Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_019678_18                                                                                                                 top


Strain : Rivularia sp. PCC 7116 RefSeq :NC_019678 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019678_18
DR consensus (24 bp) : CTTGAAGGTGGTAACGGTAAAGACNumber of repetitions :9
Begin Position : 4614544 End Position : 4615053

4614544CTTGAAGGTGGTAACGGTAGAGATGTTCTAGAAGGTGGTAACGGTAAAGACACCTTAAATGGCGGTAATGGTGCCGACTTA 4614624
4614625CTTCAAGGTGGTAAAGGTAATGACAGCCTTGAAGGTGGTAACGGTAGAGATGTT 4614678
4614679TTAGAAGGTGGTAACGGTAAAGACACCTTAAATGGCGGCAATGGTGCTGACTTA 4614732
4614733CTTCAAGGTGGTAACGGTAATGATAGCCTTGAAGGTGGTAACGGTAAAGACGTT 4614786
4614787CTAGAAGGTGGTAACGGTAAAGACACCTTAAATGGCGGCAATGGTGCTGACTTA 4614840
4614841CTTCAAGGTGGTAACGGTAAAGACAGCTTAAATGGTGGAAGAGGTAACGATACC 4614894
4614895CTTGACGGTGGAAAAGGTAAGGATATTCTCGAAGGTAGTCGGGGTAATGATGTC 4614948
4614949CTTGATGGTGGAAAAGGTAATGATACAGCAGATTACAGCCAACTGAATCAAGCAATTACTCTTAACGCAGTTGGCATTGTT 4615029
4615030GACAAAGGTGGTTTGGGTACAGAC4615053
Left flanking sequence : Till position 4614544 (length bp)
GATTGACATAACTATGATACTAAATGGTGGACCTCAAAGCGAGAATTTGATTGGTACCAACGATGCAGAT
TTCATTTCTGGTAAAGGCGGTAATGATAGC
Right flanking sequence : From position 4615053 (length bp)
CAAATTCTAAACATCGAAACTATCGTTGGTGCAACTGGACAAGCTAATACAATAGATGGTTCGACAAGTG
TTAGTGGAGTTACATCTTTCGATGTTGATT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp