Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019677_1                                                                                                                 top


Strain : Nostoc sp. PCC 7524 RefSeq :NC_019677 (plasmid pNOS7524.01 )
CRISPR id : NC_019677_1
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATNumber of repetitions :38
Begin Position : 10998 End Position : 13699

10998CGCGATCGCTCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTCGTCTATACCTTTGTGTTATGTCTATGCGAGTAAA 11070
11071GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATGTTATGCGCTGATTCTGCGTGGTTCACGGATAGTTAC 11144
11145GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATAGAAGGCGAATATAGTGCATACCGAGATCCTGGCTAT 11218
11219GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATGACAAACTCAGTCTCAAGCTGATCAGATGATATT 11289
11290GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCCTCAGTGTATGCAGCAATCATCTGTTGTTTGAC 11360
11361GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATAATTAGAGGTTAAGTATGAAACTTGTACTCTTG 11430
11431GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCAGTATCAGCAAGTATTTCTGCCCTCTGTAAGTC 11501
11502GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATGCTCGCGCACCTAGCCCAATTGCTTGCTGATAGG 11572
11573GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTGAGGAGAGATTACTTGCAGCGCACGCCGACTTGTT 11645
11646GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTCCATAACTGTGATGCCCGGTGGGATTATGCACCAC 11718
11719GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCAGTATCAGCAAGTATTTCTGCCCTCTGTAAGTC 11789
11790GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTAAGCTCATTCCAGGTGATTTGCCCTTGAGCT 11858
11859GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCTCGTGAGTTTCTTCATGCTTTAAAACAATCTCTC 11930
11931GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTTGGCAGCGATGAAGAATCATACGTGTCACAATAT 12002
12003GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTTTTCATCGTTCTCATCAAGCTTATTAGTTTG 12071
12072GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTCCCCCTTAAGTATTATCACATGGTTAACCTAGTATGTC 12147
12148GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCAGTCAAGGCTCAAGGCATCGATAAAAGCAGCCCT 12219
12220GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATATGGGGGCAACTGTAGCGGCTAGAGCTAGCATTAA 12291
12292GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTACATTCTCCCAGTAGCGATCGCCAGTAGCAAGGTC 12364
12365GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATACCAATAAGGTGTCCATCAAGAATATCTTTCTCTTG 12437
12438GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCCCGCTATAGCCATCTTTGGGGTTGCCGATCAGCTTG 12511
12512GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTAGACTTCATCCTCTTGAGTACCGTTCAGTCTTGCCA 12585
12586GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATAACGATATTGATAAAGTACGATGCCTCTATAAA 12655
12656GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATAAATCATGGTTGATAATCTGCAAAGCATAAGCT 12725
12726GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATAAAACTAGGTAGTTCAGTTTCCACTACCCACCACA 12797
12798GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATAAAGCAGGGGAAAACGGCGCAAAGGGTAGCTTT 12867
12868GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCTACCAAAGTAAGGTGTATACTCACTATAGCATTCG 12940
12941GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCGAAAGCAGTAGAAAAACCCTACATTTAATAGGTTATA 13015
13016GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTATGATAGCTAGCTAGTATCTTTATAAATAAATT 13086
13087GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATATACTTGGATAGAAGCAATTAGAAATATGAATACT 13158
13159GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATAAGCAATACTTTTGCTACTTCTTCGCAGAATTTTTC 13231
13232GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATGTACAGCCTGGGCGATCGCATTAGGATCTCCAGC 13302
13303GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCAAGAACAAGTCGATGCAGAACTAGCCGCATATGCC 13375
13376GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATGGTAGTCAAATAAATCCGGTCTACATCATCCCAA 13446
13447GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATTAGGGGAGTTTATAAATATTGCAAACCCACTAT 13516
13517GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATCGCACCACCAAAGGCACAACCAGAACCAAAGCCACAAA 13591
13592GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAATACACGGCGATTGCTCTCAGCATCACCACTGCCGT 13662
13663GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGGTTAATTGCAAT13699
Left flanking sequence : Till position 10998 (length bp)
TGGGGTTTAATTCCCTCACTCACTACATACGACAGTCAAGATGTTTGATGCACTATCCGTTTTTTAGCGC
GATCGCACTTATCAGGATAAACACACGAAG
Right flanking sequence : From position 13699 (length bp)
CGCGGCAGGCTGAAAGCTAATCTGTATTTGATTTTCAAGGTTCAGTTGCGCGGATGGGTTGATTATAACA
CGCGAAAATGTCAGTCGATTTACATGAAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp