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CRISPRs details
NC_019678_4
Flanking alignement tool
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NC_019678_4                                                                                                                 
top
Strain :
Rivularia sp. PCC 7116
RefSeq :
NC_019678 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019678_4
DR consensus (37 bp) :
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
57
Begin Position :
286960
End Position :
291024
286960
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGGGAGAAAGTAAGAAAGCACGGTAAAGCGACCCGC
287032
287033
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTGCTACCTGCATCTTTATTATCGGGCTTTAT
287101
287102
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTAGATAGGTAGTACCTACTGCTAAAGCTTGCCAA
287173
287174
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTATTAATCTGAATAACCTTCCTTGAAGTGTTGAG
287245
287246
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTATCTGGACCTTTTTGCCTGGAATACTCATACTCAAA
287320
287321
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGAGTATATCTGACTCAAAAAGGGCAGATTCAAGAA
287393
287394
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAAAAAGACTATAAATCCTCAAATAAGTTGAGTT
287465
287466
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTATATCTACAACTTTTTTCTTCTCTTTCTATGAAAAT
287540
287541
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTAACAACTCTAAATACATCATACATTGTCTCA
287610
287611
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAATATATGAATCACAACAAACACAAAAAAGGAAA
287682
287683
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCCTATTGATTTACATGTAAATAATGATAGGAAAA
287755
287756
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTCTAACAGATCTTTTTCGTAAATATTCCAAT
287824
287825
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGATTCCATCCCCGCTTCGATAGCGCTCCAGTTT
287895
287896
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AATCATGGATTAAATTATTTAATTGGCGCATACAA
287967
287968
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAATAAAAATATGAAAAAGAACAAGAAAAATCA
288038
288039
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GCAAAATATATTTCTGGAAGATTTGCTTCGGAAATT
288111
288112
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTAGCAGATAAAAATAGTACACAAGCAGAAAAAA
288182
288183
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAAGCTTTTTACCGTTTGTAACACCACTAGAACC
288253
288254
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGAGAAACACGATGCATTCTGCTTGAATAAAAAGA
288325
288326
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCCGCCAGTAATTTTACATTTATCTGCCAGTGAT
288397
288398
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAGAATTTAGCACTACGGCTGCACCTGCTGAAT
288468
288469
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TACTTTACCTTTCTTTAAAAGCCATTCCCACATCAAT
288542
288543
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTGGAAAATACTAGAATCATAGGCTTCAAACAAATT
288615
288616
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTCAATCTTGAAATCTTCTAAGCCTGAGCCTATGA
288687
288688
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAACATCTAAGGAATCCGTACAGCTTTGACTAC
288757
288758
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTGAAGCCTTATAGAAGCTTTTAATTGCAAGTTT
288828
288829
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTATTGAGATTAATGAAACTTGGGAAAATAACCT
288899
288900
GTTGAAATCAACTTCAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAATTGCATATTTTAGCCTAGACTGAGATGTAATA
288971
288972
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CGTGACAATGAATCTCCACTTCTTTGCCCCTATC
289042
289043
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GTTTAGATAATTTACATTAATCTTTGCACGAACTAAT
289116
289117
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGATTCAACTCTTGAGAAAACATTTGTCTATCTA
289187
289188
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTTCCTGAAAAAATGCAGGGAATAATCCACAGTT
289258
289259
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CCCCGAAAAAACCAAGCCCAGCAACTCTGATTGA
289329
289330
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTAAATTTACAGCACATCAACTAAGACATACTTTTG
289402
289403
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTATGCCTGGAAGGAAATCAGGAAAGATCCAGAT
289473
289474
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AATTGTCCTTTGGGACGATAAACTCTTAATGTTGCAA
289547
289548
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTAATAGGAACTGCTGTTATTGGTGGAGTAACTACT
289620
289621
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CCTCCTTTTGTGTATATCTTTGCAATCTTCAGATT
289692
289693
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATTGTTGCTAAATGTATTTATAAAATCAACAGAA
289763
289764
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTATAGTAAAAATAATTGTAGATGGAGTACCAAAA
289835
289836
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAT
ATGGTAAAGTGTATGTCCAATGGGATAGGATACTT
289907
289908
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AATGCTTTGCGAAATGCTAAACATTAACTTATATG
289979
289980
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAAAAGATTAATATTACAATCTTCAAAAATTGATA
290051
290052
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTTGTGACAGCCCTACCGATATGACCTTATACAA
290122
290123
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTTATGCTCCTGAAGGCGTGTTGTTTGTGGATGA
290193
290194
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCAAAAAGATACGGGAACTTACAGAAAACAAATC
290265
290266
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GCTAGCCTCAGCGTAAAACACCTTAATATCCTCG
290336
290337
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAATAATTAAGAAACAAAAATAATCCATAAAAAAT
290409
290410
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTACAAGCCAATGCCCATGAGATTCTTCAAAGA
290479
290480
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAAGCAAATTCTAAAAGATAAATTTGATTTTTAT
290550
290551
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AATACTAAGTTTGCTATGGCATCTTGCCTTATCAG
290622
290623
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCTGTAAGGACAGATTTATTACCTTTGCAAGATAA
290694
290695
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTAAAAC
ATAATAAGCGCCACCTTCGTATACCTGCCCTTTTTGGGAGA
290772
290773
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TATCAAAAATATTTCATTTGAAGAACCTTTCAAA
290843
290844
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GAATAGATTCAACATATAATCCATCCAAAACTTT
290914
290915
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGATAAGTCTTTTCGATAACATTTTTTCTTACTAAA
290987
290988
GTTGAAATCAACTTAAATCCCTATCAGGGATTGAAAT
291024
Left flanking sequence : Till position 286960 (length
bp)
ATTCCGACCCTTCTCATTTCAACTTTCACGTGCTATGATTAACCCATCCGTGAAACCGAACCTTGAAAAC
CTCATATTGAAAGGCTTTCAGATGCCCACA
Right flanking sequence : From position 291024 (length
bp)
AATATCATTTTTTAAACTCTTTTCTAGTACTTCACCACATTAAATATCAGGAGAGATTAATTGGTAGGTA
GTTGGACTATCTTCCCTATCCTATCTACAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp