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NC_019678_24
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NC_019678_24                                                                                                                 
top
Strain :
Rivularia sp. PCC 7116
RefSeq :
NC_019678 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019678_24
DR consensus (36 bp) :
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
Number of repetitions :
101
Begin Position :
6181145
End Position :
6188351
6181145
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTGGGGGAAGTTTGCATATTAACTCGTTACCT
6181212
6181213
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTTACCAATGAAGTTTCCAGTGATAGCAATTATGTTA
6181286
6181287
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTCATCGTCTCCACCAGTTTCACGTATAACAGAACTTT
6181360
6181361
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GCTAAGCATGGCACTTAGCCTATAAACTGCTTGATC
6181432
6181433
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTGGTTAGACATTTTAGCAATCCTTTAAAAATAA
6181502
6181503
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GTGTAGTTCGGTAAAAACCTAAAGGTTCTTCACGGTG
6181575
6181576
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TCTACGAGCAAGCGGTTTGCTGTTGGGGTAGGCA
6181645
6181646
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TGCGGGTGTCAACGGTTTCACCACGGACACCATG
6181715
6181716
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTACTTGCTGGTTTAAACAATAAGCTAAGACAA
6181784
6181785
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TCTCCGTCTGCGTTTTTTGACTTTCCGCAAGCCACAA
6181857
6181858
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ATTTTTTAGAAACGCAAAAAATTACTTCCTAAAAGC
6181929
6181930
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTTAGGTTATTTTTGTAATAAACCATAGTAGATCTAG
6182003
6182004
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TGAAGTAAGTCACAAACTAACAACAAATCGTT
6182071
6182072
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AATTACTTCTCCACAAGCAAGGGCTTGAGAAGGTTGA
6182144
6182145
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TCTGTGATATTCTCTTCTTTCTCTAACCACTTTTA
6182215
6182216
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AAATGTGCTTTAAATGCAGTTTCAAGCGATTCAAAAGCAT
6182291
6182292
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ATTAATTGCTTTTAATTTCACTTGTTGTTTCCTTT
6182362
6182363
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CTTGAAGAGAAAGAATAGTTTTTTCTTTTTGTTCAGCTT
6182437
6182438
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GTTTGGGCGAGTAAGTGAAACTTTTTTTCCCGCAA
6182508
6182509
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ATAAGCTAAGACAATAATTGCGCCTTCGTGTCCCCC
6182580
6182581
CCCCAGCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TATAAACTGTGTTTTCGTTAAAACCCCCAACAGCA
6182651
6182652
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AAAAACAGTGTCAGCATTGACTCTACCAGCTTTC
6182721
6182722
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTACATCTTGAATTATTTTCTTTATTCCTAAT
6182790
6182791
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TGTGTAGTCATGATGACTTACCTCAATTTAAG
6182858
6182859
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTCCATGGTGATGATACCATTACAAGCACGGGCAACA
6182931
6182932
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TAACAAGGGATTATGCGATTCAGATCGTAAAAAAAATA
6183005
6183006
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CTGGAACTTTGCGTCCACAGATTAGACCTAGTTC
6183075
6183076
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CATACATTGTTGCCCGTGCTTGTAATGGTATCATC
6183146
6183147
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GGAAACCCAAATTCCTGCTCACCAAGGGGGGCATGA
6183218
6183219
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTCAAATGACCGAATACGAACAACTTTTGCAGGTGAA
6183292
6183293
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CATTCCATTACTGGATTAGCGACAGCAGGGTTCAC
6183363
6183364
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CATAGATACGGCATTAAGAGCTATAATTCTT
6183430
6183431
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GATAGAGCAATAAACCCTAAAGCAACACTGACTAT
6183501
6183502
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTATATATTTTGTAGCGGTTTTAAATTCTGAAG
6183570
6183571
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTGGCTACATAACTTTGATTTTCTTCTATGTATTCTT
6183643
6183644
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GTTAGTAAATTACTTTACAAGAAAAATCTTGTAATTG
6183716
6183717
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TCTACTTTGTTAGCGAAACCTGTTGCAAACCTAGCAA
6183789
6183790
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTTTCACCAAGCTCTGTTTTCAAAACTTGTTGAACTTTA
6183865
6183866
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AATGATATGTATCCCAATTGAAGCACGTTTTATTAT
6183937
6183938
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTAAAATATTCACTATGTAAAAAGAAATAAACCTAT
6184010
6184011
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CACCATTATTTGTTTGAGTGGTAGGGGGATGA
6184078
6184079
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GCTAGGGCCCGGCTGGGGAGAGGGCTCCCTATTAG
6184149
6184150
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTATTACCTTCATGCTTGGAAAAAATTCTAGACAC
6184220
6184221
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ACTAACCCACACAATGAGGCTGAATGAATTTTTT
6184290
6184291
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AGCTGTAGCAATCTTTAAGTAAATCTTAGAAAA
6184359
6184360
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CATCGGAAACATCTTTATTACCTTCATGCTTGGAAAAA
6184433
6184434
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AAGCTTCCAAGAGCGATTTTGAGACTTGCCAGATGCAA
6184507
6184508
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TCGACTGAAAGCGATTGGGCGAAATTTTTTGCTA
6184577
6184578
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CTGAATGGCATGATGGTAGTTACTTTTGTCAATT
6184647
6184648
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TGTAACAGATCCAAGAGCAGCAAAACAGGCACCAGCAA
6184721
6184722
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTAAAAATTAAAATATTACTTAAAATAATTTT
6184790
6184791
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GATTGGCATCGCACTTGCAATTTTCTCCGTATAGCCTA
6184864
6184865
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GATATATAACTCCCACGTTCAGATGAACGTCTCT
6184934
6184935
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTGGTTAAAAGAGTCGAAATAAACAAATATTACGTTT
6185008
6185009
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TGGCTATAACTATGGTGGTAAGCCACAGGCAATACGCG
6185082
6185083
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ATTTTTCTCCACAAAATTATAGAAAGAAAAAAT
6185151
6185152
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTGATAAGAGAAAGCAAGAAGTTGCAACAATAGCAAC
6185224
6185225
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AGTAAGTCCACCAATCTCAAAAACTGTAGTTCCATTT
6185297
6185298
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AAATATCTCCTAATTTGAGAAATTTCGGTTGCGGTT
6185369
6185370
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTAATCATTCGACTACTCATTCTAACCCGAACAAAA
6185442
6185443
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AAACTTTACTAGATTGTGGCATAATTTTACCTACCT
6185514
6185515
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AACTAGGAGAAAAACTTGTTTCAGCAACTAAAA
6185583
6185584
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TAGCTATTGCGGATTGCAGCAGATAACTTGATAACT
6185655
6185656
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTAAAGAAGTTGTGTAGCTTGCCCGTATATCAA
6185724
6185725
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AATTATACTAGCTTCTGAACTACCAGACATTTCA
6185794
6185795
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AACTTGATTAACGTCAAATTTGTTAAGAGTTTCTTCAATCC
6185871
6185872
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ACCTGCACACTTGCCTTTAGTTCTAACATCAGAAGA
6185943
6185944
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ACTATTAGAACCATTGTGTTTTACAAACACAGTGTCTT
6186017
6186018
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTAGGAGTTAATCTGATTAGTCTACCAACGTC
6186086
6186087
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GTTAGTGGTTTTTTGCGAACCTGCAAATCCG
6186153
6186154
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AATGCTGCAACTAACGTTAAAACCACAAATACCAAAAAATA
6186230
6186231
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GTTCTTCCTCCATCTCGCACTTAGAAGGGTGTG
6186299
6186300
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CATCTAAATAAGAATAATACAACTACCACATCTCGCA
6186372
6186373
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GATTGATCTTCATAGTCAAAATTTTCTTCTTTC
6186441
6186442
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTAATGTATTCTGCAGCAGAAAGAAAAAACACTCTAT
6186515
6186516
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TCTCACTTCTTGCAATCTTTCAACTGCTTGATTAT
6186586
6186587
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AATTCATATCAGTAATCGTTTGATTTCTGATATAT
6186657
6186658
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTCCAATGCTAGAGTTACCAGAATTATTAAGTTCGGATT
6186733
6186734
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AAGAAGGGAAACCATGGTTTCCATGTATTTAGCGGAATA
6186808
6186809
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GCTTCACACTACGTTTCATTTCTAAATCGTATAA
6186878
6186879
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GAGACCTCCGAAGATGCTGTCATTGCCGTTTCCAC
6186949
6186950
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CACATCAAATGTGCCGCCTAGCGCAAGTTCCTGCTGCCA
6187024
6187025
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
GATTGGTTAGTCAATGCACACAACTTAATGAATGCAAT
6187098
6187099
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ATTCAGATGAATCTACGACTGTGCTTCCTTGAC
6187167
6187168
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTAGGAAACAAATAACCCCCCAAAAAAAAAGA
6187236
6187237
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ACGTATTCTCGGAAATATAGTGACGACCTGCTAAA
6187307
6187308
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CTATGATGAGGAAGATCCACAAAGGATAATCTC
6187376
6187377
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ACCTGATCCTCCGTGCAGAAGGTCTTCTTGGAAGCCT
6187449
6187450
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CCTTTATCTCATTTGCAAGAAAATTCTGAACATTTGGA
6187523
6187524
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CTACAAAAGTAACCGCAACTAATGTTCCAACAAA
6187593
6187594
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTAAGACCATCTAGGAAGAAATCTGGAACGTATCC
6187665
6187666
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTTTATATATGCAGAAAATGCGGGCTCTCCTACA
6187736
6187737
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TCTCAACTCTTGCAAGCCTTTCATCAAGCTCTTTT
6187807
6187808
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TTTTTGATGGTTGAACACTTTTTAGGAACTTCATATTTATA
6187884
6187885
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CGTATTCATCAGATACAATGTTAAAATTATCAAGA
6187955
6187956
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CTTGAGCTTGCGTGTGATCGTTTCCCATCTTCAGT
6188026
6188027
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
TCTGCGGGTGCAGCTGCAAAAAATGTGCCTAAAATCAG
6188100
6188101
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
ATTGTATGTTCATTAGAAACTTTCACGTCTCTGT
6188170
6188171
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
AGAATTTGATCATGTCTAACCAAAAGAATGTATTCATC
6188244
6188245
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
CTACCCAGTAAGGATAAATGCCAACGTTCTTCATC
6188315
6188316
CCCCACCGATTGGGTTAATTCGGATTAGTTGGAAAC
6188351
Left flanking sequence : Till position 6181145 (length
bp)
CGGTGTTTTGCTTGATTTTCGGGCTCATATATAATGTTTTTCAGAGATGCGTCGATTTGGCTCCTGTAAC
CCTTACTGGGTAAGGGCTGCTGAGCGAACT
Right flanking sequence : From position 6188351 (length
bp)
CTTCGTAATCAGGTTCTGTCACTATACCCAAAAGCTGTCAGCCCCTGGAAGCATAACCAAGTAATTTAAG
GGCTGAAACCCTTATTGTTGCGTTAATCGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp