Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015573_11                                                                                                                 top


Strain : Desulfotomaculum kuznetsovii DSM 6115 RefSeq :NC_015573 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015573_11
DR consensus (37 bp) : CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACNumber of repetitions :58
Begin Position : 2990697 End Position : 2994950

2990697CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGTAACTTTGCGGGCTAAATATGGATGATGTAGATCTTAACTT 2990770
2990771CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAGTGGGTGCAACTGTTACGCAACTCCTGGGGTTCTGGCTGGGGTATCGA 2990844
2990845CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTTCCTGGCCTCCCCCGTCCGGTCAGTCCAAGCGGCGT 2990918
2990919CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTCAACTTCGTCTTGGCTGCGTTTGACGCCCAAATTTTTGC 2990995
2990996CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTTGCCGTCATTTTTAAATTCCTCCTTCCCACGCCGGT 2991069
2991070CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTCAACTTCGTCTTGGCTGCGTTTGACGCCCAAATTTTTGC 2991146
2991147CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTTCTACTCTTTGAAATTTTCTACCAGAGGTTAATAT 2991219
2991220CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACAATCCAAAGACATGATAGCCAGTCAATGTTGTTTGATA 2991294
2991295CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTTCTACTCTTTGAAATTTTCTACCAGAGGTTAATAT 2991367
2991368CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCCCTCGTGGCCGCACCCTTCGAAGTACCTGGCCGCCTGTTC 2991445
2991446CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCGATACTGACTACATCGGCTCTCCTGCTGGCCGTACA 2991519
2991520CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCTTCTTTTAAAACCAGAAGAAGTGGCCGATATTTT 2991591
2991592CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTTGGAAGCAAAGCTAACAAACTCATTATCTATCTCAAA 2991666
2991667CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTCCCCTGCTCCGCAACTGTCAGGACTGTCCTCTTC 2991738
2991739CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCGGATTCGGCCCGGGCTACGGCCCGCAGCAGTGATG 2991811
2991812CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACATGACGTGGAGCGGGTACGACCTGGTGGAGACGAGA 2991884
2991885CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCGATGTCCGCCGGAGTGAGTGCATCGCTACCTCCAG 2991957
2991958CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTAATGTGTACGAAGGTTGGGCTCAAAATTATGTAACG 2992031
2992032CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTTGTTCGGCCCGTTCAGCATCCATCAGGTGCAGGATATT 2992107
2992108CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACAGGCGTTCCGTGTTGCTGAACGCCCCGATATGGTCC 2992180
2992181CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACAAGGATCGAGTTCAGGAGCAGGGCGGGACAACAAT 2992252
2992253CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGCCTTCTCCTTACAGAAAATTTGAAGTCAAATAGGG 2992325
2992326CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGCAGAAGGTACTCTTCTAAGTTTGCCGTAAAGGCA 2992397
2992398CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCTTACTTGCGCATCGCCTGACGACGATGCGCGTGC 2992469
2992470CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTCTAATGAGTCGGCAGCAAGGTAAAGGGTGCTCTCCC 2992543
2992544CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGGCCTGGGGCATATGTTCCGGTGCCGGTGCTGGTG 2992615
2992616CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTGTGGAGAAGGATTTTCCGGTTGCTCTTCGCCCCCTGG 2992690
2992691CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGCGGCCCGATTTAGACCCGCACATGCGCGTCAGGTT 2992763
2992764CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTACTGCAGCGGCACCCGTTAAGAAGCACGCCTACGG 2992836
2992837CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGTTCCACCATCCCGAAGCCGTAGGCCCTCTTTTTACCCA 2992912
2992913CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCCGCCCAGGGCGAGCAGATGAGCGATTGGATCACCC 2992985
2992986CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCGAGAACCTGATCTTCGTGGAGGACCCCGCCGAATCGA 2993060
2993061CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGATGAGTTTCATCTTTAACGGTATAAGCAGCGACAGCTT 2993136
2993137CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTCACCTGTACGCCGGCCCCCGGCTCCCAGCCAGGG 2993208
2993209CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGCAGAAGGTACTCTTCTAAGTTTGCCGTAAAGGCA 2993280
2993281CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCTTACTTGCGCATCGCCTGACGACGATGCGCGTGC 2993352
2993353CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTACCCCCGCAATACTGCGAGGGTGTCTCTGGTGTTTAT 2993427
2993428CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGGAGCACAGTACGGGTGAATCGAACTTGACAATTTCC 2993501
2993502CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTCATCCGCTACCAGGACCAGATCCTTGACCGTCTGG 2993574
2993575CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGTGGTTCGTACGAAAAACGGTCAGGAAAATACCGGCA 2993648
2993649CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCGTGGCCGAGGGGCCGGTTGATGAGTCTTCGGAGG 2993720
2993721CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCGCACGATGCCCGGCATGGCCGTGATGTCGCTTTCA 2993793
2993794CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCTGTAGATGTACACATAATGGCCGTGGAACCCGGCACAAG 2993870
2993871CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCGGGAGGAGGTTTTTAAACTCCCTGCCGCGTTGCC 2993942
2993943CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTGGCTTGGATGAGGAAGATGACGATAGTCTGCGTGCC 2994016
2994017CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCTCGCGCGGCTGAAAGCGGGTTTTGTCATAGATAGC 2994089
2994090CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGAAGCACCAGCTTGCTGGGCTGGTGCACGCATTCGACT 2994164
2994165CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTCCGGCGTGACCGCCCGGGTGTTTGGTCAGTTCTTAACA 2994240
2994241CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTTGAGTGTTCGTGTGACACCGTGACACCTATTTTGA 2994313
2994314CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGACGAAGGGATAGAGTTTCTAAGGCGGCACGGGGTGAGGG 2994390
2994391CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCTGGAGTAGGTCACTTCTGGTTTGGCGACATCCGCA 2994463
2994464CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGGATACAAGCCCCAGTCACTGCAAATCAACACCCGGGGAG 2994540
2994541CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGGCGGCACTCGTCCTTGGCCACCGCGTAGGTGTCCCGGA 2994616
2994617CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACCTTGCGGACTGCTTGACCAGGCCCGCCAGCCTTTCA 2994689
2994690CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACGCCGGTGAGTGGGTCTGGGCCGCAAGTGTGGCGCAGTAC 2994765
2994766CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTAGGCAGTCTGGATGTTGGTGCGGAAGATGTTGTCCAGA 2994841
2994842CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAACTGAGAAACAATGGTTGGGGTTGATTAATGAGCGCA 2994913
2994914CTTTCAGTCCCCTTTTCGTCGGGTCAACGGGTGCAAC2994950
Left flanking sequence : Till position 2990697 (length bp)
CTTTCTGGACACTGTCTTTTCCCATGCTTTTTTCATCGCTAAGTACATTTACTTTCTCGAAAATCAGGCC
TTCCCCCAATCATCCATCATCGGGGCTTGT
Right flanking sequence : From position 2994950 (length bp)
CGACCGCGAGGGTGCAGTAAAAATCCAGCTGTATTGCGGGCTGGCGGCTTTGTGATACCGCTCCGGAAAG
CCGTTTTTTTCGAAAACTGGTTTTCTGCAC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp