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CRISPRs details
NC_019676_24
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_019676_24                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. PCC 7107
RefSeq :
NC_019676 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019676_24
DR consensus (37 bp) :
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
32
Begin Position :
5566325
End Position :
5568673
5566325
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GCATAAATGGATTATGTGAAAACTGCTCAGATGC
5566395
5566396
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ACGACCCGCTACACCATTACGCCCATCTGTACC
5566465
5566466
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CGTAAATAGTTTTACTTATCGCATATTTAACGTAAAG
5566539
5566540
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CATATCTAGTTACGGTGTACTTTTCTACCCAGTGT
5566611
5566612
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GTTCTAGTAAGTCCTTGCCCTTGCCGTAGCGTTGCCCGGTA
5566689
5566690
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GGCGAAGCCATCGCGGTTCTACGCGCCAGAATT
5566759
5566760
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TATTTAGGAGTTAGTGTACCCTTCAGCAAGTACTATGATA
5566836
5566837
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GTCTGTGGCGTAATTGATATAGTATTTTCAGTAATGCCCAGC
5566915
5566916
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTTAGGACTACACTGGATACAGAAAGCAAAAAGGCG
5566988
5566989
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTCCAGACTGGGCTTGTATGGCTTTTGATCCAGTTT
5567062
5567063
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TGATGACTACACCGCTACGAACCGCATTTTAATTTATGAG
5567139
5567140
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGCTAATACTGTTACGTCAGCACTAGAGATGTTTAAA
5567214
5567215
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AAATGTCACTTCTTCTATGTATTTAATAAGCTCTTTCTTG
5567291
5567292
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGCGTGATAACTTATCATTGTGTGTCGTAACTGATAT
5567365
5567366
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GCTCGCCTAAAGCCTTCACAGGTACCTATTGCT
5567435
5567436
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CCATTCCATTGTTCGATTTCCATATAAGGGCGTT
5567506
5567507
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGCAAGTTTACAGGCTCTTTGCCATACTCTGAG
5567576
5567577
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TGAATTCCCTCATCAAAAGCAGTCTATATTTTGTGAA
5567650
5567651
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TGATGCGATCGCCTCGGCATTTATGTATTGAATGATTTG
5567726
5567727
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AGAGGATACGTCTACAAAGGTGTTGTCACTGAACTAGCCGAAC
5567806
5567807
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GGCGACACACTAAAAGCGAAAGTAGAGGAACTACT
5567878
5567879
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GAAGCAGGGTTAAAAAGGCGGCGACTGGCTGAGGCTGATTTA
5567957
5567958
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CCTTTAAAGTTTCTGCCATTAATCTTTTGATTAAT
5568029
5568030
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TAATAAGTTATTTTGGGTTCCCACTTATTAGTAGTTTC
5568104
5568105
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTGGATAAATCCAGGACAGAAGGTTGCTACTCCATAAGAAATCACGG
5568188
5568189
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTAAACCCCCGCAGTCGCCCCCAATCCCCCTACCCCCAAAAC
5568268
5568269
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
TTAACCATTTCTGTGAAGCTGAATAACATGATGAAG
5568341
5568342
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CAATCGCTCAAGTATACATCCGCACTCTAGGG
5568410
5568411
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
AAAAATTCCCGTACCCCGTGGCACTATTTTAAA
5568480
5568481
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
CTAAAAGGCCATCGTCACATTTCCCACGCTGTAGCCGTTGTTG
5568560
5568561
GTTTAAACATCAACTAATCCCTATTAGGGATTGAAAC
GATGGTGTAGCAATTTCGGTTGATTCTTTACCTTCTCAA
5568636
5568637
ATTGCAATTTCAACGAATCCCTATCAGGAATTCAAAA
5568673
Left flanking sequence : Till position 5566325 (length
bp)
ATTTTCGTTCAATCAACTGACTTTTACTTGTGTTAGGATCAACCCATCCGCGAAATCGAACCTTGAAAAC
TACATACAGTAAGCTTTTCTGCCTCCCGCA
Right flanking sequence : From position 5568673 (length
bp)
TAATTTTTCTCGAACTAATGCCTCATCTTTAAAACCAATAAAAACGGCTGTTCCATCTTTAACAAAAAGC
GGACGTTTGAGCAGCATAACATCAAGTGCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp