Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_016627_6                                                                                                                 top


Strain : Clostridium clariflavum DSM 19732 RefSeq :NC_016627 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_016627_6
DR consensus (29 bp) : ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACNumber of repetitions :56
Begin Position : 3016571 End Position : 3020204

3016571ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACACCGACTTCGAAGTTATACTGGTCGTTTTGACAATG 3016635
3016636ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTGAAGTATAATTGTGCATTTTTGTTCTTTAAGAAG 3016699
3016700ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGTTGACAGCTAGCACTAGTTATAATGTAATAATTGT 3016764
3016765ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGAGCAATGGAAAAACTGCCTCGAACCTCATAGATGA 3016829
3016830ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTCATGTTCTTTACAGCTAAATCTTCGCTGATTATTACT 3016896
3016897ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTAACGGATTAATGAAAACCCCGAACTGTTGGTATAA 3016961
3016962ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCGGATATGTGCCATCCTTGACCTTCTCCCAGACATC 3017026
3017027ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTAACTTCTTTATTTTTAATTGCATTTCTCCAATAATC 3017093
3017094ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGTACAGGAGTAAAAATGCCATTGGGTATAGCTACT 3017157
3017158ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTAACTTATACAAAATTAAAAGACTTTCCAAATGG 3017221
3017222ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTGAAAAAGTATCAGATATGAATATTTTAATACAAAA 3017286
3017287ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGGTTCCTGGTGTAGGAGGTAAAGGCATTAATATTA 3017350
3017351ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTAATTTCAATCATCTCCTTTTTTGTTATATAATA 3017414
3017415ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTGAGAAACTGGAGACAGAGATTGCGGAACTAAAGAA 3017479
3017480ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGGAATATGAATTCAGACCTAAAAATGCAGAATTTGTCAT 3017547
3017548ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTGAAGACCAGACAGTCTTCAAAGGAACAGCAAGATATGA 3017616
3017617ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGAAATTGTTTTTGTAATCAACCAATATGATTATTC 3017680
3017681ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTTGTGGTTCTGGATTTTTATTAATCCTTCATTTTT 3017745
3017746ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGTTCTTGAGTTTGTATAGACAAACTTTTAAATTCTCC 3017811
3017812ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGAATATGTTGGAGATGGTTATACAAGCAGTTGAAAA 3017876
3017877ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTGGCTTGTAGCAAAGTCATATATTCCAACAATATC 3017940
3017941ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCTTTTGTTAGGGCGTATAAGCCGTATTTTGATGATAC 3018006
3018007ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCAACCATCCACACTGTCGACTTCTCGACCAATCCAC 3018071
3018072ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTATGATGGTACAAAGTGGTTCTTATCCCAATATGATA 3018137
3018138ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGCGATATAGTCAACACCCTTCGGCGTGACGAATGTC 3018202
3018203ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGACCCTATAAAAAGCATAAGTTCATATTCATTTTC 3018266
3018267ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCAACATAGATTATACAAATCCGAAGGTCCACGAGA 3018330
3018331ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTAAAAATATCAAATCCAGATGCTAAGCCAGAAGAAAT 3018396
3018397ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTATAGAATAGCTTTGTCTACTGCAAGGCCAATAGAC 3018461
3018462ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGTATTCGTTCTCAAAATCATAATCAATATTCTGCGT 3018526
3018527ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTCTTTTTTATTTGACAGTTCTTAAAAAAGATGTTAAAC 3018593
3018594ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCGGTACCAAAGCCGTGACAGTGATACCGGCATGCCA 3018658
3018659ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTTAGAAAATAAGATATATTCTTTAATGTCTAAGTT 3018723
3018724ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCGGCCCAACTGAATGTAACCAGTCTGAACTCATCTA 3018788
3018789ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCTTTGAGTCCTACAGATACGCTTGAAGTTACATATAT 3018854
3018855ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACAAGGGATAACGGCTCAGGAGGCAGAGAATATTGACC 3018919
3018920ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACACTTCATATTCGTCCGCTGTAGGATGTGCCATGTGG 3018984
3018985ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGGGGAGTCGAACCCCTCGCCTGTTCTGTTTGGTAACGT 3019051
3019052ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCTTAAATTGTTGTCATAGATGTACTTCCAAATGTCA 3019116
3019117ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTCATATTTTATAAACGCAGTAAAAAAAGCCTGCACA 3019181
3019182ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTCAATTTAAAGTTAAATTTTCCGCAGTTTAATTTTT 3019246
3019247ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGACAACCCTAAACAAATGGAAAGTGATGCCCAAGAAT 3019312
3019313ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTCAAAGTTAGAAGATGAAAACATCGAAAGATTTAAAGT 3019379
3019380ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCGTTATATGTATGCAAGACAACGATAAAGGTTATCT 3019444
3019445ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTGTGCCGACTCTATTGGGAGCAGTGCAAAAGCTAA 3019509
3019510ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACAGTGACATTATGCCGCTCGGAACTGGAATAGTTCTTTTAC 3019578
3019579ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTGATGTCAGGTTTATACTGCAGAACGGAGAAATTC 3019643
3019644ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGAAAATGGAAGAAGCAAAAGTAATTCAAGCATTACA 3019708
3019709ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTGGGTAAAAGCTTGGGATGGAATAAAAAATATATTTTT 3019775
3019776ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGGAGTAGCATGGAATAATGGATATAGAATTTCTTCGAC 3019842
3019843ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCTGAAACGGTCCAGTTTATGCACAATCACAGCACCAAAC 3019910
3019911ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACTTTAAACTGCTTGCACAAAAGGCATAAGTGTTTATT 3019975
3019976ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACGAGCCACCAGCACATACAAAACCTACACCATCAAG 3020039
3020040ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACAGGCAAGTCTAGGAAAACCTCTGAAGCGTTGACGCCCTTTCCC 3020111
3020112ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAACCTAGACGATATTGATATTTATACAGGTCCTGGTCC 3020175
3020176ATTTACATCCCACATAGTTAAAGAACAAC3020204
Left flanking sequence : Till position 3016571 (length bp)
CTCGTTTTCATAATTCTATTCTAACTTATTTTGACCGTTTTGTCTGTCTTAATTTATGGTATCATTATAG
TCTGCAAGTATTAATGCTTTCTGTGCTATT
Right flanking sequence : From position 3020204 (length bp)
CCCATTTTCAACAATTCTAAAAAGCTCTATTTTATCCCTTTTTTATAGGATTCATGAGCCTTGAAATCAA
ATAAAACTGCAGTAATCTTCCAATAATGTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp