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CRISPRs details
NC_016510_1
Flanking alignement tool
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NC_016510_1                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium columnare ATCC 49512
RefSeq :
NC_016510 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_016510_1
DR consensus (36 bp) :
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
Number of repetitions :
44
Begin Position :
391567
End Position :
394479
391567
TATAATTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTACT
ACTATGTTGGAAGAATTTCACGATAATGTG
391632
391633
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTATT
ATTTTATTTTTTTCAAAGGTCAAGGATGGA
391698
391699
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTATA
ATATTTTCTTTACTGATGAGACACCCTTA
391763
391764
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTCT
TCTGTTAATAATAGTAATCCCGTTTATATGGTTGTGGTTTACAAACACCAAGTCAATATTTGTTATAGGTGTGTTTGT
391877
391878
TATAATTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTGT
TGTTGATGTTAGTGAAGCTTTGAATAATTA
391943
391944
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGCC
GCCAGTTGGCACGTTCTTGATCAGTAAGC
392008
392009
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTATC
ATCTAATTCCAAAACATTTATTACATCTTG
392074
392075
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGAA
GAAAGACGTGAAGTTGAAAAAAATCGGTAC
392140
392141
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGAA
GAATACCAGTCGTTCTTCCCTCACCTTGAA
392206
392207
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAA
TAATACTGATTTATTTCGAGTATCGCCCGT
392272
392273
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTGA
TGATTTAGGTATTGATTTATCAAAAGACAC
392338
392339
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCGG
CGGTAACGTTTGCCCGCTAGTTTATAATAA
392404
392405
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTTA
TTATGATGCGTTACAAAAAATGTTTTTAAA
392470
392471
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCAT
CATGCAGATGTTTTTCTACAAATTCACGA
392535
392536
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTTA
TTAATTGCAGAGATAGATTTTAGATTTTGA
392601
392602
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAAG
AAGGTATTTATTTTTTTGAAAAAAACTTAT
392667
392668
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGAA
GAAGAAAGATTCAGTATCTAAAAAAGATAT
392733
392734
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGAT
GATCAGGATTAACTTATAAATCGGACGAT
392798
392799
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAT
TATTAAAAAATGTTTAGTAATACAACTATC
392864
392865
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAAC
AACAAAAAAAAAGGAGGTACAGGATTTGTA
392930
392931
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTTA
TTAACCTAAAAAATGACTCAAATAAACATT
392996
392997
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAAT
AATTCCTCAAGGTCAATTTTACATTCGATT
393062
393063
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAAT
AATCAAAGGTAAAAATAAAATGACTTTACA
393128
393129
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCTG
CTGTTAATGCAATTGCAAACGATATAAAA
393193
393194
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTTT
TTTTTATTTTATTTATATAAATGTTTTCCA
393259
393260
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAAT
AATGTTTTAGCTTCTAACGCTGCATTATCT
393325
393326
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCAT
CATTACAGGTTTATAATCAACTGGATTAGA
393391
393392
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAT
TATTAGAAGAAACACGAGCTTGATCCATA
393456
393457
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTACA
ACAGGAGTTTCTGAGCAAACCATAGGTAAA
393522
393523
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTACA
ACATTGCGTTTCTAACTGAATTAACAGCGC
393588
393589
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCTT
CTTTTTTATCTTGATAAGATAATTCAATGT
393654
393655
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGTA
GTAGAAATGAAATAAAAACAATTAAATTGA
393720
393721
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAAA
AAAGCTTTTGCTTTTGCATTAAATTGATTA
393786
393787
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAA
TAAAAGACTATGTGAAGTGGTTAATGAAGA
393852
393853
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCCT
CCTTAAAAACAAAGTGAACTAATGGAAACC
393918
393919
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAGA
AGAAGAAGAATTACGTTATCCTGATTTGAA
393984
393985
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTCAG
CAGTGAACGCCATTACGGCACAATTGACC
394049
394050
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTATA
ATAATTGTTAAACCATTAGGACCAGTAACA
394115
394116
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGCA
GCAACTCCAGAAGTCATCCTAGAAACAAC
394180
394181
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAT
TATTCACTTCTACATTTCCGCCAAACAAAG
394246
394247
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTTAA
TAAGAAGCTAAACCAATAATATGAGCTGTA
394312
394313
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGAT
GATGTAGAAATACTTAGCGATAATGTACT
394377
394378
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTGCC
GCCAATTCCGCAAAGAATGAAAACGGCAAG
394443
394444
GTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATTAGC
394479
Left flanking sequence : Till position 391567 (length
bp)
GAAGTCAAAACACGATATTATTTGGTTAAAAATTACGATTGTAATTTCAGTTGTGGTTTACAAACACCAA
GTCAATATTTGTTATAGGTGTGTTTGTGAT
Right flanking sequence : From position 394479 (length
bp)
TAACAGCTTAGTTATTAAATATCAAAGCATTAAGCCGAAATATCGTTAAAAAAAATGCTTCTTTTTTGGC
ACGTTATACCAAGATTGAAGCATTTTTTTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp