTCCTATCATACATTTGAATATTTATGGATGCAAATTTTTT
AATGATGTAGTTTTTTAATAATAAAATCAT
Right flanking sequence : From position 1280888 (length bp)
CCTATAACTTCATCCTTATTTTATACCTAAACTCCTATATAAATCTTTCTTTTTCAACCCTATTTTTCTT
ACTGCCCAATTATTGAAACCTTTATAAAAG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp