CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_018018_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_018018_4                                                                                                                 
top
Strain :
Flexibacter litoralis DSM 6794
RefSeq :
NC_018018 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_018018_4
DR consensus (37 bp) :
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
Number of repetitions :
18
Begin Position :
1678085
End Position :
1679372
1678085
ATAATAAGCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AATAAGAAGTACGACACAGTTGCTACGTTTGACTTTGA
1678159
1678160
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
TCAAGATTAATGGATTACAACAAACTATCCCAGTAGCCTTT
1678237
1678238
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
GAGCTTAAAGTCATGGGAGCAGTTATGCTCTCGTACT
1678311
1678312
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
GGCTGTGCGCCCTTATTCAAACTATATTCTGTTCGA
1678384
1678385
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AACGCCTAATGCGCCACGCTATTTGATTGGCAGTCA
1678457
1678458
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
TCAAAGCCACCAACAACAATTCACGGTTTTGGAAATGATA
1678534
1678535
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
ATGAGTTACAGGCTGCAGCAGGACGACGCTGTCACGA
1678608
1678609
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AACCTTTGATTCGTTATTTCAATAGCCTTCGGATTA
1678681
1678682
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
ATATTGAAATTGTTTGACCACATAGGTGCGAATTGGC
1678755
1678756
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AGTATTTCATAATGGAGGGTCGCAGAAAATAGTTGCGA
1678830
1678831
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
GCTAATTTAAGCAACTACCAAGGTAAAAGTGTA
1678900
1678901
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGATTTTTAAG
TCAACTTTGCTAAGTTGATGATTGTTTCGATGTTTAG
1678974
1678975
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AAAAATTGAAGCAGGAGATACAAAAGGAGCACTTCCT
1679048
1679049
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
TTTTTCAGGTGCAGCGCACCGAATCCATTTGTA
1679118
1679119
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AGTTCATTCAAAAGCTACCATTATTGCGTTACCTA
1679190
1679191
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
ATTCCGTAAATCTTGTTTCAAAAGCCTCAGTTAT
1679261
1679262
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
AAGGAAAATAAAACATTTTTAGTTTTATTTTACACTT
1679335
1679336
GTCGCAATCCTTGTTTTAATGGAATATGGTTTTTAAG
1679372
Left flanking sequence : Till position 1678085 (length
bp)
TAAACTATTGACAAATTTTTGATTAAAATAAAATATTACTTATAAGCTCTTTAACACTTCAAAATAGAAA
TTGAAGATGTTAAGGAGCTTTTTTGATAAG
Right flanking sequence : From position 1679372 (length
bp)
ACCAACGCTGACATTTTGTCAAAATCATTACTTTTTCTCAAAAAACAGCCTTTATTTTTCTCTAAAAGCA
CTTATTTACTTTCAACCTTTCCCAAAGGTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp