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CRISPRs details
NC_017177_13
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017177_13                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile BI1
RefSeq :
NC_017177 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017177_13
DR consensus (30 bp) :
ATTAAACCTTAACACTAAGTGTATTTGAAC
Number of repetitions :
7
Begin Position :
144452
End Position :
144877
144452
ATTAAACCTTAACACTAAGTGTATTTGAAC
TTGTTGGCAAAATTAACTTTAAACATTCTTTCACTGA
144518
144519
ATTAAACCTTAACACTAAGTGTATTTGAAC
ATCGCCCCTTGCACATTCGTAGCAGTAAGCTTGCTTG
144585
144586
ATTAAACCTTAACACTAAGTGTATTTGAAC
TCGGGTAAATCTTTTTCTTTAGCTCAAAGAACAGTAT
144652
144653
ATTAAACCTTAACACTAAGTGTATTTGAAC
TGCTATCTATTAGTTTTTTAAAACTGTTCTCTCTG
144717
144718
ATTAAACCTTAACACTACGTGTATTTGAAC
CATGCTCCACCGCCTACAACATAAAGATTTTGCGT
144782
144783
ATTAAACCTTAACACTACGTGTATTTGAAC
TTTCTTTGTTGATTATAACTATTTTACTATAAAAA
144847
144848
ATTAAACCTTAACACTTTGTGTATTTAAAC
144877
Left flanking sequence : Till position 144452 (length
bp)
ATTCTTATTTTTAATTGTTAGTTGGGATAAAAGACTTAAATTAATTGAAATTACTATATTTCAAGTATTT
ATTAATTTTAGGAATGGCTTGTTTACAGCT
Right flanking sequence : From position 144877 (length
bp)
AACGCCAATAAAAGTGGTTCAAAAAAAAGCTATCTAAATTAACAGATAGCTCTTTTTAAATTATTGAAAT
CCTTTTAAAAATTTAAGATATATTTTCCTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp