Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015949_1                                                                                                                 top


Strain : Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A RefSeq :NC_015949 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015949_1
DR consensus (35 bp) : GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACNumber of repetitions :58
Begin Position : 1695607 End Position : 1699780

1695607GTTTTAACCCCTCTTAAGTGGAGAATCTTTTCAACCTCCCTTCCGATTTCTGCCAGTCCCCACACATCCA 1695676
1695677GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAGCAGGATTGGCAACCGCAGCGGTAGGCCCTCTTTTAAA 1695750
1695751GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGTATTGCAGGCGTAACAGAAGTTAAATCATACATAT 1695821
1695822GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACACATCATTATACGCATATACCACATTACTAGCACTT 1695892
1695893GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCCTTCTTATCGTCTGCCTTAAGCTTTGGATAAAATC 1695963
1695964GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAACCAAACCCGCCACAAGAGATGAATACATTAGAGCTTTC 1696038
1696039GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTTTATCTTTTCAGTTTTTATATATAATAAATTGTTTTAA 1696112
1696113GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAAGAAAAAATGGGTACTGAACATCCAGCATTAAAAC 1696183
1696184GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAACCAGATAACATTGTCGATTTCCCGTTTTTTCTGGC 1696255
1696256GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTCAATATCATCTGCATATAACGTATTTTGCTCTAAAT 1696327
1696328GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTGTTCCCTGCGATGTATATATGTCAATACCAAGTTT 1696399
1696400GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTCAATATCATCTGCATATAACGTATTTTGCTCTAAAT 1696471
1696472GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGCAGAACAGTAACTGTATCAAGCGGCTCTATTTTGT 1696542
1696543GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGAATAAAGGAGACAGAAAAGGCAGTACAGATAAGAAT 1696614
1696615GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTTAATTTGGCTTGAAGGAAGAAGAGTATTATTTATAC 1696686
1696687GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTTATTGTTGTTTGTACAACATTAAATGCCGCTCTTAC 1696758
1696759GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAACGTCTTTCATATCAGCACCGTCTAAAGCACCTGGCAAAATC 1696836
1696837GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTTTATAGAGGAGTAGACACCTACTCCTCTGTAGC 1696905
1696906CGTTTTAATCCCTTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGAGCTGCTGCTATACAGTTCTTCGCTAAACTCTGCCTT 1696978
1696979GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTACATAGATTTTAAAAACATAAGTCCCGAAGTTTTTAC 1697051
1697052GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTGTACTCGTTAGCTTTTCAATTATACTATCCTCATTCA 1697124
1697125GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTCATCATAAAGCACACAAGCAATATACTGAACATCC 1697196
1697197GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCCCTACTTTGCAATACCCTTAAAAAATCTGACAGC 1697266
1697267GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTCATCATAAAGCACACAAGCAATATACTGAACATCC 1697338
1697339GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAGAAAGAAGGTGGTTTAATATGGCACTAACTGCACAGC 1697411
1697412GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTAAAAGAAAAAAACGACAAATAGTAGAAGTTTGTTAT 1697483
1697484GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAATCGTCAAAACTTCACCGTGATAAAGTGATGAAC 1697553
1697554GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTAGTTATTGTTGCCTGCACAACACTAAATGCAGCTTTAAC 1697628
1697629GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTTCCCCATAGCTGGTCTTGCAGCAATAATGTATAAGC 1697700
1697701GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACATCATAACAGGTTTAAGACTATGTTTTGCAATAACTTCCTTGATGTA 1697782
1697783GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTTCTTGGGTTGGTGGACTTGTATGTATACTGTTATGA 1697855
1697856GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGGCAGTAGCACAGGCGGTTAAGAGTGCGATTGCAAC 1697926
1697927GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGCCAAGGACAGAATTTATTTACCAACCGATTTATG 1697996
1697997GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGTATTTTAGAAATGTATCAACACAAAAAAGCCAAGCTT 1698069
1698070GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTTCAAAGAAAAACAAGCGAGCAACAAGTTGTATCAATT 1698142
1698143GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACACCGCCCAGCAAAACGTTCATCGCTCTTATCTTTTCC 1698214
1698215GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGGAAAGAGTGGTTTACAGTGTCCAATCAAACGCTTC 1698285
1698286GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCGAACAATGTCCTTGTAAATACAGCTACCAGATTAAAA 1698358
1698359GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTTGAGGTAAGAGGAGCTTCGGCTCTAACCGCAACATATGG 1698433
1698434GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTGATATGCTTTTAAAAGCTGAAAGGCAATGTTAAGTT 1698505
1698506GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAAAAACTAAAACCAATTAACCACAAGATTTTGGCTATTAC 1698580
1698581GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTGAACAATCACTCAAATAACACTTTATTTTTCCTTTC 1698653
1698654GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGATTTTAATCACTATTTTAGGCACTTCGGCATAGCGTT 1698726
1698727GTTTTAATCCCTCTTTAGGGAAGAATCTTCCCAACTCCGCCAGAGCCACTTGTTATTGGCTTCAATGTTCGA 1698798
1698799GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAATTACAGAACGGCATATTGGAACAGGAATTAAAGC 1698869
1698870GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTTGGTTTAAACTTCTTAGAAAGTCTGGATTATAGT 1698939
1698940GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTATGAAATAATACACCCTCGCAAGCCAAAACGAAAGAT 1699012
1699013GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTTCAAAACGAGAAGGAAGAATATTAGAAGGATTTGACC 1699086
1699087GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACGTTGCAAGAAAAGTTACTGTTAGAACGTTTGTAGCTTATA 1699161
1699162GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTACACCTTCAAGAATTGTCTCTTCTTTTGACATTTTAT 1699234
1699235GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTGCCACGGGAGTTTAGGATACTCTAACCCTTCATTAAT 1699308
1699309GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTTATCCCTTCCCATGCACCTTTCCAATCACCTTTAATAAT 1699384
1699385GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAACTGCCAAGCGGAATTGGTATTATTGAGCTGGTAGA 1699456
1699457GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACCTTCAAAACGAGAAGGAAGAATATTAGAAGGATTTGACC 1699530
1699531GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAGCTCTTTTATTAAATTTGTCCATGCTTGATAATATTT 1699603
1699604GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACAAGCTGATTTTCACTACAACGTTACCAACCTTGACG 1699674
1699675GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAACTGCAAAACTTTTATCTTTGCTATATCTGATTGTTCT 1699745
1699746GTTTTAATCCCTCTTAAGGGAAGAATCTTCCCAAC1699780
Left flanking sequence : Till position 1695607 (length bp)
TTTAAAACTGAAGCTCAGTAAAAGGAAAATTTCAAAAATCCAGCTTACTATCTTTGCATGATGTCTTCGC
AGCAAGGTGTATGTCTCCTTCTTCACAAAG
Right flanking sequence : From position 1699780 (length bp)
AGCGCCGATTGTGAGGCTTGAAAAACCTTGATTTCTAGTTCAGTCTGCGATTTGAAAATATAAAAGTTTC
CTTCTCGCAAAAAATTTTTAAGCATAATAG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp