CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_015573_11
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_015573_11                                                                                                                 
top
Strain :
Desulfotomaculum kuznetsovii DSM 6115
RefSeq :
NC_015573 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015573_11
DR consensus (37 bp) :
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
Number of repetitions :
58
Begin Position :
2990697
End Position :
2994950
2990697
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGTAAC
TTTGCGGGCTAAATATGGATGATGTAGATCTTAACTT
2990770
2990771
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAGTGGGTGCAAC
TGTTACGCAACTCCTGGGGTTCTGGCTGGGGTATCGA
2990844
2990845
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TTCCTGGCCTCCCCCGTCCGGTCAGTCCAAGCGGCGT
2990918
2990919
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TCAACTTCGTCTTGGCTGCGTTTGACGCCCAAATTTTTGC
2990995
2990996
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TTGCCGTCATTTTTAAATTCCTCCTTCCCACGCCGGT
2991069
2991070
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TCAACTTCGTCTTGGCTGCGTTTGACGCCCAAATTTTTGC
2991146
2991147
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TTCTACTCTTTGAAATTTTCTACCAGAGGTTAATAT
2991219
2991220
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
AATCCAAAGACATGATAGCCAGTCAATGTTGTTTGATA
2991294
2991295
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TTCTACTCTTTGAAATTTTCTACCAGAGGTTAATAT
2991367
2991368
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CCCTCGTGGCCGCACCCTTCGAAGTACCTGGCCGCCTGTTC
2991445
2991446
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CGATACTGACTACATCGGCTCTCCTGCTGGCCGTACA
2991519
2991520
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CTTCTTTTAAAACCAGAAGAAGTGGCCGATATTTT
2991591
2991592
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TTGGAAGCAAAGCTAACAAACTCATTATCTATCTCAAA
2991666
2991667
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TCCCCTGCTCCGCAACTGTCAGGACTGTCCTCTTC
2991738
2991739
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CGGATTCGGCCCGGGCTACGGCCCGCAGCAGTGATG
2991811
2991812
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
ATGACGTGGAGCGGGTACGACCTGGTGGAGACGAGA
2991884
2991885
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CGATGTCCGCCGGAGTGAGTGCATCGCTACCTCCAG
2991957
2991958
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TAATGTGTACGAAGGTTGGGCTCAAAATTATGTAACG
2992031
2992032
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TTGTTCGGCCCGTTCAGCATCCATCAGGTGCAGGATATT
2992107
2992108
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
AGGCGTTCCGTGTTGCTGAACGCCCCGATATGGTCC
2992180
2992181
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
AAGGATCGAGTTCAGGAGCAGGGCGGGACAACAAT
2992252
2992253
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GCCTTCTCCTTACAGAAAATTTGAAGTCAAATAGGG
2992325
2992326
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GCAGAAGGTACTCTTCTAAGTTTGCCGTAAAGGCA
2992397
2992398
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CTTACTTGCGCATCGCCTGACGACGATGCGCGTGC
2992469
2992470
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TCTAATGAGTCGGCAGCAAGGTAAAGGGTGCTCTCCC
2992543
2992544
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GGCCTGGGGCATATGTTCCGGTGCCGGTGCTGGTG
2992615
2992616
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TGTGGAGAAGGATTTTCCGGTTGCTCTTCGCCCCCTGG
2992690
2992691
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GCGGCCCGATTTAGACCCGCACATGCGCGTCAGGTT
2992763
2992764
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TACTGCAGCGGCACCCGTTAAGAAGCACGCCTACGG
2992836
2992837
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GTTCCACCATCCCGAAGCCGTAGGCCCTCTTTTTACCCA
2992912
2992913
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CCGCCCAGGGCGAGCAGATGAGCGATTGGATCACCC
2992985
2992986
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CGAGAACCTGATCTTCGTGGAGGACCCCGCCGAATCGA
2993060
2993061
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GATGAGTTTCATCTTTAACGGTATAAGCAGCGACAGCTT
2993136
2993137
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TCACCTGTACGCCGGCCCCCGGCTCCCAGCCAGGG
2993208
2993209
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GCAGAAGGTACTCTTCTAAGTTTGCCGTAAAGGCA
2993280
2993281
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CTTACTTGCGCATCGCCTGACGACGATGCGCGTGC
2993352
2993353
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TACCCCCGCAATACTGCGAGGGTGTCTCTGGTGTTTAT
2993427
2993428
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GGAGCACAGTACGGGTGAATCGAACTTGACAATTTCC
2993501
2993502
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TCATCCGCTACCAGGACCAGATCCTTGACCGTCTGG
2993574
2993575
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GTGGTTCGTACGAAAAACGGTCAGGAAAATACCGGCA
2993648
2993649
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CGTGGCCGAGGGGCCGGTTGATGAGTCTTCGGAGG
2993720
2993721
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CGCACGATGCCCGGCATGGCCGTGATGTCGCTTTCA
2993793
2993794
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CTGTAGATGTACACATAATGGCCGTGGAACCCGGCACAAG
2993870
2993871
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CGGGAGGAGGTTTTTAAACTCCCTGCCGCGTTGCC
2993942
2993943
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TGGCTTGGATGAGGAAGATGACGATAGTCTGCGTGCC
2994016
2994017
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CTCGCGCGGCTGAAAGCGGGTTTTGTCATAGATAGC
2994089
2994090
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GAAGCACCAGCTTGCTGGGCTGGTGCACGCATTCGACT
2994164
2994165
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TCCGGCGTGACCGCCCGGGTGTTTGGTCAGTTCTTAACA
2994240
2994241
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TTGAGTGTTCGTGTGACACCGTGACACCTATTTTGA
2994313
2994314
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GACGAAGGGATAGAGTTTCTAAGGCGGCACGGGGTGAGGG
2994390
2994391
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CTGGAGTAGGTCACTTCTGGTTTGGCGACATCCGCA
2994463
2994464
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GGATACAAGCCCCAGTCACTGCAAATCAACACCCGGGGAG
2994540
2994541
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GGCGGCACTCGTCCTTGGCCACCGCGTAGGTGTCCCGGA
2994616
2994617
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
CTTGCGGACTGCTTGACCAGGCCCGCCAGCCTTTCA
2994689
2994690
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
GCCGGTGAGTGGGTCTGGGCCGCAAGTGTGGCGCAGTAC
2994765
2994766
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TAGGCAGTCTGGATGTTGGTGCGGAAGATGTTGTCCAGA
2994841
2994842
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
TGAGAAACAATGGTTGGGGTTGATTAATGAGCGCA
2994913
2994914
CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC
2994950
Left flanking sequence : Till position 2990697 (length
bp)
CTTTCTGGACACTGTCTTTTCCCATGCTTTTTTCATCGCTAAGTACATTTACTTTCTCGAAAATCAGGCC
TTCCCCCAATCATCCATCATCGGGGCTTGT
Right flanking sequence : From position 2994950 (length
bp)
CGACCGCGAGGGTGCAGTAAAAATCCAGCTGTATTGCGGGCTGGCGGCTTTGTGATACCGCTCCGGAAAG
CCGTTTTTTTCGAAAACTGGTTTTCTGCAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp