Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_016610_4                                                                                                                 top


Strain : Tannerella forsythia ATCC 43037 RefSeq :NC_016610 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_016610_4
DR consensus (30 bp) : CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACNumber of repetitions :73
Begin Position : 2508338 End Position : 2513170

2508338CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACACAGAAACTTCTTTTCCTGCAAGATTAAATAATACA 2508403
2508404CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGGTATGTATAAATCTACACGTCTTGGGTTTTCTAATA 2508470
2508471CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACAAAATTATCTTTGATAACTTTAAGAATCTTTTTGTCTTCT 2508540
2508541CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCCATTACTGCGCGGGCGGCGATGCAGGAGAACCCGGACCG 2508610
2508611CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTAAAAGGTTAAAAGTTAAATGAAGAAAGACATAAAACGA 2508679
2508680CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGTCTTTGGAGGCCTTTACTCTTTTAAAAATGCCCGA 2508745
2508746CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTCTCTTGTGTAGTTATAACACACAATTGAGTCAT 2508809
2508810CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCCTCTTCGTAATACGGCTCTATATCGAGCTCTCTG 2508874
2508875CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCCCCGAAGGCGCGGCCGTTCCACTCTAAGGTGTCGACT 2508942
2508943CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGTTAGATGATAACTTCCGTCTTCTCCGAGCATCATC 2509008
2509009CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTTCACGGGGGTAAAGCCCGCCCCTTACGGGGAACTA 2509074
2509075CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACAAAAGATTTGCTATATTGTGAAAAATTTAAAAAAAAG 2509141
2509142CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTTCACGGGGGTAAAGCCCGCCCCTTACGGGGAACTACTC 2509210
2509211CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTGCAGCCGTTGTCTCGCAAAAAGCAGCGCCTTCTAAAA 2509278
2509279CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCCTGCCCTGCGTGGGGGCTTTGGTGTGCGCAGCCTG 2509344
2509345CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCTTCAAAAGCGGCAGCGCGCTTTTTGAGAAGGCGCTG 2509411
2509412CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTTTGTGTTATACGGAGATTATACACGGTGGGTGTGGG 2509478
2509479CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTGCGCGCATACGTTCTTCTACGTACGCCTTTTTGGTT 2509545
2509546CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACAAAAGATTTGCTATTTTGTAATAGCAAAGAACTATGAA 2509613
2509614CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTAAGAGGTTATCTCCGTCCGCACGAGTTCGGACGT 2509678
2509679CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCATACGTTGCACGAATGTCCGCATCAAAAGCGGCAG 2509744
2509745CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGTTATTCTCCCAATCACCGAACCTGTCAACAAAAGA 2509810
2509811CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCTATAACTGCAGCCCGCACGGCTGCACGGTTGGCGTAC 2509878
2509879CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGTCTGGTCGTTTTTTCTGTATTGGGGGGGGCGGCATT 2509945
2509946CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACACGTTAACACGTGCACCGCCAACGCGGGCAGAAAAG 2510011
2510012CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCGTATCTGAAACGTCCGAATTGGTGCGGACGGAGG 2510076
2510077CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGCCACCACCGACCCTGCACGGGCGGTTTGGCTCGCG 2510142
2510143CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACACATAGCAAACCTTGTTGGATAATATTCTTCGTCTAT 2510209
2510210CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGAACAATAACAAACAGGATTGGGCGATCATACTTTT 2510275
2510276CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCTCGGATTTATCCATTACGTCGGCCGCATCGATTTG 2510341
2510342CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCCAACGCGGGGAAGAAGGCGGATGAGGTTTCGGAACAA 2510409
2510410CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCGCCGAGAAGGTCTCCGTCCTCGTCAAAAACAGACTC 2510476
2510477CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGCTCGGGGATCGATATAATAGAATGGTAGAGGAGTGG 2510543
2510544CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTACGGGGTCACCTCCGTTCGCATGAGTTTGGACGTTTC 2510611
2510612CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCATATAACAGTGCGACGAGACAGGCTGCGCACACCA 2510677
2510678CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGGGGTAAATCATGTAAAACGAACAATTTTAGAATATA 2510744
2510745CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCGTAGCGCTATTATGCGCGGTATGGCGCGGCTCTGC 2510810
2510811CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCTTGCAGTAGGGGCAGTGAAAATTACACGACCCGAA 2510876
2510877CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCTATTACCGCCGCCCGCACGGGCGCACGGCTGGCGTACG 2510945
2510946CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGAATAAAAATCAGCGTAAAAACATATATGCTTACACGA 2511013
2511014CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTTTTTTGTGGCCGTTTCGGCCTTATCTGTATCTACTGT 2511081
2511082CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACAGCCGACGCGATATATTCGTGCCCGGCAAACAAATC 2511147
2511148CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCGCCGTACACGTGGTGATATTTATGAAACAAATTTT 2511213
2511214CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATGATATATTTTTCTAAACATTTTCATGACTTTATCGG 2511279
2511280CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATTGATAACTTTTAAAGTCTTTTTATCCTCTGCATTCA 2511345
2511346CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATATTGTACACCTTGTCTACTTGCTCATCAGGGAAATTC 2511412
2511413CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATGTAATCCTCACACTGCCGATTATGGCTGAGTAATCTA 2511479
2511480CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATAGTTGATGCAAAAGGTTTATCGAAACACCTTCCTTC 2511545
2511546CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATCCTTATCTCAATGGTTTAAGGAAGACGTTGCGCGCAT 2511612
2511613CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATAGCCTATCTAAACGCCAAATAACTAATTTGTCTCCT 2511678
2511679CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATTCGGTTTGGTGATAGTTGGTAACAAGATTTTAAAACA 2511745
2511746CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATATTACATCAGGATAGATGGTGTGGCGTATGAAAA 2511809
2511810CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAATGAAGCTGGTAACCGCGGATGTCGCCTTCGGCCTCGAA 2511876
2511877CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCCGCTACCCAAAAAACCCTCGACAAAATGCCCGAAATC 2511944
2511945CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCACTGGGGCACATAGTCCTGATCTCCTCGGCGAGTAT 2512011
2512012CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGAAAAGTGCTAATGGTAAAGTTAAACTTTCTCCTTTA 2512078
2512079CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTTAGATGATCTTGCGGACTACAGTGCCGAATTTGA 2512143
2512144CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGCAAACGGGGCCTTTTGTGCCATGTCACCAGTGCGG 2512209
2512210CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACAGAGACGTTCCTCCTGCGTTGTACAAGATACTCTGTA 2512276
2512277CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACAATTTAAGTGATGATGTAAAAACTGGTATTAATA 2512340
2512341CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTTAGATGATCTTGCGGACTACAGTGCCGAATTTGA 2512405
2512406CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTTCGCAATCGCTTCGACGGCAAAAGTGCCGCCCAGG 2512471
2512472CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACTGTTTATGTACGACTCTTTCAGTTTTAACTGCTTT 2512536
2512537CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGATATAATGCTTACAATCGAGGCATTTAATAACATTAAA 2512605
2512606CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCAATGTGTACGTTGTCATTGCCGGTATATTAGGATTCTT 2512674
2512675CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACAAGTGCCTTTGCCGTTAATTTTGTCAATGAGTTTC 2512739
2512740CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGCGAAATCCTGCTCGTGCAGGGTGGAAGCAAGAATATC 2512807
2512808CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACAGCGTCATAGCATTCACACCGGCAGCACCAGTTACGAA 2512875
2512876CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGTCGGACACGATGGGCAGAAATTCTTCTTCGACCATG 2512942
2512943CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCCGTTAAATTGTCTGGCAAGGACGTGACGCCGGTA 2513007
2513008CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACCGTTGTAGAAATCGTCTTCGTTGATAACAAGTGTTA 2513073
2513074CTTTTAATCGGACTATCATAGAATTGAAACGCTTCTTCGATTCTTCTTTTACCTCTCCGGTTTCCGT 2513140
2513141CTTTTAATCTGACTATCATAGAATTGAAAT2513170
Left flanking sequence : Till position 2508338 (length bp)
TTCTTACCTTTGTGCTTCGACAACTTTGTTTGTTAATTTGTTGATATAATTGAAGGATAGATTATTGAGA
ATCAGTAATGTTTTTTGTCGTTTCGAACGG
Right flanking sequence : From position 2513170 (length bp)
TGTCGTTTCAACTACTGAATGCAACTTTATGTTTCAAATTTAAGAAAAAGATTTCTTCTGGAGAATAGAA
ATTGAGTTTGTATTTTGGTCTTTCGTTGAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp