Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015707_1                                                                                                                 top


Strain : Thermotoga thermarum DSM 5069 RefSeq :NC_015707 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015707_1
DR consensus (30 bp) : GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACNumber of repetitions :28
Begin Position : 1136555 End Position : 1138406

1136555GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACGTATTCAACGTATTCATTTTTGATTGTGGTTGGTCTT 1136621
1136622GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACTTTGAACTTTGAAGCTCTACACTCACACCATATAC 1136686
1136687GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACACGTAGTGGGATATACAGACGAGTGGCATATATTCAT 1136753
1136754GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACGTGTCTGGATGCGTTGTTGTTGTGTAAACACATCCATC 1136821
1136822GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACTTTATATCTTCTCTGTTACTTATGCCTACCCATGGGCC 1136889
1136890GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACATTCTCGTTCCATACGAAGTTTTAATTGGACCCACCC 1136956
1136957GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACTGTATCTGACAAAAGCAGGAATGGCTTGTGGTTTACT 1137023
1137024GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACTCGCCAGATACCGATATGACTTCGTTTGTTTTGACGCGCTT 1137094
1137095GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACAGTTGTTCAAGCAATTCTTGAAGCACTTCTGGATCAT 1137161
1137162GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACATTTTATATTTCTTCTACTCAACCGGTATGGTCTAT 1137227
1137228GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACGCGGATTTTGTTCATCTGTAACTTTAAATGCTCTTGG 1137294
1137295GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACACCGCAAAACTGGCAACCCTGGTTACCTGGTTGCCAA 1137361
1137362GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACAGGCGTCAGCCCGGGGTTATGTGGACGAGCTATTGT 1137427
1137428GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACTGCTTTTTGAAGCAGAGCCATGGTGATTGGTGTATA 1137493
1137494GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACAGCACTGACATGCTGTCCCTCCTTTCGTTTTTTGCGC 1137560
1137561GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACTGTTGTGCGATCGCTGCTATGACTTGGATTCTGTTT 1137626
1137627GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACTCTTTAGCTTCTCATGTAGCTCAGTAGGCAACCTTAA 1137693
1137694GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACCGCTTTAGCTTTTCCTGCGTAACGAGTGCACCTATA 1137759
1137760GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACGTACTTTTACACGCAAACCAATCTTCCGCCCAGCTTGGCACG 1137831
1137832GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACATTTCACAAATCAGCGGAACACTTGACGAGATTGCGT 1137898
1137899GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACGCTTTGAAACTGGCAACTTCTGTAACCTTGTTGCCAGT 1137966
1137967GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACGTGATTGTATCTGTTGCTTTACAATCGATTACTACGTCTG 1138036
1138037GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACGGCCTAAGGGCAATAAGGTTCTCACTTGCTTTGCTCGC 1138104
1138105GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAACACGTACAGTCTGCGATGATAATTTCCACCATCATTATG 1138172
1138173GTTTGAACCCTACCTATGAGGAATGGAAACTTGTATGTTTCGTCTGCTATTTCATTGAGTCCTTTCGCCAT 1138243
1138244GTTTGAACCCTACCTATGAGGAATGGAAACAAAGACTTAATTAGACACATCAACAGTTGGTTAGGC 1138309
1138310GTTTGAACCCTACCTATGAGGAATGGAAACCGCTTCACAGCTTCATTTTCCATCTTTAACTTCTTCA 1138376
1138377GTTTGAACCCTACCTATAAGGAATGGAAAA1138406
Left flanking sequence : Till position 1136555 (length bp)
AGTTATGCAAACATTCCAAAAGTTGACTTGACAAAAGCAAAAGTGATATAATTTGACTGGAATCCAAAAA
TGCTGGTATAATCACATATAGAGAAAACGG
Right flanking sequence : From position 1138406 (length bp)
TGCAATATGATCTTGCTATCCTTTCTTGAGAGGGTAGATACCTTGCTCTTGCAAATGTACAGCTTCAGCA
AGAAAAGGCATTCAAAAACTTCTTCAGAGA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp