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CRISPRs details
NC_019676_20
Flanking alignement tool
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NC_019676_20                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. PCC 7107
RefSeq :
NC_019676 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019676_20
DR consensus (37 bp) :
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
43
Begin Position :
4563956
End Position :
4567063
4563956
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGAATTTAAATCGCCGCTACCATTAGCAAAAG
4564024
4564025
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATGCAGAAGTAGGAAACAGAATTGTTTTACCTAATAA
4564098
4564099
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TATTAACAGTAATAATATTAAAACTAGTTTTAGC
4564169
4564170
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTACTAACGCTGGCTCAAGTATTTGTTTGAGCCTTTGAT
4564245
4564246
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTCAACCTTGATTTGCACTAAAGCACCCCATCTTTCT
4564319
4564320
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GTAGCAGCCCAACAAGGATTGAAGCAAACAAAACAAATTAC
4564397
4564398
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GAGGGCAAAGTCACCAAACCGAACGGTGGTGAAA
4564468
4564469
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTAAAGTCTCTACTGAAGCATACTTTTCTGGCGTAAAA
4564543
4564544
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGCAAAGCCTTTCCCAGCTAACTTGCATCAAATTAG
4564616
4564617
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGGAACATCGCCGTATTAAACCCAACCCAGCTA
4564687
4564688
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TGTTGCAGAGATGAATAACAAATTCTCTGCCAG
4564757
4564758
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TATGCCCTTTGAGGATTTCATTTTTTTCATCAATAACTA
4564833
4564834
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATCGGATCTACTTATCAGCAAAAGCAGCAAAATAA
4564905
4564906
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TGTTGGTTTAGCTGCGGTGTAGCCTCCGCGGTCGCCA
4564979
4564980
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATAGATGCAAGGCCTATCAGGAGGCTAACTCTAGTAGA
4565054
4565055
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTCGGATAGCACAGCATTGCAGTTCATAAGTACCAA
4565127
4565128
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TGCTGCATCGCTGGGCATTGTATTTATAATAAACTT
4565200
4565201
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TACCAGTACATGAGCGTCCCCGGTGGATTGAGAAA
4565272
4565273
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GAGAATATCGACCATTGCCCGACCAGTCAAAATG
4565343
4565344
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTCCTGAGCCGCACCTAAGCGGCTTTTTATTTGAT
4565416
4565417
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GCTTACCTGTAAAAGTAAAATATTTAGGACAAGC
4565487
4565488
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TACCGTAAACAATATACCATAGCGTGCAACACAA
4565558
4565559
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTTCACCTTGAAAATAAGACACTTTTGCAGCAT
4565629
4565630
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATCTCCAGTTTGCCAGCCCTTACGTCCAATTAACC
4565701
4565702
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGATACTATCATATCTAACTCTTTAGACGTTAAG
4565772
4565773
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GGTTAGTTTCAGCATCTTCCTTGCTTACTAAGTC
4565843
4565844
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AATTACGGATACGAGCGTATTCGCAAATTAGAGA
4565914
4565915
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTGACCAAGCAAACAGGCGATCGCCACCTCAATAT
4565987
4565988
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TAGTCATTTGTTTGTAGTTTGCAAGTATTTTGATAGTG
4566062
4566063
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GAGGCTGGTTGTGCTGGAGAAAGTAAACTTGTCCAGTT
4566137
4566138
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTTCATATTTAGTAATGCCTCCAGTATCTACTCT
4566209
4566210
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGATTTGCGATCGCATTCACAAGTGGCCTGCAT
4566280
4566281
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AAATTTATAATCTTCATAGGCTTTGAGAGCTTTAATCGTT
4566357
4566358
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTCAATTTCTGCTTGTCTTTTGACAGACAAGCCTG
4566429
4566430
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGCTATAAATATCGCGTATGACATAGACGCTGAA
4566500
4566501
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATAAACAGGTACTTATAAAGCTTTCCGATGATTAAA
4566573
4566574
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TCTTTGAAGTACAAGACACTAAAGGAGGTTTTTTCTAAG
4566649
4566650
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AAAAATTAATATCGTATCTAAATATTCGTTTTGTGGTAGGTA
4566728
4566729
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ACGCATGGGAATCATGCCATCGGGGAATAGTTCTAAG
4566802
4566803
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AATGCGAATTATGAAGACTATCACGAACTCAGAC
4566873
4566874
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTCTAATGATGAATTTTCTAAATTGCGTAAACACATTAA
4566950
4566951
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CGGTATATACAGTGTCGCCAACCTTGCATTGAAACTGGT
4567026
4567027
ATTGCAATTCAAACTAATCCCTATTAGGGATTCAATA
4567063
Left flanking sequence : Till position 4563956 (length
bp)
ATTTCACGCAAATCAATTGACATTATCTGGTGTTATAATTAGCCCATCCGCGAAATCGAACCTTGAAAAC
CAAATACAGACCGCCTTTCTGGCTCCCGCG
Right flanking sequence : From position 4567063 (length
bp)
TAATTCAGTGAAGCATTTATTATTCTCTTTGTGTCCTTTGCGTCCTTTGTGGTTCGTTTAAAAAAAGAGT
TTTAACCTGCACTAAACTCTATTAGCATTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp