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CRISPRs details
NC_019689_5
Flanking alignement tool
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NC_019689_5                                                                                                                 
top
Strain :
Pleurocapsa sp. PCC 7327
RefSeq :
NC_019689 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019689_5
DR consensus (36 bp) :
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
Number of repetitions :
49
Begin Position :
2419748
End Position :
2423389
2419748
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TCAAGGGCACGACCGGCGAGGCGCGGCTAGGCAAC
2419818
2419819
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GCCGGCCAGGGCCTCGGCCACGGTGCGCGCGGCCT
2419889
2419890
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
AAAACCCAGTTTTTGCGAGTTAACGGCTTGTAAAAAAG
2419963
2419964
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TAGGTCTGAGGCCTTGCGACAAGCACAATTAAAA
2420033
2420034
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TTGGTAAAAGGATTGACCGTTCCTGTGTTCACAAAGGTTGCAG
2420112
2420113
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CCTGAAAAAATAGGCGGATTTGTAGATACGCTTATTCC
2420186
2420187
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
AACATCCGCCGTCGGAGTTTACCTGCCCGTGCACCGAAGCC
2420263
2420264
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
ATAAACCCAGTTGAGATTGGCCGCCATGCGCACCTCGC
2420337
2420338
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GGTCGTCCTGCCAGTCTCCCGCCACCAGCGGCG
2420406
2420407
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CGGGCTTTGCCTGGAGCGCCCGGCGCAACACGGTGGT
2420479
2420480
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GTCAGGTCCACGACCCGAACCCCTCGCCTGTGCGTCA
2420552
2420553
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GACTGTTTGAGTATCAATGAGGACATTTTAAAACAAG
2420625
2420626
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
ACAAAATCACCAGCGAGCTGGAAACCCGCAATGCA
2420696
2420697
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GTCGAGTATTACGACGCGCTGGCCGCCAGCTTCCTCGGCGAA
2420774
2420775
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TATCTTTTTTGGATTGTAAATCTATATCAAGATTAA
2420846
2420847
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TTCCTCATCGGATTCCCCACGCACGTCTACTGTTTCAA
2420920
2420921
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
ATCTCTGGTTACCGGCAAGCGCTTGTTTATGCGGCAGTTGGCAA
2421000
2421001
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GGCTTACTTCAAGAAAGAGAACTCGGACCTCAGGCCACTTCAGA
2421080
2421081
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CAAAAAGGTTTGGCAGAACCTAAGTCAAGAACATCAGAATGC
2421158
2421159
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CGATAGAAGCGAGTTTCAGCCGAGGAACGCCGGGTG
2421230
2421231
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
AGCCGACCACTATAACGCGATGGTCATGTTCGTCAAACTACG
2421308
2421309
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GCCCGTGTAGAGCGAGGCTGCGTCGGTCTGCTCTT
2421379
2421380
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TTAGTGTAATAGCGCTCGATTTTAGTGATTGGCTTTTCAATTAT
2421459
2421460
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CACAATTCCAAAACATCAAAGCTAAGATAGAGACCGA
2421532
2421533
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CACTTTCACCATCGAATCCGGTGACACCCACCAGGGTTCCACC
2421611
2421612
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GACAACCCCCATATCTTCAAACTCGGACGGTTCAAAGTCCG
2421688
2421689
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TCAGCTCTCATAGCAGTGCTAAGCCCTTTAACTGCTTC
2421762
2421763
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
ATCTCCGATGCTACAAAAATTGCCAATCGTGCCGAAAGCAAA
2421840
2421841
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TTTCATCGCCCATGAAAACCACTATCGACTGGATGCGC
2421914
2421915
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
ATCGGTTTCCCCATTTCCAGCGTCAACAGTTGACCAAAG
2421989
2421990
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TCACCAATGCGGTCGGCATGGCACTCGCTGAAAAGCTACTCGCCG
2422070
2422071
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GTCGCGGGGCTTGCCGTCGCGATATTTCCAACTTGGC
2422143
2422144
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TCGCGAAGGTGAACGGCGCGCGCGGCGACGCGGCGGGGCTCGCCCGG
2422226
2422227
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
AGTATCCGGCTCACGCAACGAGAGCGCTCTTCATG
2422297
2422298
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CTATTTACTTACTTATATAAGTAAGTAATTAATTTATAT
2422372
2422373
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TTGATCGTCTTTATAGGCTGAATTGTTTTGCTCAGGCGTGTGTCCCAGCGATTG
2422462
2422463
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TGGGCGCGCAATGCCTCTGTATTGCAAAAGTTGCCTTAG
2422537
2422538
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CACAAGTTGGCCGAGTCGCAGAAAAAATCGGCGCGGA
2422610
2422611
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GATGGGCAACTGGGTCTTCGGGTGTGACATCTGCCAG
2422683
2422684
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
ACTCCAATGTGGTTTTTACCTCTTGTTCCACACTGG
2422755
2422756
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
CTGAGTTGCATGCAGAGCCATAAGGGCATCGAGCTGAG
2422829
2422830
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
ACCTGGTATCTTCGCAACCCTACTCGACACACCGTAGTTCTTTGTAA
2422912
2422913
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TTGGATAAAAATATTCGTTACCTTTTGCAGCTCCGCCAA
2422987
2422988
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
TAAACCACGTAAAATTATTTCCACCCAAGACAATTG
2423059
2423060
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
GTGGTAGCTCTAACATTACATGGATAATGGTTTGTATCCGCG
2423137
2423138
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
ACCTTCGGGTCAGGTGGGCTGGTTGAGCTTCTTAAGCC
2423211
2423212
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
AACCGAAGCCAGCTCTTGAGGTTCCATGCCAACAA
2423282
2423283
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
AACCGAAGCCAGCTCTTGAGGTTCCATGCCAACAA
2423353
2423354
CTCTCTATTTATTAGAGAAATTAGTTGAATGGAAAC
2423389
Left flanking sequence : Till position 2419748 (length
bp)
TTTAGAAGTTCTTTTTTGTCGAGCAGGTAACTCCCTAAGCGCGACCCCCTCGCGATTGCCCTCTGGACAC
TAGTTGGGATATAGGTTTCAATAAAGAAGA
Right flanking sequence : From position 2423389 (length
bp)
TCCACCAAGAATTTGGCTGATGAATTTAGCAGGGGATGAACAACAGCCCCATTCAATTAATTTCGGATAG
CTAATACAGAGAAGCTTGGGCCATTAGGAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp