CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_017174_8
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_017174_8                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile M120
RefSeq :
NC_017174 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017174_8
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
Number of repetitions :
39
Begin Position :
2331600
End Position :
2334132
2331600
ATTTAGATACATCTTATGTTACTGTTTAAC
CAAAGTAGCTTTTACTGGAATAACAAGTACTAATGA
2331665
2331666
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
AATGGAAAGTGTATTTAAAAACTATATTGAATATTT
2331731
2331732
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
GGTATTAGCAAATGTGGAACAAGTAATTAAGTTAGC
2331797
2331798
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TTTTTTCCCCCTTTAAATTTTAAAACTAATAATTTA
2331863
2331864
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
ATCTACTAGAGAAATTGATATACAAAGAGACTCTTA
2331929
2331930
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
CTACTCAAACAAGGTAATCATGTACATAACATAGA
2331994
2331995
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
ATGCTTTTTGTGTGATGGAAATGGAAGGACTACAA
2332059
2332060
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
CCGTTTCCGAAAAAGTCAATATCACGACTCAACACA
2332125
2332126
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TAGATACCCAAAAACCAGCTAGAGGGGCATCTTTGA
2332191
2332192
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TATGCCACAAGCAGAAGAAATTGGAATAGCTACTGT
2332257
2332258
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
GAAGAGCAATCTCTTAACACTTCACAAAAAGAAAT
2332322
2332323
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
GACCAAGAACCTATCACTAAACTCATGTATAAACAT
2332388
2332389
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TGGTAAAATGGCTAAGAAAAAAGAGCTAGAAGAAAA
2332454
2332455
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
GGAGCTTAAAAATGGGGGTTCAATTAACTCAAGAAA
2332520
2332521
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TAAGTTATTTTTGTACATTACGATTTATTATATTTAA
2332587
2332588
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TATTACAGATATAGCACATTCGCTCATCTTCAGACT
2332653
2332654
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
ACTAAAGAAAAAGCTAAAAGTAAAAAAGTAGATGGA
2332719
2332720
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
ATAAAAAATTAAAATAAATAAAATCAAAATAAGTGT
2332785
2332786
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
AGGGGATATTCAGTTGTCAATGTACACTTTTTTCTA
2332851
2332852
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
GAAGACATTTTTTATTCTGCAAGTAATTTTTATTCTA
2332918
2332919
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
CTACTAAAAATACTAAATTAGATGCTAAGTTCAATA
2332984
2332985
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
CAACTATTGTTGAATTAGATAGTGCTTTAAGAGATA
2333050
2333051
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
AATGGTATGGTAATAAGATTAAAGATTGGATAATCC
2333116
2333117
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
AGTAGAGATAATTGCTGAAATAGAAAAAGCTAAAGA
2333182
2333183
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
CTTTTGATAATAAAAGAACATCAGTTAGATTTGA
2333246
2333247
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TGATGGAGATGTTCTAGGAAGTGCTGCAAAAGAAAA
2333312
2333313
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TCCAGAATTAACTTCATTTACTAAATTGAATTTTAA
2333378
2333379
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TTCAGAGGAAGCAAGAAGAGAAGGTTTAGATGCTG
2333443
2333444
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
ACAGACTGGTGACCCAGATATAACTAAACTTCAAAA
2333509
2333510
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
CAGCTATGTAAAACTCTTTTTTACCATTATAAAAT
2333574
2333575
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
AGATGGAGTTAGATATAATAATCCATTTAGATATAT
2333640
2333641
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
AAATGCAGATGAACTTGAAAGAGCTACAAAACTATA
2333706
2333707
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TCTTGAAGACGATATTTTCCAATAGAAGGATTAATA
2333772
2333773
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
GTTACAAAATGAATTAATACTTTATAAAGCATTTAA
2333838
2333839
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
AGAAATTGAACTTGGTCTACTAAATTTAGAGCAATA
2333904
2333905
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TTAATATTTAATTCTCTATTTTCCTCTAATAAATCA
2333970
2333971
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
TAATACAAATAAAGAAGTTATAACAGCTACAATAAA
2334036
2334037
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
AAACATTTGATTTGGTGAGCCATCTGACTTAAACAT
2334102
2334103
ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC
2334132
Left flanking sequence : Till position 2331600 (length
bp)
TTCCTGTAATTTTCATAACATCACCTATTTATTTTGTTATTTATACATAAGTATATCACATATTAGTTTG
TTTAATATATTAAAATTTTATGATAGAGTA
Right flanking sequence : From position 2334132 (length
bp)
CACTTTAAAATCAGTACTTCTTAAAAATATAATTCCCTTAAATACACTGAAAACACTAATATACAGATTT
TTTATCCCAGCTAATCCTAGAAAATATATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp