CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_015672_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_015672_2                                                                                                                 
top
Strain :
Flexistipes sinusarabici DSM 4947
RefSeq :
NC_015672 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015672_2
DR consensus (36 bp) :
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
Number of repetitions :
30
Begin Position :
1428495
End Position :
1430685
1428495
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
CATAGGCTCATTAAAGGGCATGTAAGCATGGAGCTTGT
1428568
1428569
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
GCAAAATACAACTGAAAACACAAGTAAAGTAAAACTAA
1428642
1428643
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AAAAGGGTCAATGATTTCTTATTTAAAAAGATACAGCT
1428716
1428717
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
GCGCCGCCGTAAGTTTTTTAACGGCGGATATAAGGCT
1428789
1428790
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AGTTAAAAGCTGTTTTCACTCTCCTGAAATGGGAGAGTGAA
1428866
1428867
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
CAAAAATCTGCGTGAGCCAGAGATAGAAGAAGGCAGTAC
1428941
1428942
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AAGATATGTATAACGTAGCCTTCGAACTGTACTGTGAGAA
1429017
1429018
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
GAAAATTGTCATGGCAATTCTATTTTTTGGCGGTCTAG
1429091
1429092
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AAAATTTAGTATTAACAACAAGTGGAAACAAACTCTATGT
1429167
1429168
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
ACCATTGTTCAACACACTATTCAATGCTGTGACAAAGAAC
1429243
1429244
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AAAATATGGCGCGAGGTTTGCAGACTTGCAGCCTCACGCT
1429319
1429320
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
ATTAATTTTCTTATCAGGGGGGGAAGAAAAAATAAA
1429391
1429392
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AAAAAGGTAAAAAAATATACAATTAAAGACGAGTTGGGA
1429466
1429467
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
TCCATGGTCAGAGCTCGAATCCGCAATCGGGCACCCGGA
1429541
1429542
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
TAGATGTTGCAAAGCAGCCGGTTAAGCTCCGGCTGCTAT
1429616
1429617
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
CATAAGTGCATCTGAATTTTGGGAGCGCGCAGTAAAA
1429689
1429690
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
TAATATTACAAAATGTTATATTAATAATAATATTGATA
1429763
1429764
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AAAATCAAATAAATTTAAGAAGTCTGCAAAGCGCAGG
1429836
1429837
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
CGAATCCGCCATCGGGCACCCGGATACAGCCCGGGTGC
1429910
1429911
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
CTTAAAAGCTTTATGGAACAAAATGGCCTGGCGGAAAT
1429984
1429985
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AGATTAAAAGATTTATATAAAAAGTACGGCGCTGAGTAT
1430059
1430060
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
TACTTCCGCGTAGAAGTACTTTAAAAAAATAAAAACCGT
1430134
1430135
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
CGGCGGGTATAAAGCAGTCCTCAGATACTTTGAGGA
1430206
1430207
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
ATAATAAGCGCCTTATCCAATCAAAAAATTTTTCTTTT
1430280
1430281
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
TCCCGGGGAGAAAAGAGACATAGCAAAGCAGCCGGTTAA
1430355
1430356
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AAGCAATAAGCTTACATAAAAATTCTTTCTCTCCTTT
1430428
1430429
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AGATTGTTCTACTCTTACCTTTATTCGTCTTTATGA
1430500
1430501
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
AAAATGAGAAATGAAATAATTGTAAATAAGATTTCAGAA
1430575
1430576
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
GGAAGGGGCAACAACCCTTCCGGAGGGTTTTAAAATGA
1430649
1430650
GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT
1430685
Left flanking sequence : Till position 1428495 (length
bp)
ATATCTCATCGCAAATGTTTCTGTTCAGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATTAATTCCAATTGAAGATTAA
TGACCCGAAGCAAATCCAGATTTTAGAAGA
Right flanking sequence : From position 1430685 (length
bp)
AGCCCCTATTTTTATACCTTAAGTTTTAGTAAGTTACAATGCCATTTTTTAGGAAGGGGGGGTATCCGGT
TTTTCTACTTTTCAAAATCAGCCCCCCTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp