CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019684_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019684_1                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. PCC 7524
RefSeq :
NC_019684 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019684_1
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
Number of repetitions :
33
Begin Position :
996949
End Position :
999314
996949
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TTCCGTGTGGGTTCCCGTGGAAGGAACTATCACCTTA
997022
997023
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GCAAACATCGTATGGTGGACATCGGGATTTACGCTCA
997096
997097
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
AACATTATATACTACTAAAGTTCAGTACAGTATGA
997168
997169
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TACCACCTTTCGTCAAGCCATCCATAATTTAAA
997238
997239
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
CTTCTTACTTCGTTTCAACTGCTGGCAATATCTC
997309
997310
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
CCTATACTCGTCTGAGATAAAACTAGCCATTAATTAA
997383
997384
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
CATTAACTTTGGGGTCAATTCGGTATTTTTCATC
997454
997455
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
AATCAGCATCTCAGCCCTCATCTGTCCACTACTG
997525
997526
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TATTTACTGCTGTTGCTCAAGCTGCCCGTGTTTAC
997597
997598
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TACCGCATACTACATCTGCATGAGTGCCTCTACAA
997669
997670
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TTTACCTGATGCTGATTTGTTTGCTTCCCTAATAGGAATT
997746
997747
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GCCATTTACGCAGCTAGGCAGAGTTTGTACAGCAA
997818
997819
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GCCAAAGGTAAAGTAATGGTGTCTGCCATTGA
997887
997888
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GAAAAAATCAAATTCCAGTCAAGTACCTTTCGTTAC
997960
997961
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TGAAAAAGAGGGGAAAGGAGTGGACGATTTTATT
998031
998032
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
ACCCAACCTAAGCAATTATCTCTGTTTTAGCC
998100
998101
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
AAGGGTGAGCAGTTATGCGATCGCTCAAGGGTACAAAAAT
998177
998178
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
CGAACCCAAAAACACGACGCAAGGCAGGCCAGACCCCAG
998253
998254
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
AAGCGATCGCCTGAGTGCGATCGCTCTAAATTA
998323
998324
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TAGCCCATAAAACGGGCATATTGAGCAATTTTATT
998395
998396
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GGAGTGTCAAAGTTGTGTAAAAGTTCAAGCTCTC
998466
998467
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GTGAGGGAATTATTGGTAATGACAATGATTTTTT
998537
998538
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TAGGGATTAGCTAGGGGTGACAACCATAGAAGTGAT
998610
998611
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TGAAACCCCCGATGGGGTTGGTACTGCTGGAGGGAAAAGT
998687
998688
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
AAAATCGGAACTGTCAGAAATTGTAATAGATTCTA
998759
998760
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
AATACTAATAATATTATTAAGACTAGAAAAAATATTGCT
998835
998836
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TTGGGGTTTTTCCCTGTCAACGGTTGAAAAATTTC
998907
998908
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GTGTAATTCTCACGGGGTTAACAAAGGTACTAAA
998978
998979
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GTTATCTTTTGCGGTCAAATTGTTAGCTAAAAATCTT
999052
999053
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
TTTACTGATGCAATAGGGCGATCGCTACCCACACCTA
999126
999127
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
GATCATCATCCTAATCAGATCATGGCTAAATCCCGT
999199
999200
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
CTGAAACACCTTCTGGCTATACTTTCACACTACCCATACAA
999277
999278
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGTGAAATTGCAAT
999314
Left flanking sequence : Till position 996949 (length
bp)
TAAGGGGGATTTAGGGGGATCTAAAAGTATTGGAGACACCATTAGGGACTTTTCAAATATCCTCTAAATT
GCCGATAAATTTGTCGGCGAGTTCTTCTAC
Right flanking sequence : From position 999314 (length
bp)
CGCGATCGCCTGAAAGCTAATCTGTATTTGATTTTCAAGGTTCAGTTTCGCGGATGGGTAGATTATAACA
TGGTGACACATCAGTTGATTTAACAAAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp