Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_017465_3                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus fermentum CECT 5716 RefSeq :NC_017465 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017465_3
DR consensus (29 bp) : GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTNumber of repetitions :24
Begin Position : 820218 End Position : 821650

820218GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACAACCAACTGCAAACGGCAACCCAACAGATC 820278
820279GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACAAAGATGAACTTGTGAAAATGTCTTTCTTG 820339
820340GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAAGGAAATACATCCCAAGTTTATCTAACTGG 820400
820401GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCCCCGGTGAAAAGCAAGGCGAACGCTTCTTCCTC 820461
820462GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACTGGTGATAACTCTGGTCGCCTGATGGTTTT 820522
820523GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTAGCTAATGATTTCTTTGGTAGCGTCAGCCAGG 820583
820584GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCCGGATGTGCATCACGATCATGAAAAACGACCACA 820645
820646GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTAGTAAATGGTATCAGGGGGCCGGCGAGTTACA 820706
820707GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTGCTGACAAGGTATTTAAGGACGCCGAGAAAC 820767
820768GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTGTCGGTTGTTCTGCTGATTGCGTTGCTGTGG 820828
820829GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTAAGCCGTTTAGCCATTGCAGCGTTGCTCATA 820889
820890GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAGTGCCCACCCGGTGGACGTTAGCTCTATCC 820950
820951GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACCGGCGGGCGAAGTTGGTCAACCTCGTCATT 821011
821012GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTGGTATCACCTGAATATGGCGCATCCCATCGTT 821072
821073GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTATGATCCAGGCGAGGCGATTGCTAACGGTAAG 821133
821134GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATGTCGACGTTCATACCGAGGCCATTGTCAGTCCAAG 821194
821195GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACATGGCATACGCTTGAAATTGACTACGATAA 821255
821256GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCCATGATATCCATGGTTAGCAGTAGTAATTATGA 821316
821317GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCTTGCTAGACGCTTTCTTCCACTTTGAAAGGG 821377
821378GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTATATCAACGTTTTAAGTTGGTTAGTGTCCCAA 821438
821439GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTGGAAGAGCTGGACGTTGTCAAATGACGGGAA 821499
821500GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTAAGTATTCTTAAAGGAGGTCACACATTACTG 821560
821561GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACTTATCCATACCAACTTGACTAATTAAATCA 821621
821622GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCT821650
Left flanking sequence : Till position 820218 (length bp)
TAATGAAGTTTCCTTTCAGATTTCACAAAGTCCTATTTAGAATTTACACCAATTATACGGACATAACCCA
GATTCCTGCATTTCGTCGGTAAACTTGAAA
Right flanking sequence : From position 821650 (length bp)
TGGTTATGTCCGTATAATTGGTGTAAATTCTAAATAGGACCTTGTGAAATCTGAAAGGAACTTCATTATG
CCAAAGGTTGAATTAAATTTAGAAGATGAC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp