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CRISPRs details
NC_016001_5
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_016001_5                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium branchiophilum FL-15
RefSeq :
NC_016001 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_016001_5
DR consensus (36 bp) :
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
Number of repetitions :
29
Begin Position :
1899989
End Position :
1901917
1899989
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GATGTTTGTAGAATAGAGTCAAACCCTTAT
1900054
1900055
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TTCTTAAAAAGAAAAAATAATGATTAGAAA
1900120
1900121
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TAGTTCCGTTTTCATATTCTTTTATAAACT
1900186
1900187
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ATTGAAGGGTTTTCATTAACAACTGAAAAA
1900252
1900253
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CTGTATTTGCCTGAAATGGCATTTGGAAAT
1900318
1900319
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AATGGCTATGAAGAAACTAAGATAGCCAAA
1900384
1900385
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGCCTGTGGTGTGTTATTATTTGTCGGAAA
1900450
1900451
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GCTAATACAGTTGATACAGCCAAAAGATTT
1900516
1900517
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TATTTGAACTCCATTTTGGAAACTTCAAGC
1900582
1900583
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GTAGGCCAAAACAATTGCACCAATAAAACG
1900648
1900649
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GCTTGTAATCGCTTGAATTAAAGCGTTAAA
1900714
1900715
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ATTCTCACAATTTGTGAGTTTTTCTTTGGT
1900780
1900781
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ATTTAACGAACTTAATGTTTTAGCACAATC
1900846
1900847
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GGGGCAAATATACAAACACTTGCAAGTATT
1900912
1900913
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACCCCAACGTATCGGCAGCTGCTGGTATG
1900977
1900978
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TATACATAATAACATCGAAAATCATGGCGA
1901043
1901044
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CCAAGTGCCGCCCACACCATCGGGCGTAAT
1901109
1901110
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TCGTCCTTAATTTCATTTTCTTTTTGCTTG
1901175
1901176
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TATGGCTCCTGCTGGCACTTTTATTTGAG
1901240
1901241
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GGATGCGTTGGATATTAATTTAATACTAGG
1901306
1901307
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACGCCAGCTGCTACGGTACATGTTGCCCCA
1901372
1901373
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GTAGGCCAAAACAATTGCACCAATAAAACG
1901438
1901439
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GCTTGTAATCGCTTGAATTAAAGCGTTAAA
1901504
1901505
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GGGGCAAATATACAAACACTTGCAAGTATT
1901570
1901571
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACCCCAACGTATCGGCAGCTGCTGGCATG
1901635
1901636
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CCAACGAGCTACCAGACTACTCTAACCCGC
1901701
1901702
CATATCGTGTTTTCTAATTTTTAATCAAACCACAAC
ACTAAAAATGTAATTATTAAAAAATATGTT
1901767
1901768
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAATAAATTC
ACAAACACACCTATAAAAAATATTATTTTGGTGTTTGTAAACCACAACTCAATACCGTTGATTTTCAAAAAATCTGAA
1901881
1901882
CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAATAAATTC
1901917
Left flanking sequence : Till position 1899989 (length
bp)
AAAAATGCCTCAATATAGGGTTATCAGTCCTATAAAGAGGCATTTTTTATAACGATATTTACAATTAATC
CCTTGAATATCAGAAGGCAACAAGCCAACT
Right flanking sequence : From position 1901917 (length
bp)
ACAAACACACCTATAAAAAATATTATTTTGGTGTTTGTAAACCACAACTTTAAAATTGCCACTGATGCAC
AGATTACTCTTATATCGTCTTTGTGGTTTG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp