Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_015682_2                                                                                                                 top


Strain : Thermodesulfobacterium sp. OPB45 RefSeq :NC_015682 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015682_2
DR consensus (35 bp) : GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAANumber of repetitions :42
Begin Position : 1115343 End Position : 1118449

1115343GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATTACAAAAATAAAATTTTTCATGTGGACAGGTCCATTCAAGA 1115419
1115420GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAAATTGATCATAAAGTATTCTTTCAATTGTCTCTTTCAAATT 1115495
1115496GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATTTCGTTGAACTTCTTTATCTTACTCGCACACTCTTTTTCACAA 1115574
1115575GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAACCTCTTTGTAAATCATTTTAACCCTCCCTTTTTTTATT 1115648
1115649GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATCTTCCGGTTTTGGTTTGTGCCATACTGGGAATTCAAATACGA 1115726
1115727GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAACAGGACATTTTTCTAACATAACCTTACCTCCTTTTTAA 1115800
1115801GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAAAATTGCTCTATCCTCTCAAACTCAACTACTCTAAAT 1115872
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1116173GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAAAGAGAGGAGTGGAGGATTTATTCAATTTTGATGGTAATTTCGG 1116251
1116252GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAATACAAACCTCTTTACCCTCAGCACAAAGCTCTTCATATGT 1116327
1116328GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATCTTTTTTTTCTGGCATAATAACCCTCCTTTATATTTT 1116400
1116401GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAATAAGATCCCTGTCTTCTCCTATGATAATGAATTTTTT 1116473
1116474GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATATACAAAAGCCACTTTCCTTATAATAAGGACAATTTTTA 1116548
1116549GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAAAATGATTTAATTAAATGTTGATAGTTCAACCAAAAG 1116620
1116621GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATTGACACCTCCGTAAACTTTCGTATCGGCTGTATAATAGAA 1116696
1116697GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAGATCTAAATCTACCTCCCCTTCCCTTTTCTCTTTCAAATGG 1116772
1116773GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACTTTTTCATTTTTGTCCTCCTCCTTTTGATTTTTTATTTTTAT 1116849
1116850GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACACTTTTATTTACTTTTCCTCCGATTTCGTTCCAAATATTAAT 1116926
1116927GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATTAACATCTGCAAAATTTATAGGAATGTTAATG 1116994
1116995GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATTTGCCATTTCCTTTCTCATAAGTCTCACCTCCTTATTT 1117068
1117069GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAAAGTTGCTACTTTTTCAATCATAGTTTTCCCCCTTTTTAGTG 1117145
1117146GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACGCAGACTTTATGACATCAGAAAGTCTAATCTGAGAAG 1117217
1117218GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACTTCTGTCCAGCCCAGCCCTAATAATTTGATATTGATTA 1117290
1117291GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACCCTAAAAAATTGGGCAACTCTAAAAACTACTGAAAGAACAC 1117366
1117367GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACACTTTTATTTACTTTTCCTCCGATTTCGTTCCAAATATTAAT 1117443
1117444GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATTAACATCTGCAAAATTTATAGGAATGTTAATG 1117511
1117512GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAATTTGCCATTTCCTTTCTCATAAGTCTCACCTCCTTATTT 1117585
1117586GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAAAAGTTGCTACTTTTTCAATCATAGTTTTCCCCCTTTTTAGTG 1117662
1117663GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACGCAGACTTTATGACATCAGAAAGTCTAATCTGAGAAG 1117734
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1117808GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACCCTAAAAAATTGGGCAACTCTAAAAACTACTGAAAGAACAC 1117883
1117884GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACACTTTTATTTACTTTTCCTCCGATTTCGTTCCAAATATTAAT 1117960
1117961GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACCCTAAAAAATTGGGCAACTCTAAAAACTACTGAAAGAACAC 1118036
1118037GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACACCCAGAGAAAAGAATAATCAAACAATCTTATTAAAAATTA 1118112
1118113GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACATTAAAGATACAGCCTTCATCACTCCATAACCTTCTATAG 1118187
1118188GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACAATATTTTCTACTTTTTCAATTTTGGTATCCCATACTTTAG 1118263
1118264GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGACATATGTTTTTGCGGTGATTATTCCTTGACCTACTGATTTCA 1118339
1118340GTTGAAACCTGCCCTGGATCAAAAGGGATTGCGACGTATAAATTTCTTTGCTTCTTCAAGTTGATAGTTTAAATC 1118414
1118415GTTGAAACCTGCCCTGGATCAAAAGGGATTGCGAC1118449
Left flanking sequence : Till position 1115343 (length bp)
GTAGCTCAAAATAAATGTGTTCTCCAAGGGTAAATTTTAAAAAATTTAATTTGTTTTAATATTCACAAAT
AAGATTTTATAAGATTTACATAGTGTTAGG
Right flanking sequence : From position 1118449 (length bp)
TTGGGGATCAAAAAAGATTGCGGCCGTCTACTTGCAAAGTAAGACCAAACAACCTTCTTTGGTTTCTGAT
TTAAAAATTTTTAAAAATTGGTTATAGAAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp