Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019682_14                                                                                                                 top


Strain : Calothrix sp. PCC 7507 RefSeq :NC_019682 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019682_14
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACNumber of repetitions :18
Begin Position : 3375025 End Position : 3376306

3375025TTTTCAATCCTTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACCTGAATTTGAAAAGTCTCTCAAAGAAGATGAGGGATCTA 3375100
3375101GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACAATAATTGGCAAAGCCTCATCTTTGACGGGCAA 3375170
3375171GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACTTTTACTGAAGAGGCTGAACGTGGCTTCACTGATGTG 3375244
3375245GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACTCGCATGTGATCTCCAAGCTCTTTTTCACTGGCTA 3375316
3375317GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACATATACTCGTATGCTTCTTCTCTGCTTTCGTACTTGGCT 3375392
3375393GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACAAGTTTCACGGTTTATTTTGCGGGTTGATATGGA 3375463
3375464GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACTTAGCTAATCTGTCCCTTGATTTCTCTGAGGAAGAA 3375536
3375537GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACTTGGCATCAACTTAGTTTGTTGAGTGCAAAATCTT 3375608
3375609GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACACGGCAGCATCAAAAGCGATCGCCAAAATGAAGGGCAAGGCTG 3375688
3375689GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACTCAAGCGAATAACATTACCATTGTGTTTGTCAAAT 3375760
3375761GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACAAGGTGTTGATCCTATCTCTATATAATCTGTAAAT 3375832
3375833GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACGCTGTCCATTGCCATTAGTTAAGCAATATGCTGC 3375903
3375904GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACAAGATTTACAGTCTGTGGGCGATCGCCCGGAAAA 3375974
3375975GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACCTTGCCTTTTTCTATTTTTAGAGGAGGGGTAGCGATTT 3376049
3376050GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACCCAAGGTCTGACAGGAAATTAAAAAGATTGCCAA 3376120
3376121GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACCTGGCTTCTGTACACAGCAGCAAGTCATTGTCTAC 3376192
3376193GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAACGGTGCTGCTATACTTGGTTGGTAAGCAGGTAGTCCGTAGT 3376269
3376270GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTAAGTTAATTGGAAC3376306
Left flanking sequence : Till position 3375025 (length bp)
TCCTCGGTTGTTGTTGTCTGGTCTATGAGGATTTTGCGAGCTGTTTCGTAATTCATTCACCCAGCTTACC
TTAAATTGTGCATCAGTAGTAATACTGAGG
Right flanking sequence : From position 3376306 (length bp)
GCCCGCATCCAGAAGGCTTGATGTATTTGGTTTTCAAGGTTCAATGGTGTCAACCTAGGAATAAGGTAGC
TTTTCAGGTGCTGGTTTGTCAAGATAGGAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp