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CRISPRs details
NC_017179_10
Flanking alignement tool
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NC_017179_10                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile BI1
RefSeq :
NC_017179 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017179_10
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
15
Begin Position :
1304505
End Position :
1305458
1304505
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG
1304570
1304571
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC
1304637
1304638
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG
1304701
1304702
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA
1304769
1304770
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG
1304835
1304836
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA
1304903
1304904
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT
1304966
1304967
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT
1305032
1305033
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA
1305098
1305099
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG
1305164
1305165
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG
1305230
1305231
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG
1305297
1305298
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC
1305363
1305364
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA
1305429
1305430
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
1305458
Left flanking sequence : Till position 1304505 (length
bp)
GGTATGTGATAAATGTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1305458 (length
bp)
ACAGATCTAATATCAAAATAAGGTTATGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp