CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_015587_9
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_015587_9                                                                                                                 
top
Strain :
Hydrogenobaculum sp. SHO GCF_000215065
RefSeq :
NC_015587 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015587_9
DR consensus (29 bp) :
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
51
Begin Position :
1088875
End Position :
1092207
1088875
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACTTATGCAAAAGTATCTATTACATTAGAACTATCAAAC
1088942
1088943
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CCTGACAAAAATGAGAGCATAACACTTCCTACTTTTGCAA
1089011
1089012
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTATCACACGTGCAAGTGTTTTGTGTTTTGATATGA
1089076
1089077
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGTCTCGTAACATTAAAATTCGTTGGAGTTGTAT
1089140
1089141
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCTTCAAAGCATACGTCAATAGTCTGCCAGCTTTGAGA
1089207
1089208
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTAAATTTTGAAAGTGTGGAGGATATGAAATCTTTTT
1089273
1089274
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTTCTTGAGATAATTTGATGATAGAAATATTTTTCT
1089339
1089340
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GTTAAAGAATCGTTTGAAAAACAGCAAATAGCAGAA
1089404
1089405
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATCTCCTACAGCACTCCATTGATAATATGTTATTT
1089468
1089469
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTGCAGTTAGCTTCTTCAATAGATTGATGTTTATA
1089533
1089534
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTACAAGTTTGTAAAACATCTCTTAAAAGCTTGTTT
1089598
1089599
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCGCACAGCTAAACAGCAACAGACTACTTGCTAAAATA
1089665
1089666
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AACTCAACATCATGCAAATCTGGGACTGCTTCTTTTTGC
1089733
1089734
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CCAAAATATACTTGATAAAAACGATAAACAAGCACATTCG
1089802
1089803
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTATCTCATCTTTTTGTAGGTATCTCAATACTCCTTG
1089868
1089869
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTTTAGCATCACTTTTTAACGATGCATTAGGTTTAA
1089935
1089936
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGTTGGATAAGTGATTTTTACTTTGTACTTCATGG
1090000
1090001
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAAGCTGTCAATCTAAACACTACTTTGTAATTATTTG
1090066
1090067
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTGCATCAAGCGTATCAGGAACCAAAACTTTCGC
1090131
1090132
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCACTTGCAAGTGCCACTTTGCGAGCCAATGCGAATAGA
1090199
1090200
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT
1090264
1090265
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC
1090330
1090331
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTCCTTGGCGCTCTTTCTACTCTTGATATCACAGAA
1090395
1090396
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAGAAGAGCTTCAAGATTAAGTTGCTTTTCCATCT
1090461
1090462
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AAATAGCAGCCCAGCTCCAACCCCACTGTCTTTCAG
1090526
1090527
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATGTCAACATGTATTGGTCAAAAGCTGAAGGAAGGC
1090591
1090592
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TGAGCCATATTCTCAGAGATTGGCTGGTGTAATAGCA
1090657
1090658
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACGGTGTGCGTGGTCTTACGGGGGATGTCATTTTA
1090722
1090723
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACAAAGACTTGATTGAAGATTTGCACTCAGTCAAAAA
1090789
1090790
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CGTTGAGTTGTGAGTATCACTTTGATATTTTGCATGA
1090855
1090856
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TATTCTATTTGCAATCTCTTCAGGCTTGAGGGCTCT
1090920
1090921
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTTAATCACTTCAAGCCGCAGATGTGTATCTCCTTG
1090985
1090986
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAGAGCATTTGCACTCATAGATGCTCCAGTAGGACT
1091050
1091051
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAAGTTTTTGCTTAAAACTTCTTCTAAAGAAGCTGCA
1091116
1091117
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AACACAGACGCAAACCTTTTAAACGCAAACGGTGTA
1091181
1091182
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACGTTTTTCACACGACCTAACGCATCTATGTGTTTCATCTGA
1091252
1091253
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACAATTGCTGAAAAAGTGGACGATGACAAGAAGAAGA
1091318
1091319
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAAGTAAACAAAGCTCTGTTGCTTCTGGCGGCTTCT
1091383
1091384
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTACCAATCGCATCTACGCCTATCACCTTCCAACCA
1091448
1091449
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGATTACAAACATTATCAACGCACTTGTAAAACAAA
1091514
1091515
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAGTAAGCGTTTTTTTAACAGAATGGAGGTCTTCTAT
1091580
1091581
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAGAGCATTTGCATTAATAGATGCTCCTGTGGGACTT
1091646
1091647
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCGTTTGAAAATAGTATTTCTTTTGTGTAAAAATAGG
1091712
1091713
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT
1091777
1091778
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC
1091843
1091844
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATATGATACTTTTAGCACTTGCCCGAGCCAGTAGCTAATGG
1091913
1091914
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTACTGAAAAATTGCAACAATTATTAAACTACATG
1091978
1091979
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTTCTAAGGTTTGATGTAGTCTTTCAATCATTTGAGGCA
1092046
1092047
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AGCATCGGGGCGTTTATAAATACCGATGCAAAAACT
1092111
1092112
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACAACAAGCGTTTGATAAACGTTAGCGGGAGTTGTTGA
1092178
1092179
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
1092207
Left flanking sequence : Till position 1088875 (length
bp)
CAGAATCTGGCATTTTCGGGAAATTACCTTCATTTGCGATGGGTACCCCCTTGACAAAACCATTGATACA
CTATATAATTTTAAATATAGTGATTTCTGG
Right flanking sequence : From position 1092207 (length
bp)
TTTCATTCTACTTTGTAATAAAGGGTTATCTCTTTGTTGTCCCTTATGATTTTTACGCTGAAGCTTTGGC
TGTTTCTTAATGTACCTAATATTCTAAAAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp