CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019689_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019689_3                                                                                                                 
top
Strain :
Pleurocapsa sp. PCC 7327
RefSeq :
NC_019689 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019689_3
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
Number of repetitions :
42
Begin Position :
1226682
End Position :
1229689
1226682
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TCTTCCTGCGAATCCTCCTATGATATTAAAAGATTT
1226754
1226755
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
GACCTGCCAAGTGTTTCCAAGTATTTTTCTTCGCTCTGT
1226830
1226831
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
AGGGGATTGATGAGGTACTGAGTAAGCTTAAGGA
1226901
1226902
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
ATCATGATTCCGTAGGGTATGTTTGCTTAGTTTTC
1226973
1226974
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TCGCAGCCGTGGATTAAATCGGGAGATGTCCATAA
1227045
1227046
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TCGGGTGGGCCAAAGAATATTCGAGAATGGAGGCCTGCTT
1227122
1227123
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
GGGCGATTCCTGCGAGTCCTTTTGCTTCTTGGGCTTCTCG
1227199
1227200
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CCAGGCTTGTTTGTCGTTGTACAAGTCAGGT
1227267
1227268
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
ATGAAGAAATGAAACGCCTGATCAGGCAAATCGACCAAAC
1227344
1227345
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
GTACAAACGTTCGTCCGCAACGGGTTACACCTT
1227414
1227415
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CTTTGATGAAAGCTATTCTAGTGAAACTGGAAT
1227484
1227485
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TTTTTTCGGGAAGATTTACTACGAAAATCTTCCCG
1227556
1227557
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAC
CAAATCGGCTATTTGACGCTCTGATTTTTTGTCC
1227627
1227628
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TGATCTAACTAGTGCTAGAGGTGCATTGAGAACGG
1227699
1227700
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TCCCACATCCGCCTCAAGAAGGAGGTGATCGGTGA
1227771
1227772
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
ATTGGAGTCGCCGATCGTTACTTTGTTTTTTTC
1227841
1227842
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TTAGGAAATATCTAAAAAAATGTCCCTCGAACGCATCCT
1227917
1227918
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TTAGGAAATATCTAAAAAAATGTCCCTCGAACGCATCCT
1227993
1227994
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CTTACCAAGCTTTTGGCTATACGGGGGTTTGGGA
1228064
1228065
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TTATAGGTTTTATTTTTATTAAAATTCTTCCTTAA
1228136
1228137
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CGAGACGAAAATATTCCTGTCAAAAATCAAGCC
1228206
1228207
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TCTTACACGGTAGCGTCCAACCAAGCGCGGCTTATCC
1228280
1228281
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
GGTAGGAAGATTTTCGTAGAAATCTTTCTAGCCGA
1228352
1228353
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CGGGAGAGTTACTGGAATGGAAAAAAGCGCAGT
1228422
1228423
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
GCGAAAGCCTCTCCCAATCGGCATCCTGTCAGA
1228492
1228493
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CTAGAAGCAAACGGGATGCCTTGGACTATAAAATTT
1228565
1228566
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CTAGAAGCAAACGGGATGCCTTGGACTATAAAATTT
1228638
1228639
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TTGGCAGGAATCAATGTTCCCACCAGCCAAAAGG
1228709
1228710
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TCAACAGCTCGACGAACAGAAAAAAGAATTTGAGCGA
1228783
1228784
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CGGGAAGGATGCTGAAGTGGATGAAGAAACAAG
1228853
1228854
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TTTTGGAATCCAATGCGGAGGATATTATGGAAATCTG
1228927
1228928
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
ATAATGGGTGAGGCTCGTTCATGTAGAAGGGCACGAA
1229001
1229002
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
AATTCTTTTTCGACATTTCCCTTGTTTAAAAAATA
1229073
1229074
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TCTATTAGCTTAAGGTGGGTATACGAGCAATTCTC
1229145
1229146
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TACATTAGTACTATCCGAGCGCACGTAACTATTAA
1229217
1229218
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAG
ATAAATGGTTAGCCCGGCGATACTCGTACCCA
1229286
1229287
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
GAATCGCTAGTTACGCTTGCTCCAACGTTAATGTCA
1229359
1229360
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TGCTGAAGTTCCCAAATGGCTGCTCGATATTGAA
1229430
1229431
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
CCGTAATTAGGATGGGGAGGCGAGGGGTTTGCTT
1229501
1229502
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TTGAAAAATCATTTCAATTTCCTCAAAAATTAATA
1229573
1229574
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
TTGGTTCCCCTTCCCCGGTTGTTGGTTAAAAGCTTTTATCCT
1229652
1229653
GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAAGAATGTTTGGAAT
1229689
Left flanking sequence : Till position 1226682 (length
bp)
GAGACGCACAACAAAATTGCTGAGATTTTAGAGCGATTGACAAAACAAGAAGAAAGATAAGCTTCGCTTA
CATGGGGAAAATATACATATATGGTTAAAG
Right flanking sequence : From position 1229689 (length
bp)
ACCGATGTCCGAAAAGCTGACTATATTTAGTTTTCAAGGTACAGTTGCGCGAAACCTCTTTAAATTTAAC
ATAACCGTGACAAAAAATCCACCTGGAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp