Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015636_9                                                                                                                 top


Strain : Methanothermococcus okinawensis IH1 RefSeq :NC_015636 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015636_9
DR consensus (30 bp) : GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATNumber of repetitions :66
Begin Position : 1629402 End Position : 1633833

1629402TTAAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCGCAATAATGGAGCTCAGGCAGACATCTACCAATATG 1629468
1629469GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAAAAATTACCCCCTTGAAAAAAATATGCAAACATGCAAACCGA 1629541
1629542GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTGAAATACGCAGATACTCCTATTATTTGTATATCTCC 1629608
1629609GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTGCCTTTTCTATCAGGGCCTCTATTTCTGTAAATT 1629674
1629675GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTGGAAGCCACAGCAAAATATGGGTTTGCTGGTAAAGT 1629741
1629742GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTAAAAATAGCAGGATATGATAAAAATAATGCACCCAATC 1629810
1629811GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCATTTATGGAGACGCCACAGAGCATAAAAATGAAAGCT 1629878
1629879GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTCAATTTTGATAATCAAGCAATACATATAAAG 1629940
1629941GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAATTATAATGAGGTTAGGGAAGAGGCTTATTCTCTTT 1630007
1630008GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCATACATTTTCGATAATAAAACAAGTGGAACAGTAAA 1630074
1630075GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTATTATAATTTAATAAGTGTAGGATGTGGTTTTCCAAGATA 1630146
1630147GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTATATTATAGAATGCCCTAATTCTATGCATTCTTTATC 1630214
1630215GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTGTTCTTTAAAGCGACTTCGCCCGATTCGTGGTATTGG 1630282
1630283GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCTTATCTATCGATTTAGATAAGGTTATTGGAAAA 1630346
1630347GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCTGTAAATGACTTTATAATCCCCGTGTGTTCCATAGC 1630413
1630414GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTAGTTAATAGTTAAGGGTTCTATCTATTGGAATATATTTCC 1630484
1630485GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAAAGAGGTATCTTTCAACTCAGGAAGTTCATTTGCAG 1630551
1630552GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAGAGATAAAACAGGATTAAATCCTTTTCTATACAAAA 1630618
1630619GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTTAGGAATCCTGATGACTTTGCAGACGACTATGAA 1630684
1630685GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTATACTAATATCTTAAAAAAAGAATATAAATATAT 1630749
1630750GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATATACCATTTCGTTATTTTATACCGTCCTGCTGCTACC 1630816
1630817GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATATGTGAGGAAATACGAAAAGAGGAATACGGCAAAATCA 1630884
1630885GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTCAAAAAGGGCAAAACATCATGGAAATGGAATTCAAA 1630951
1630952GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAACAGATAAAACGGTTGCGGTAAGAGAAATTGCAAAAAT 1631020
1631021GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATATAACATATCAATAGTAAATAATGAATTTTATAATGC 1631087
1631088GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTCTCTTAAAGCAGATAAAAACTCATCAGCAGGGATTTGT 1631156
1631157GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAAAGTAAAAACGGGGGCGTATTACATTTTACATCAAA 1631223
1631224GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTCTTTCATTTTTTTAGAGAGGGATGATAATACCATATC 1631291
1631292GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAAAAAGAGCTTTAAGGTATTTATACAGAAGTTTAAGAAAAAT 1631363
1631364GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTTTATAGTCAATATCTGAATTTATTAAGTCTTTTAACT 1631432
1631433GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTTTTTACAAAGCACCAGTCTAAACAACATACGACCTA 1631500
1631501GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAAAAAGAGCTTTAAGGTATTTATACAGAAGTTTAAGAAAAAT 1631572
1631573GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTTTATAGTCAATATCTGAATTTATTAAGTCTTTTAACT 1631641
1631642GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTTTTTACAAAGCACCAGTCTAAACAACATACGACCTA 1631709
1631710GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATATTACACTCTATGACACTCGATGCGACATAGGAAACA 1631776
1631777GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCATATTTTAACATCTTTTATAGTTATATTCTTTTTGCGTTA 1631847
1631848GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATATATACTGGGAAAATGTGGATGGTGTGTATTATATC 1631913
1631914GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCAAATATTTTAGTTTCAATACTTTCTGGTGGAATAT 1631979
1631980GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTCTTGCATCTTTGCTATACGAAAAAGAGCAAGAAA 1632045
1632046GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATGAGATGGATATACCTATTCTATATATTTATATATTCTAAATA 1632117
1632118GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATGTTTTTCATTAAGATAGTAAGAAACCTTGAAGG 1632180
1632181GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCTCAATAATGAGGTGGGGGTGTTTTGTGGAGATAAGTGTTTT 1632252
1632253GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAATGGTTCAAAGGTGTTTGATTTCTTTGATGATTTTAATGAA 1632324
1632325GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATGGACATAAGAAGTTCTTTTCTTTCAATGATAAAATTT 1632391
1632392GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTATTTAGATACTATTTATTGAATACAAAACGAATA 1632456
1632457GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAACTTTTTTAACAATCCACATAACATAATGTCCATT 1632522
1632523GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATGAAAATAATTGTGCCTAAAATCATTAAGCGCTTCATTTA 1632591
1632592GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATACGTGTTCAAATATATTCTAAAATCCTCTTTCTATGA 1632658
1632659GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTGATGGATGGCAATGATGAGGTTAATCCTCGGAGCCT 1632726
1632727GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAGATGGATATTTACTTACAAATGTGTTTTTTGAAA 1632791
1632792GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTGTCATTAAAGGAGCTTGTAGATAATAAGTTAATAC 1632857
1632858GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTCATGTTTATTATATCTTCTTTTACATAATCGTAGA 1632923
1632924GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTATCTTTTACTATATTATAATATATTATACAGCTGTGTA 1632992
1632993GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTGGAGGGCATATTAGATTTTGGTAGTTATTATATTAT 1633059
1633060GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTTTTTAATATTTTCATTTTCTTCAACCTCTTTTTTAGT 1633128
1633129GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATGTTTGTTCATTAGTCCCATCCGTGACCTTTAAGTATAAA 1633197
1633198GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTAATAATATGTTTTTTTTCCTCTCTTTCAGTTATGTG 1633264
1633265GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATAAACAGACTGAAAAGATTGCAAATATTATTAATGA 1633329
1633330GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCATTTTATATTAACAACATTGGCATTATTGATGATAG 1633396
1633397GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATCAACATGAGGCGGTTAATAATTTTATAAACACATATA 1633463
1633464GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTTAATATATCATCATTTATATTCTTTCTTTTTTGCCCGATATGC 1633537
1633538GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATGGCAACAAGATAGATTTCTCAAACAATTTTACAAAC 1633603
1633604GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTCATATTATATAAGATACCCCTCAATGTTGTGGATA 1633669
1633670GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAACTTAAATGTAAGTAAATTTAATGTTAAAATTGATTATA 1633736
1633737GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAACTATAATTTTATTTAAAAAATATAATAAAATTAAAAA 1633802
1633803GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT1633832
Left flanking sequence : Till position 1629402 (length bp)
ACTATATAAATAACAAAAATCAATGTGATTCGAGATTCGAAAAGTTTATATAGGGGTAATGCAAAGGTAT
TTTACATAAAATAAGAAAAATTTTGAACTG
Right flanking sequence : From position 1633833 (length bp)
TTTATTTGTGATTAATAATTATAAAAAAAGATAGAGAATAAGGGGAGCATATGGAAAAATCTGAACGAAA
CAAAATTTAGAACTAATTTCTAAAGGCGAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp