Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017174_6                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile M120 RefSeq :NC_017174 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017174_6
DR consensus (29 bp) : CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :45
Begin Position : 2152896 End Position : 2155826

2152896TTAAATTCACCACTTAGTTAATATAAAGCGTAATTTTGGAAAAAATAATTACAGAGGTAATACAAC 2152961
2152962CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAATGAGGCGTTTTTTTCTGTTCCGACTCCTGTTCCTGTAT 2153027
2153028CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACAAGGCTATACAGGATGATAATTTAAAAGAAAACTTCA 2153093
2153094CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACAGTTCAGTTGGAAATATAATTGTAGAACAATACTCTA 2153159
2153160CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTCATTGATGCTAACTTAAGTATTCCTTGTTTTTGTGA 2153225
2153226CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACAAATAACTTAGTATGTCTAAATACAAATTTTAGACCT 2153291
2153292CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTAATGATGAAGGAAAAGAATATGTAGTATATGAATAT 2153358
2153359CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACAAGTTCTATATACAACTGTGCAAGTTCTGAATTAAT 2153423
2153424CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTAACCCTCTTGATAAAACAAGGAGGTATTAGATGAAA 2153490
2153491CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGATACCGAAGGTAATTTACTTGCAATATCTAAATAC 2153555
2153556CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGCGGTAAAATGTTAGATAAAACTGTTACATTTACAAA 2153621
2153622CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTAAGTTTGAACACACTTATTTTCGACCCCTCAATACA 2153687
2153688CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTTTTGAGTATGGAGATAAAGTAAAAATTATACTTCC 2153753
2153754CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTAGCGTTGATAAAGATTCTATAGTAGTGAGAGGTG 2153818
2153819CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTAAAAATTGGGATATAATTCATCAACAAATTTAACATA 2153885
2153886CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACATTATCCTTCATGTGCTTAGCTCTTTTATATTTTTT 2153950
2153951CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTCTAGCTATCCAGAAACTTATAAACCTGCTCCAGATTC 2154017
2154018CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGGATATGTTGAAGGAACACATATGTTGCAACAAACCA 2154083
2154084CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTAGCAGGAGATGATAGAGGGGTATATCACCAGGTGAT 2154149
2154150CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGTTTTTCTTTATTAGATAAAAGTTCTCCGTCGAATCT 2154215
2154216CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACAATCATTCCTTTTGTTTCATCTTTAAGTTTTACGAC 2154280
2154281CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTAGTAAGCATAATAATTGCTTGTGTGATGATTTGTTT 2154347
2154348CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACAAAAAGAAACTACTTTGTATCTTTATGTTGGAATAGA 2154413
2154414CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTACTTCGTCTTTTTTGATTTGAACGTCTTATTTTCTT 2154479
2154480CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGAGATTTTCATATAGCCATAGACTGTTTTAGTTTTT 2154544
2154545CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTGCTTGTGCTGTAGGTGTTCCTTGTGCTGTCATAT 2154608
2154609CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTTAAATAATACCTTAGTAGAATTATCAGAGAAAATAA 2154675
2154676CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTCCTAAACCTTCTATCTTCTAAACTCTCATTACTTTT 2154741
2154742CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACATGATAATAATGTAGTGAAACGAATAGCAAAAGAGTT 2154807
2154808CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGAGGCAGAAATAATTAAATCCACAATAGATTTAGCTATA 2154875
2154876CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACAAATCCCTGCAACTGTAGTTGGTTGGGGTTATAATGA 2154941
2154942CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTAATGAAGGTAGCGTTAGTACCAGGACATACACTAAC 2155007
2155008CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACCAGTAGCTAATTTACTTAATCTATAAGCATCAACCTC 2155073
2155074CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTATTTAAATCTGATGAATATACTGCTCTTATTTGCCG 2155139
2155140CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTGTTTGAACATGACTTTGAACATGTTTGTCTTTCTT 2155204
2155205CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACACTAATTTAAAAAACCACCCACTTGTAGATAATGCAG 2155270
2155271CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACCAAAGTATAGGTCAGCATATAAACCTAAAGTGGAAGA 2155336
2155337CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGAGAGTAAAGATTGTGATATAGCATACAAAAATTGGT 2155402
2155403CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTAATTGATTGTTGAGTAAATCCTAATTCTTTTATTT 2155468
2155469CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTAGTTTATTGTGTGTAAATTCTGCTTCAAAACTTATTT 2155535
2155536CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTCCACTCCAAGAATTAGGAATAGCCTTGCTTTCACT 2155600
2155601CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTCTATGACCTATTGGTGCTAATCCAAGACCTTCTCCA 2155666
2155667CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACGCTCCTCACCTCTTAATACGCCAGAACTCAACCCT 2155730
2155731CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAACTTCTTTAGGAATCATCAGTATGGATGAATATCAGTCTA 2155797
2155798CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC2155826
Left flanking sequence : Till position 2152896 (length bp)
ATCATCTTTTTATAATGATTTTTATAATATACTATAAATTTAAGTTTGTAATAAAAAAAGTTACAATAAA
TAGAAACATTCTTGTACTCATTGTAACTTC
Right flanking sequence : From position 2155826 (length bp)
CCCAAAATAAACTTAGCATTTCCAACACTTACACATATGCAACACTCTAAAATTTGCAGTGAGCGAGCAG
TGGTGCAAATGATAACACTTATCATACATC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp