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CRISPRs details
NC_017174_6
Flanking alignement tool
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NC_017174_6                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile M120
RefSeq :
NC_017174 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017174_6
DR consensus (29 bp) :
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
Number of repetitions :
45
Begin Position :
2152896
End Position :
2155826
2152896
TTAAATTCACCACTTAGTTAATATAAAGC
GTAATTTTGGAAAAAATAATTACAGAGGTAATACAAC
2152961
2152962
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAT
GAGGCGTTTTTTTCTGTTCCGACTCCTGTTCCTGTAT
2153027
2153028
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
AAGGCTATACAGGATGATAATTTAAAAGAAAACTTCA
2153093
2153094
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
AGTTCAGTTGGAAATATAATTGTAGAACAATACTCTA
2153159
2153160
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TCATTGATGCTAACTTAAGTATTCCTTGTTTTTGTGA
2153225
2153226
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
AAATAACTTAGTATGTCTAAATACAAATTTTAGACCT
2153291
2153292
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TTAATGATGAAGGAAAAGAATATGTAGTATATGAATAT
2153358
2153359
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
AAGTTCTATATACAACTGTGCAAGTTCTGAATTAAT
2153423
2153424
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TTAACCCTCTTGATAAAACAAGGAGGTATTAGATGAAA
2153490
2153491
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
GATACCGAAGGTAATTTACTTGCAATATCTAAATAC
2153555
2153556
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
GCGGTAAAATGTTAGATAAAACTGTTACATTTACAAA
2153621
2153622
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TAAGTTTGAACACACTTATTTTCGACCCCTCAATACA
2153687
2153688
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TTTTTGAGTATGGAGATAAAGTAAAAATTATACTTCC
2153753
2153754
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TTAGCGTTGATAAAGATTCTATAGTAGTGAGAGGTG
2153818
2153819
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TAAAAATTGGGATATAATTCATCAACAAATTTAACATA
2153885
2153886
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
ATTATCCTTCATGTGCTTAGCTCTTTTATATTTTTT
2153950
2153951
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TCTAGCTATCCAGAAACTTATAAACCTGCTCCAGATTC
2154017
2154018
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
GGATATGTTGAAGGAACACATATGTTGCAACAAACCA
2154083
2154084
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TAGCAGGAGATGATAGAGGGGTATATCACCAGGTGAT
2154149
2154150
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
GTTTTTCTTTATTAGATAAAAGTTCTCCGTCGAATCT
2154215
2154216
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
AATCATTCCTTTTGTTTCATCTTTAAGTTTTACGAC
2154280
2154281
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TTAGTAAGCATAATAATTGCTTGTGTGATGATTTGTTT
2154347
2154348
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
AAAAAGAAACTACTTTGTATCTTTATGTTGGAATAGA
2154413
2154414
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TACTTCGTCTTTTTTGATTTGAACGTCTTATTTTCTT
2154479
2154480
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
GAGATTTTCATATAGCCATAGACTGTTTTAGTTTTT
2154544
2154545
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TGCTTGTGCTGTAGGTGTTCCTTGTGCTGTCATAT
2154608
2154609
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TTTAAATAATACCTTAGTAGAATTATCAGAGAAAATAA
2154675
2154676
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TCCTAAACCTTCTATCTTCTAAACTCTCATTACTTTT
2154741
2154742
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
ATGATAATAATGTAGTGAAACGAATAGCAAAAGAGTT
2154807
2154808
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
GAGGCAGAAATAATTAAATCCACAATAGATTTAGCTATA
2154875
2154876
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
AAATCCCTGCAACTGTAGTTGGTTGGGGTTATAATGA
2154941
2154942
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TAATGAAGGTAGCGTTAGTACCAGGACATACACTAAC
2155007
2155008
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
CAGTAGCTAATTTACTTAATCTATAAGCATCAACCTC
2155073
2155074
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TATTTAAATCTGATGAATATACTGCTCTTATTTGCCG
2155139
2155140
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TGTTTGAACATGACTTTGAACATGTTTGTCTTTCTT
2155204
2155205
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
ACTAATTTAAAAAACCACCCACTTGTAGATAATGCAG
2155270
2155271
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
CAAAGTATAGGTCAGCATATAAACCTAAAGTGGAAGA
2155336
2155337
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
GAGAGTAAAGATTGTGATATAGCATACAAAAATTGGT
2155402
2155403
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TTAATTGATTGTTGAGTAAATCCTAATTCTTTTATTT
2155468
2155469
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TAGTTTATTGTGTGTAAATTCTGCTTCAAAACTTATTT
2155535
2155536
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TCCACTCCAAGAATTAGGAATAGCCTTGCTTTCACT
2155600
2155601
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TCTATGACCTATTGGTGCTAATCCAAGACCTTCTCCA
2155666
2155667
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
GCTCCTCACCTCTTAATACGCCAGAACTCAACCCT
2155730
2155731
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
TTCTTTAGGAATCATCAGTATGGATGAATATCAGTCTA
2155797
2155798
CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC
2155826
Left flanking sequence : Till position 2152896 (length
bp)
ATCATCTTTTTATAATGATTTTTATAATATACTATAAATTTAAGTTTGTAATAAAAAAAGTTACAATAAA
TAGAAACATTCTTGTACTCATTGTAACTTC
Right flanking sequence : From position 2155826 (length
bp)
CCCAAAATAAACTTAGCATTTCCAACACTTACACATATGCAACACTCTAAAATTTGCAGTGAGCGAGCAG
TGGTGCAAATGATAACACTTATCATACATC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp