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CRISPRs details
NC_016001_11
Flanking alignement tool
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NC_016001_11                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium branchiophilum FL-15
RefSeq :
NC_016001 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_016001_11
DR consensus (36 bp) :
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
Number of repetitions :
38
Begin Position :
3018429
End Position :
3020821
3018429
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
ACGATTCCGAAGAGGCAAAACAATAT
3018490
3018491
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
AATTCGTGGTTGATACTAAACCTGCGAG
3018554
3018555
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
CCAAAAAGGAGAAACCGCTTATGTCTTT
3018618
3018619
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TGGCAAACCGTACGTGTCCACAAATT
3018680
3018681
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
AGGTCTATAATTTCATTCAGTAGTTT
3018742
3018743
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TTATATCAGGTAGATCATTATTTGCAC
3018805
3018806
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
ATGGTAGCCAAATTGCTATTAATGGTT
3018868
3018869
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TAATAGCAATATGTGGGATTATGAAT
3018930
3018931
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
ACAGGTGTTAAAATCACTGTATAATTT
3018993
3018994
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
AGCAAATGCCTTTTTATCAATAATCAT
3019056
3019057
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
AACCCAACCTGTTTCTTTCATTTCAA
3019118
3019119
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TACCCAGTAGTCTCCCACTAAATCATA
3019181
3019182
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
ATTTTTAAGTCCACAAAATCAGAGGCT
3019244
3019245
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TTCACAACTTTGCCACATTCTAGTGCAG
3019308
3019309
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TTGCCGTCATTAAACCTTATTCCAGGTA
3019372
3019373
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TTTATTTTAAATTCATGGTTCAAATGATA
3019437
3019438
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TCGCATCGTATAGTTTTATTTCATTCAT
3019501
3019502
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
GTAATTGCGGTATTTTTGTATGCAATTTTTAA
3019569
3019570
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
AGTGGATGCAAAAAATAAAAAACAAATAG
3019634
3019635
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
GGTGGTGCAAACATTTATGAAGTAGGCA
3019698
3019699
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
GATATACGTAATTGTAATGACATCGAT
3019761
3019762
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TAGATATACGGTTACGGTTTGTTTTTTGT
3019826
3019827
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
ATACTCGCAAATCTTAGTCGTTGGAGT
3019889
3019890
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
GATTGCGTGAGCGTGGGCGAAGTACTCAATG
3019956
3019957
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TGTACAGCATATTGAAGATAGTAGAAC
3020019
3020020
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
ACCCTCAGCTTTGTTTCGCTGTCGGCT
3020082
3020083
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TAAAACAAATCTGTGTATTTTAAAAA
3020144
3020145
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TCCTGAATACTTTTCTGTTTTAAAGAAA
3020208
3020209
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
ACGAGAATAAAGCATTCTCATGGATTCAA
3020273
3020274
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTTTTGTAGAT
ATCTTTAACACCAGCGCAGAAAAACAT
3020336
3020337
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
AAAGAAGTATTTACGGTCAATACTGTACA
3020401
3020402
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
AGGGTTGTAATTCAATACCATAACCATTT
3020466
3020467
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TGTAAATTATTACCAACCGCTATCCAT
3020529
3020530
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TAACGATATCACCTCTACCGAATTGGTG
3020593
3020594
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
GTAAACGACCGCAATCGTCTAAGGCTTC
3020657
3020658
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
ATTTAATGGGTTAAAAGCGTCTTTTGCTT
3020722
3020723
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAT
TTCTCGTGAAAAAAAGAAAGATGCCAC
3020785
3020786
GTTTAAAACCACTTTAAAATTTCTACTATTGTAGAA
3020821
Left flanking sequence : Till position 3018429 (length
bp)
AAAAGGCATGAAAACAAGCTTTCGAATGCTGTTTTTTTATTTAAAAGCAACCAAAAACGGTAAAAAAGGG
TTGTTTTTGTGTCATTTTGGCAGTGTTAGA
Right flanking sequence : From position 3020821 (length
bp)
GAAAATGCCACAGATGCACAGATGTTTTTTTTTAAAACTCGAATTTATACTATGGGGTTGTGGTTTGTGG
TTGATGGTTTGTGGTTGATGGTTGATGGCT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp